RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429504.6

CERS1-201, Transcript of ceramide synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CERS1, Length 2,094 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CERS1-201ENST00000429504 IFNL1Q8IU54 200 aa28.43■■■□□ 2.14
CERS1-201ENST00000429504 LPPQ93052 612 aa28.43■■■□□ 2.14
CERS1-201ENST00000429504 TMEM30AQ9NV96 361 aa28.43■■■□□ 2.14
CERS1-201ENST00000429504 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP28.43■■■□□ 2.14
CERS1-201ENST00000429504 LTFP02788 710 aa28.42■■■□□ 2.14
CERS1-201ENST00000429504 MROH9Q5TGP6 573 aa28.42■■■□□ 2.14
CERS1-201ENST00000429504 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP28.42■■■□□ 2.14
CERS1-201ENST00000429504 SERINC5Q86VE9 423 aa28.42■■■□□ 2.14
CERS1-201ENST00000429504 ARNTL2Q8WYA1 636 aa28.42■■■□□ 2.14
CERS1-201ENST00000429504 SEPT10Q9P0V9 454 aa28.42■■■□□ 2.14
CERS1-201ENST00000429504 HAO1Q9UJM8 370 aa28.42■■■□□ 2.14
CERS1-201ENST00000429504 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP28.42■■■□□ 2.14
CERS1-201ENST00000429504 A0A0G2JND7 137 aa28.42■■■□□ 2.14
CERS1-201ENST00000429504 HHLA1C9JL84 531 aa28.42■■■□□ 2.14
CERS1-201ENST00000429504 F5H423 210 aaPredicted RBP28.42■■■□□ 2.14
CERS1-201ENST00000429504 FAM72CH0Y354 149 aa28.42■■■□□ 2.14
CERS1-201ENST00000429504 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP28.42■■■□□ 2.14
CERS1-201ENST00000429504 NCAM2O15394 837 aa28.42■■■□□ 2.14
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CERS1-201ENST00000429504 ERCC2P18074 760 aa28.42■■■□□ 2.14
CERS1-201ENST00000429504 FAM72AQ5TYM5 149 aa28.42■■■□□ 2.14
CERS1-201ENST00000429504 FAM72DQ6L9T8 149 aa28.42■■■□□ 2.14
CERS1-201ENST00000429504 CXCL17Q6UXB2 119 aa28.42■■■□□ 2.14
CERS1-201ENST00000429504 AGMOQ6ZNB7 445 aa28.42■■■□□ 2.14
CERS1-201ENST00000429504 RPAINQ86UA6 219 aa28.42■■■□□ 2.14
CERS1-201ENST00000429504 FAM72BQ86X60 149 aa28.42■■■□□ 2.14
CERS1-201ENST00000429504 NETO2Q8NC67 525 aa28.42■■■□□ 2.14
CERS1-201ENST00000429504 CDKL2Q92772 493 aa28.42■■■□□ 2.14
CERS1-201ENST00000429504 SLC13A1Q9BZW2 595 aa28.42■■■□□ 2.14
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CERS1-201ENST00000429504 STK38LQ9Y2H1 464 aa28.42■■■□□ 2.14
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CERS1-201ENST00000429504 USP17L7P0C7H9 530 aa28.41■■■□□ 2.14
CERS1-201ENST00000429504 SCNN1GP51170 649 aa28.41■■■□□ 2.14
CERS1-201ENST00000429504 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP28.41■■■□□ 2.14
CERS1-201ENST00000429504 CACNA2D1P54289 1103 aa28.41■■■□□ 2.14
CERS1-201ENST00000429504 TPI1P60174 286 aa28.41■■■□□ 2.14
CERS1-201ENST00000429504 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP28.41■■■□□ 2.14
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CERS1-201ENST00000429504 ADAM32Q8TC27 787 aa28.41■■■□□ 2.14
CERS1-201ENST00000429504 CEP41Q9BYV8 373 aa28.41■■■□□ 2.14
