RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429738.1

MRPL28-203, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L28, human

TSL 2 BASIC

Gene MRPL28, Length 310 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL28-203	ENST00000429738	SCUBE3	Q8IX30	993 aa		18.44	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	DQX1	Q8TE96	717 aa	Known RBP	18.44	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	GOLGA1	Q92805	767 aa		18.44	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC39A13	Q96H72	371 aa		18.44	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	MKRN2	Q9H000	416 aa	Known RBP	18.44	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	CYP8B1	Q9UNU6	501 aa		18.44	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	FREM2	Q5SZK8	3169 aa		18.44	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	IRAK2	O43187	625 aa		18.43	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	PAPSS1	O43252	624 aa	Predicted RBP	18.43	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	SH3BP5	O60239	455 aa		18.43	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	ACSL4	O60488	711 aa		18.43	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	GJB3	O75712	270 aa		18.43	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	C7	P10643	843 aa		18.43	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	PON1	P27169	355 aa		18.43	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC6A4	P31645	630 aa		18.43	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	APBA1	Q02410	837 aa		18.43	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	STARD3	Q14849	445 aa		18.43	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	EXOC3L4	Q17RC7	722 aa		18.43	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	WFIKKN2	Q8TEU8	576 aa		18.43	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	SORCS1	Q8WY21	1168 aa		18.43	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	SHC3	Q92529	594 aa		18.43	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	FCRL2	Q96LA5	508 aa	Predicted RBP	18.43	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	HSPA12B	Q96MM6	686 aa		18.43	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	CAMK1G	Q96NX5	476 aa		18.43	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	SERPINB11	Q96P15	392 aa		18.43	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	CIPC	Q9C0C6	399 aa		18.43	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	ST7	Q9NRC1	585 aa		18.43	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	USP36	Q9P275	1121 aa	Known RBP	18.43	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	NAALADL1	Q9UQQ1	740 aa		18.43	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	PCDHB9	Q9Y5E1	797 aa		18.43	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	ADAMTS20	P59510	1910 aa		18.43	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	KNL1	Q8NG31	2342 aa		18.43	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738		E5RJQ4	531 aa		18.42	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	THAP12	O43422	761 aa		18.42	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	PRKCH	P24723	683 aa		18.42	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC11A2	P49281	568 aa		18.42	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	COPA	P53621	1224 aa		18.42	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	SCAP	Q12770	1279 aa		18.42	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	PLEKHG6	Q3KR16	790 aa		18.42	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	SYCP2L	Q5T4T6	812 aa		18.42	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	NADSYN1	Q6IA69	706 aa		18.42	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	RFWD3	Q6PCD5	774 aa		18.42	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	ADIPOR2	Q86V24	386 aa		18.42	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	CREBRF	Q8IUR6	639 aa		18.42	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	RGL4	Q8IZJ4	473 aa		18.42	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	WFDC5	Q8TCV5	224 aa		18.42	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	ADAMTS14	Q8WXS8	1223 aa		18.42	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	LMLN	Q96KR4	655 aa		18.42	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	TMEM245	Q9H330	911 aa		18.42	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	THAP9	Q9H5L6	903 aa		18.42	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	PRDM16	Q9HAZ2	1276 aa		18.42	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	SIX2	Q9NPC8	291 aa		18.42	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	ITM2C	Q9NQX7	267 aa		18.42	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	SUSD2	Q9UGT4	822 aa		18.42	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	GGA2	Q9UJY4	613 aa		18.42	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	TLR6	Q9Y2C9	796 aa		18.42	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	ITPR1	Q14643	2758 aa		18.42	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	APC2	O95996	2303 aa		18.41	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	GOLGA6L7	A0A1B0GV03	622 aa		18.41	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	NDUFS2	O75306	463 aa		18.41	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	IGLV3-25	P01717	112 aa		18.41	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	PABPC1	P11940	636 aa	Known RBP	18.41	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	GNS	P15586	552 aa		18.41	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	PDCL	Q13371	301 aa		18.41	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	EIF4EBP2	Q13542	120 aa	Predicted RBP	18.41	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	MAN2A1	Q16706	1144 aa		18.41	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	ARHGAP44	Q17R89	818 aa		18.41	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	DPCR1	Q3MIW9	517 aa		18.41	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	SYPL2	Q5VXT5	272 aa		18.41	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	DPY19L2P1	Q6NXN4	242 aa		18.41	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	KIAA1324	Q6UXG2	1013 aa	Known RBP	18.41	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	CLEC17A	Q6ZS10	378 aa		18.41	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	CHST9	Q7L1S5	443 aa		18.41	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	AHI1	Q8N157	1196 aa		18.41	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	WDTC1	Q8N5D0	677 aa		18.41	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	FOXJ1	Q92949	421 aa		18.41	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	FAM149B1	Q96BN6	582 aa		18.41	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	PRICKLE1	Q96MT3	831 aa	Predicted RBP	18.41	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	ABCB8	Q9NUT2	735 aa		18.41	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	WSB2	Q9NYS7	404 aa	Predicted RBP	18.41	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	AJAP1	Q9UKB5	411 aa	Predicted RBP	18.41	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	GPSM3	Q9Y4H4	160 aa		18.41	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	SYNCRIP	O60506	623 aa	Known RBP	18.4	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	TBL1X	O60907	577 aa		18.4	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	IGLV3-19	P01714	112 aa		18.4	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	FTH1P19	P0C7X4	201 aa		18.4	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	ERCC5	P28715	1186 aa	Predicted RBP	18.4	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	CD6	P30203	668 aa		18.4	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	MTIF2	P46199	727 aa	Known RBP	18.4	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	CAMK2G	Q13555	558 aa	Predicted RBP	18.4	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	PTPRN	Q16849	979 aa		18.4	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	WDR45B	Q5MNZ6	344 aa		18.4	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	SERPINA13P	Q6UXR4	307 aa		18.4	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	CCNI2	Q6ZMN8	369 aa	Predicted RBP	18.4	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	TAC4	Q86UU9	113 aa		18.4	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	TMPRSS6	Q8IU80	811 aa		18.4	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	MYEOV	Q96EZ4	313 aa		18.4	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	TRIM62	Q9BVG3	475 aa		18.4	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	ZDHHC5	Q9C0B5	715 aa		18.4	■□□□□ 0.54
MRPL28-203	ENST00000429738	POPDC2	Q9HBU9	364 aa		18.4	■□□□□ 0.54

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