RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449397.1

PDSS1P2-201, Transcript of decaprenyl diphosphate synthase subunit 1 pseudogene 2, humanhuman

BASIC

Gene PDSS1P2, Length 678 nt, Biotype unprocessed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDSS1P2-201ENST00000449397 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
PDSS1P2-201ENST00000449397 MAST4O15021 2626 aa4.55□□□□□ -1.68
PDSS1P2-201ENST00000449397 CFAP69A5D8W1 941 aa4.55□□□□□ -1.68
PDSS1P2-201ENST00000449397 LINC00473A8K010 186 aa4.55□□□□□ -1.68
PDSS1P2-201ENST00000449397 GOLIM4O00461 696 aa4.55□□□□□ -1.68
PDSS1P2-201ENST00000449397 STRNO43815 780 aa4.55□□□□□ -1.68
PDSS1P2-201ENST00000449397 URI1O94763 535 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
PDSS1P2-201ENST00000449397 ASNSP08243 561 aa4.55□□□□□ -1.68
PDSS1P2-201ENST00000449397 CLTBP09497 229 aa4.55□□□□□ -1.68
PDSS1P2-201ENST00000449397 FGFR2P21802 821 aa4.55□□□□□ -1.68
PDSS1P2-201ENST00000449397 PTH2RP49190 550 aa4.55□□□□□ -1.68
PDSS1P2-201ENST00000449397 DGKEP52429 567 aa4.55□□□□□ -1.68
PDSS1P2-201ENST00000449397 FAM193AP78312 1265 aa4.55□□□□□ -1.68
PDSS1P2-201ENST00000449397 MYO1EQ12965 1108 aa4.55□□□□□ -1.68
PDSS1P2-201ENST00000449397 SEMA5AQ13591 1074 aa4.55□□□□□ -1.68
PDSS1P2-201ENST00000449397 BMPR2Q13873 1038 aa4.55□□□□□ -1.68
PDSS1P2-201ENST00000449397 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
PDSS1P2-201ENST00000449397 TBCCQ15814 346 aa4.55□□□□□ -1.68
PDSS1P2-201ENST00000449397 CNGA2Q16280 664 aa4.55□□□□□ -1.68
PDSS1P2-201ENST00000449397 CCL14Q16627 93 aa4.55□□□□□ -1.68
PDSS1P2-201ENST00000449397 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
PDSS1P2-201ENST00000449397 TRIM60Q495X7 471 aa4.55□□□□□ -1.68
PDSS1P2-201ENST00000449397 ZNF618Q5T7W0 954 aa4.55□□□□□ -1.68
PDSS1P2-201ENST00000449397 FBXO42Q6P3S6 717 aa4.55□□□□□ -1.68
PDSS1P2-201ENST00000449397 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
PDSS1P2-201ENST00000449397 LAYNQ6UX15 382 aa4.55□□□□□ -1.68
PDSS1P2-201ENST00000449397 MAVSQ7Z434 540 aa4.55□□□□□ -1.68
PDSS1P2-201ENST00000449397 DGKHQ86XP1 1220 aa4.55□□□□□ -1.68
PDSS1P2-201ENST00000449397 ZNF280BQ86YH2 543 aa4.55□□□□□ -1.68
PDSS1P2-201ENST00000449397 CCDC146Q8IYE0 955 aa4.55□□□□□ -1.68
PDSS1P2-201ENST00000449397 TSPYL6Q8N831 410 aa4.55□□□□□ -1.68
PDSS1P2-201ENST00000449397 ATRIPQ8WXE1 791 aa4.55□□□□□ -1.68
PDSS1P2-201ENST00000449397 PPM1EQ8WY54 764 aa4.55□□□□□ -1.68
PDSS1P2-201ENST00000449397 ATG4AQ8WYN0 398 aa4.55□□□□□ -1.68
PDSS1P2-201ENST00000449397 SARAFQ96BY9 339 aa4.55□□□□□ -1.68
PDSS1P2-201ENST00000449397 MSLNLQ96KJ4 702 aa4.55□□□□□ -1.68
PDSS1P2-201ENST00000449397 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
PDSS1P2-201ENST00000449397 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
PDSS1P2-201ENST00000449397 KLK15Q9H2R5 256 aa4.55□□□□□ -1.68
PDSS1P2-201ENST00000449397 CXorf36Q9H7Y0 433 aa4.55□□□□□ -1.68
PDSS1P2-201ENST00000449397 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa4.55□□□□□ -1.68
PDSS1P2-201ENST00000449397 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
PDSS1P2-201ENST00000449397 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
PDSS1P2-201ENST00000449397 CPNE7Q9UBL6 633 aa4.55□□□□□ -1.68
PDSS1P2-201ENST00000449397 NRBP1Q9UHY1 535 aa4.55□□□□□ -1.68
PDSS1P2-201ENST00000449397 BRCA2P51587 3418 aa4.55□□□□□ -1.68
PDSS1P2-201ENST00000449397 CENPFP49454 3210 aa4.54□□□□□ -1.68
PDSS1P2-201ENST00000449397 GAKO14976 1311 aa4.54□□□□□ -1.68
PDSS1P2-201ENST00000449397 LAMA3Q16787 3333 aa4.54□□□□□ -1.68
PDSS1P2-201ENST00000449397 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
