RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444040.6

SHQ1-202, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 2

Gene SHQ1, Length 2,844 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SHQ1-202ENST00000444040 RARBP10826 455 aa16.46■□□□□ 0.23
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SHQ1-202ENST00000444040 SEPT10Q9P0V9 454 aa16.46■□□□□ 0.22
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SHQ1-202ENST00000444040 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
SHQ1-202ENST00000444040 FAM163BP0C2L3 166 aa16.45■□□□□ 0.22
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SHQ1-202ENST00000444040 C16orf46Q6P387 395 aa16.45■□□□□ 0.22
SHQ1-202ENST00000444040 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa16.45■□□□□ 0.22
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SHQ1-202ENST00000444040 MAP3K7CLP57077 242 aa16.45■□□□□ 0.22
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SHQ1-202ENST00000444040 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
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SHQ1-202ENST00000444040 SYT17Q9BSW7 474 aa16.44■□□□□ 0.22
SHQ1-202ENST00000444040 ULBP1Q9BZM6 244 aa16.44■□□□□ 0.22
SHQ1-202ENST00000444040 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
SHQ1-202ENST00000444040 YJEFN3A6XGL0 299 aa16.43■□□□□ 0.22
SHQ1-202ENST00000444040 KCNK1O00180 336 aa16.43■□□□□ 0.22
SHQ1-202ENST00000444040 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP16.43■□□□□ 0.22
SHQ1-202ENST00000444040 ERCC2P18074 760 aa16.43■□□□□ 0.22
SHQ1-202ENST00000444040 DAOAP59103 153 aa16.43■□□□□ 0.22
SHQ1-202ENST00000444040 OLIG2Q13516 323 aa16.43■□□□□ 0.22
SHQ1-202ENST00000444040 PID1Q7Z2X4 250 aa16.43■□□□□ 0.22
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