CERS1-201ENST00000429504 KCNK13Q9HB14 408 aa28.41■■■□□ 2.14
CERS1-201ENST00000429504 ANLNQ9NQW6 1124 aa28.41■■■□□ 2.14
CERS1-201ENST00000429504 PCMTD2Q9NV79 361 aa28.41■■■□□ 2.14
CERS1-201ENST00000429504 NUP205Q92621 2012 aa28.41■■■□□ 2.14
CERS1-201ENST00000429504 I6L893 689 aaPredicted RBP28.41■■■□□ 2.14
CERS1-201ENST00000429504 GPR182O15218 404 aa28.41■■■□□ 2.14
CERS1-201ENST00000429504 F9P00740 461 aa28.41■■■□□ 2.14
CERS1-201ENST00000429504 MGAT1P26572 445 aa28.41■■■□□ 2.14
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CERS1-201ENST00000429504 ARFIP2P53365 341 aa28.41■■■□□ 2.14
CERS1-201ENST00000429504 CRYMQ14894 314 aa28.41■■■□□ 2.14
CERS1-201ENST00000429504 CTC1Q2NKJ3 1217 aa28.41■■■□□ 2.14
CERS1-201ENST00000429504 ARL13BQ3SXY8 428 aa28.41■■■□□ 2.14
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CERS1-201ENST00000429504 C7orf26Q96N11 449 aa28.41■■■□□ 2.14
CERS1-201ENST00000429504 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa28.41■■■□□ 2.14
CERS1-201ENST00000429504 DDIT4Q9NX09 232 aa28.41■■■□□ 2.14
CERS1-201ENST00000429504 SHROOM3Q8TF72 1996 aa28.41■■■□□ 2.14
CERS1-201ENST00000429504 I3L4J1 428 aa28.4■■■□□ 2.14
CERS1-201ENST00000429504 RABGGTBP53611 331 aa28.4■■■□□ 2.14
CERS1-201ENST00000429504 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP28.4■■■□□ 2.14
CERS1-201ENST00000429504 CRADDP78560 199 aa28.4■■■□□ 2.14
CERS1-201ENST00000429504 MGAT3Q09327 533 aa28.4■■■□□ 2.14
CERS1-201ENST00000429504 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP28.4■■■□□ 2.14
CERS1-201ENST00000429504 ATG16L1Q676U5 607 aa28.4■■■□□ 2.14
CERS1-201ENST00000429504 BHLHA9Q7RTU4 235 aa28.4■■■□□ 2.14
CERS1-201ENST00000429504 ACMSDQ8TDX5 336 aa28.4■■■□□ 2.14
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CERS1-201ENST00000429504 PTPRDP23468 1912 aa28.4■■■□□ 2.14
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CERS1-201ENST00000429504 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP28.39■■■□□ 2.14
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CERS1-201ENST00000429504 COLEC11Q9BWP8 271 aa28.39■■■□□ 2.14
CERS1-201ENST00000429504 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP28.39■■■□□ 2.14
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CERS1-201ENST00000429504 BIRC5O15392 142 aa28.39■■■□□ 2.13
CERS1-201ENST00000429504 CBX6O95503 412 aa28.39■■■□□ 2.13
CERS1-201ENST00000429504 TIGD5Q53EQ6 642 aa28.39■■■□□ 2.13
CERS1-201ENST00000429504 STXBP5Q5T5C0 1151 aa28.39■■■□□ 2.13
CERS1-201ENST00000429504 ZNF449Q6P9G9 518 aa28.39■■■□□ 2.13
CERS1-201ENST00000429504 PID1Q7Z2X4 250 aa28.39■■■□□ 2.13
CERS1-201ENST00000429504 CEP57Q86XR8 500 aa28.39■■■□□ 2.13
CERS1-201ENST00000429504 TP53INP2Q8IXH6 220 aa28.39■■■□□ 2.13
CERS1-201ENST00000429504 IRGQQ8WZA9 623 aa28.39■■■□□ 2.13
CERS1-201ENST00000429504 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa28.39■■■□□ 2.13
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