PDSS1P2-201ENST00000449397 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
PDSS1P2-201ENST00000449397 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
PDSS1P2-201ENST00000449397 PI4K2BG5E9Z4 385 aa4.54□□□□□ -1.68
PDSS1P2-201ENST00000449397 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
PDSS1P2-201ENST00000449397 SMIM22K7EJ46 135 aa4.54□□□□□ -1.68
PDSS1P2-201ENST00000449397 OVOL3O00110 214 aa4.54□□□□□ -1.68
PDSS1P2-201ENST00000449397 MYO1CO00159 1063 aa4.54□□□□□ -1.68
PDSS1P2-201ENST00000449397 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
PDSS1P2-201ENST00000449397 SEPT4O43236 478 aa4.54□□□□□ -1.68
PDSS1P2-201ENST00000449397 ORC4O43929 436 aa4.54□□□□□ -1.68
PDSS1P2-201ENST00000449397 MARCH6O60337 910 aa4.54□□□□□ -1.68
PDSS1P2-201ENST00000449397 TLR5O60602 858 aa4.54□□□□□ -1.68
PDSS1P2-201ENST00000449397 NXPH3O95157 252 aa4.54□□□□□ -1.68
PDSS1P2-201ENST00000449397 IGLV2-14P01704 120 aa4.54□□□□□ -1.68
PDSS1P2-201ENST00000449397 LDHCP07864 332 aa4.54□□□□□ -1.68
PDSS1P2-201ENST00000449397 PDHA1P08559 390 aa4.54□□□□□ -1.68
PDSS1P2-201ENST00000449397 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
PDSS1P2-201ENST00000449397 MYF5P13349 255 aa4.54□□□□□ -1.68
PDSS1P2-201ENST00000449397 CYBAP13498 195 aa4.54□□□□□ -1.68
PDSS1P2-201ENST00000449397 SLC5A1P13866 664 aa4.54□□□□□ -1.68
PDSS1P2-201ENST00000449397 JUPP14923 745 aa4.54□□□□□ -1.68
PDSS1P2-201ENST00000449397 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
PDSS1P2-201ENST00000449397 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
PDSS1P2-201ENST00000449397 ELLP55199 621 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
PDSS1P2-201ENST00000449397 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
PDSS1P2-201ENST00000449397 FMO1Q01740 532 aa4.54□□□□□ -1.68
PDSS1P2-201ENST00000449397 SP2Q02086 613 aa4.54□□□□□ -1.68
PDSS1P2-201ENST00000449397 TLE2Q04725 743 aa4.54□□□□□ -1.68
PDSS1P2-201ENST00000449397 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP4.54□□□□□ -1.68
PDSS1P2-201ENST00000449397 RAB32Q13637 225 aa4.54□□□□□ -1.68
PDSS1P2-201ENST00000449397 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
PDSS1P2-201ENST00000449397 EPHA10Q5JZY3 1008 aa4.54□□□□□ -1.68
PDSS1P2-201ENST00000449397 ARHGAP40Q5TG30 622 aa4.54□□□□□ -1.68
PDSS1P2-201ENST00000449397 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
PDSS1P2-201ENST00000449397 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa4.54□□□□□ -1.68
PDSS1P2-201ENST00000449397 G2E3Q7L622 706 aa4.54□□□□□ -1.68
PDSS1P2-201ENST00000449397 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
PDSS1P2-201ENST00000449397 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa4.54□□□□□ -1.68
PDSS1P2-201ENST00000449397 ZNF575Q86XF7 245 aa4.54□□□□□ -1.68
PDSS1P2-201ENST00000449397 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
PDSS1P2-201ENST00000449397 KRT78Q8N1N4 520 aa4.54□□□□□ -1.68
PDSS1P2-201ENST00000449397 VGLL2Q8N8G2 317 aa4.54□□□□□ -1.68
PDSS1P2-201ENST00000449397 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
PDSS1P2-201ENST00000449397 OR56A3Q8NH54 315 aa4.54□□□□□ -1.68
PDSS1P2-201ENST00000449397 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
PDSS1P2-201ENST00000449397 C8orf48Q96LL4 319 aa4.54□□□□□ -1.68
PDSS1P2-201ENST00000449397 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
PDSS1P2-201ENST00000449397 EPHX3Q9H6B9 360 aa4.54□□□□□ -1.68
PDSS1P2-201ENST00000449397 SLC28A3Q9HAS3 691 aa4.54□□□□□ -1.68
PDSS1P2-201ENST00000449397 TXNRD2Q9NNW7 524 aa4.54□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.7 ms