RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437840.6

RGL2-238, Transcript of ral guanine nucleotide dissociation stimulator like 2, human

TSL 1 (best)

Gene RGL2, Length 2,687 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RGL2-238	ENST00000437840	PDE5A	O76074	875 aa		15.19	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	ITGAX	P20702	1163 aa		15.19	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	LIN52	Q52LA3	116 aa		15.19	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	PPM1J	Q5JR12	505 aa		15.19	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	PDPK2P	Q6A1A2	396 aa		15.19	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	CASC4	Q6P4E1	433 aa		15.19	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	ACOT1	Q86TX2	421 aa		15.19	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	RSPH3	Q86UC2	560 aa		15.19	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	RASSF3	Q86WH2	238 aa		15.19	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	ARHGAP18	Q8N392	663 aa		15.19	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	ZNF513	Q8N8E2	541 aa	Predicted RBP	15.19	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		15.19	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	MRPL45	Q9BRJ2	306 aa	Known RBP	15.19	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	RNPEP	Q9H4A4	650 aa		15.19	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	SMARCAD1	Q9H4L7	1026 aa		15.19	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	EIF2B3	Q9NR50	452 aa	Known RBP	15.19	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	POMP	Q9Y244	141 aa		15.19	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	UTRN	P46939	3433 aa		15.19	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840		A0A087WZ62	844 aa		15.19	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	PGAM1	P18669	254 aa		15.19	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	MGAT1	P26572	445 aa		15.19	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	GSTT1	P30711	240 aa		15.19	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	EPHB1	P54762	984 aa		15.19	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	ABCE1	P61221	599 aa	Known RBP	15.19	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	XIAP	P98170	497 aa		15.19	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	LAMB3	Q13751	1172 aa		15.19	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	GRM2	Q14416	872 aa		15.19	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	CNPY1	Q3B7I2	92 aa		15.19	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	VWA5B1	Q5TIE3	1220 aa		15.19	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	LPCAT4	Q643R3	524 aa		15.19	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	SLC26A9	Q7LBE3	791 aa		15.19	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	TRIM74	Q86UV6	250 aa		15.19	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	TRIM73	Q86UV7	250 aa		15.19	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	CCDC185	Q8N715	623 aa		15.19	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	SLC26A7	Q8TE54	656 aa		15.19	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	PPP4R1	Q8TF05	950 aa		15.19	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	CLEC4C	Q8WTT0	213 aa		15.19	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	CMTM5	Q96DZ9	223 aa		15.19	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	FDXACB1	Q9BRP7	624 aa	Predicted RBP	15.19	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	FAM49B	Q9NUQ9	324 aa		15.19	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	SF3B1	O75533	1304 aa	Known RBP eCLIP	15.18	■□□□□ 0.02	1e-6	■■■■■ 121.8
RGL2-238	ENST00000437840		A0A1B0GVG6	124 aa		15.18	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	HACD1	B0YJ81	288 aa		15.18	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	RALB	P11234	206 aa		15.18	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	UQCRB	P14927	111 aa		15.18	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	DES	P17661	470 aa		15.18	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	DEUP1	Q05D60	604 aa		15.18	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	FRMD7	Q6ZUT3	714 aa		15.18	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	HACE1	Q8IYU2	909 aa		15.18	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	PHTF2	Q8N3S3	785 aa		15.18	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	LINC01465	Q8N7H1	131 aa		15.18	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	COLGALT1	Q8NBJ5	622 aa		15.18	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	DDX55	Q8NHQ9	600 aa	Known RBP eCLIP	15.18	■□□□□ 0.02	5e-6	■□□□□ 8.7
RGL2-238	ENST00000437840	COPS5	Q92905	334 aa		15.18	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	ISL2	Q96A47	359 aa		15.18	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		15.18	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	LGMN	Q99538	433 aa		15.18	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	KLHL4	Q9C0H6	718 aa		15.18	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	PIH1D1	Q9NWS0	290 aa	Known RBP	15.18	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	LMCD1	Q9NZU5	365 aa		15.18	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840		F5H423	210 aa	Predicted RBP	15.18	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	CASQ2	O14958	399 aa	Predicted RBP	15.18	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	PEX2	P28328	305 aa		15.18	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	GMPR	P36959	345 aa		15.18	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	MAGEA12	P43365	314 aa		15.18	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	SESN2	P58004	480 aa	Predicted RBP	15.18	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	SOWAHA	Q2M3V2	549 aa		15.18	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	APOBEC3F	Q8IUX4	373 aa	Known RBP	15.18	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	SHCBP1L	Q9BZQ2	653 aa		15.18	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	PIM2	Q9P1W9	311 aa		15.18	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	EVPL	Q92817	2033 aa		15.17	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840		H3BNX3	289 aa		15.17	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	GOT1	P17174	413 aa		15.17	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	AQP4	P55087	323 aa		15.17	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	KYAT1	Q16773	422 aa		15.17	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	LRRC36	Q1X8D7	754 aa		15.17	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	KBTBD6	Q86V97	674 aa		15.17	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	NT5DC4	Q86YG4	428 aa		15.17	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	HPS6	Q86YV9	775 aa		15.17	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	DEFB107A	Q8IZN7	70 aa		15.17	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	EZH1	Q92800	747 aa	Predicted RBP	15.17	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	CYP4F11	Q9HBI6	524 aa		15.17	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	ZNF358	Q9NW07	568 aa		15.17	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	ZBTB14	O43829	449 aa		15.17	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	PRDX6	P30041	224 aa		15.17	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	MTTP	P55157	894 aa		15.17	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	MED21	Q13503	144 aa		15.17	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	ITGA9	Q13797	1035 aa		15.17	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	PYROXD2	Q8N2H3	581 aa		15.17	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	FBXW8	Q8N3Y1	598 aa		15.17	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	B4GALNT2	Q8NHY0	566 aa		15.17	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	GDPD5	Q8WTR4	605 aa		15.17	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	CCDC124	Q96CT7	223 aa	Known RBP	15.17	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	NAT9	Q9BTE0	207 aa		15.17	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	VCX3B	Q9H321	246 aa		15.17	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	DMAP1	Q9NPF5	467 aa	Predicted RBP	15.17	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	SYBU	Q9NX95	663 aa		15.17	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	GGA3	Q9NZ52	723 aa		15.17	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	PCDHB12	Q9Y5F1	795 aa		15.17	■□□□□ 0.02
RGL2-238	ENST00000437840	GJA3	Q9Y6H8	435 aa		15.17	■□□□□ 0.02

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