RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424082.6

RALGPS1-208, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RALGPS1, Length 2,362 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-208ENST00000424082 PCDH18Q9HCL0 1135 aa18.85■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 LOC285556D6RIA3 1793 aa18.85■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP18.85■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 F5H423 210 aaPredicted RBP18.85■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 DENRO43583 198 aaKnown RBP18.85■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 KCNA4P22459 653 aa18.85■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 ADORA2AP29274 412 aa18.85■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 MAGEA6P43360 314 aa18.85■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 ALDH1A3P47895 512 aa18.85■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 RGS7P49802 495 aa18.85■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 IDH3AP50213 366 aa18.85■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 DEUP1Q05D60 604 aa18.85■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 DBN1Q16643 649 aa18.85■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 CCDC14Q49A88 953 aa18.85■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 SH2D4BQ5SQS7 431 aa18.85■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 ILDR2Q71H61 639 aa18.85■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 RSPH3Q86UC2 560 aa18.85■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa18.85■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 TGM2P21980 687 aa18.84■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP18.84■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 Q3C1V9 767 aa18.84■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 FAM160B1Q5W0V3 765 aa18.84■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 KLHDC10Q6PID8 442 aa18.84■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 ATG14Q6ZNE5 492 aa18.84■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 DNERQ8NFT8 737 aa18.84■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP18.84■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa18.84■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 LRRC39Q96DD0 335 aa18.84■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 CMTM5Q96DZ9 223 aa18.84■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP18.84■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 NR2E3Q9Y5X4 410 aa18.84■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP18.84■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 CLPTM1O96005 669 aa18.84■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 PGK2P07205 417 aa18.84■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 SERPINB9P50453 376 aa18.84■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 PEX6Q13608 980 aa18.84■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP18.84■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 PDPK2PQ6A1A2 396 aa18.84■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC9A4Q6AI14 798 aa18.84■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 JADE1Q6IE81 842 aa18.84■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 TIFABQ6ZNK6 161 aa18.84■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 TRIM74Q86UV6 250 aa18.84■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 TRIM73Q86UV7 250 aa18.84■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 METTL25Q8N6Q8 603 aa18.84■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 DCUN1D1Q96GG9 259 aa18.84■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP18.84■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 CDT1Q9H211 546 aa18.84■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 MINDY3Q9H8M7 445 aa18.84■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 PNPOQ9NVS9 261 aa18.84■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 DNAJC28Q9NX36 388 aa18.84■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 UBAP1Q9NZ09 502 aa18.84■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 EMCNQ9ULC0 261 aa18.84■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 A0A0G2JMZ2 1700 aa18.84■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 ZBTB42B2RXF5 422 aa18.83■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 BTBD19C9JJ37 291 aa18.83■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 ACKR2O00590 384 aa18.83■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 PMLP29590 882 aa18.83■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 SCNN1BP51168 640 aa18.83■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 CRADDP78560 199 aa18.83■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 PDK2Q15119 407 aa18.83■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 LY6KQ17RY6 165 aa18.83■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP18.83■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 C12orf29Q8N999 325 aa18.83■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 MCUQ8NE86 351 aa18.83■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP18.83■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 TSPAN16Q9UKR8 245 aa18.83■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 LZTS1Q9Y250 596 aa18.83■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 GMEB1Q9Y692 573 aa18.83■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 LACTBL1A8MY62 500 aa18.83■□□□□ 0.6
RALGPS1-208ENST00000424082 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP18.83■□□□□ 0.6
RALGPS1-208ENST00000424082 HPCAP84074 193 aa18.83■□□□□ 0.6
RALGPS1-208ENST00000424082 GBE1Q04446 702 aa18.83■□□□□ 0.6
RALGPS1-208ENST00000424082 NADK2Q4G0N4 442 aa18.83■□□□□ 0.6
RALGPS1-208ENST00000424082 STXBP5Q5T5C0 1151 aa18.83■□□□□ 0.6
RALGPS1-208ENST00000424082 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP18.83■□□□□ 0.6
RALGPS1-208ENST00000424082 FRMD7Q6ZUT3 714 aa18.83■□□□□ 0.6
RALGPS1-208ENST00000424082 MAGEB5Q9BZ81 275 aa18.83■□□□□ 0.6
RALGPS1-208ENST00000424082 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa18.83■□□□□ 0.6
RALGPS1-208ENST00000424082 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP18.83■□□□□ 0.6
RALGPS1-208ENST00000424082 LOC100653049A0A140TA62 436 aa18.82■□□□□ 0.6
RALGPS1-208ENST00000424082 DNAJA2O60884 412 aa18.82■□□□□ 0.6
RALGPS1-208ENST00000424082 KRT34O76011 436 aa18.82■□□□□ 0.6
RALGPS1-208ENST00000424082 IQCF3P0C7M6 154 aa18.82■□□□□ 0.6
RALGPS1-208ENST00000424082 VDRP11473 427 aa18.82■□□□□ 0.6
RALGPS1-208ENST00000424082 IMPDH2P12268 514 aa18.82■□□□□ 0.6
RALGPS1-208ENST00000424082 GJA5P36382 358 aa18.82■□□□□ 0.6
RALGPS1-208ENST00000424082 MTTPP55157 894 aa18.82■□□□□ 0.6
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP18.82■□□□□ 0.6
RALGPS1-208ENST00000424082 CXorf38Q8TB03 319 aa18.82■□□□□ 0.6
RALGPS1-208ENST00000424082 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP18.82■□□□□ 0.6
RALGPS1-208ENST00000424082 RBPJLQ9UBG7 517 aa18.82■□□□□ 0.6
RALGPS1-208ENST00000424082 CIDEBQ9UHD4 219 aa18.82■□□□□ 0.6
RALGPS1-208ENST00000424082 TRIP11Q15643 1979 aa18.82■□□□□ 0.6
RALGPS1-208ENST00000424082 GPR25O00155 361 aa18.82■□□□□ 0.6
RALGPS1-208ENST00000424082 CXCL11O14625 94 aa18.82■□□□□ 0.6
RALGPS1-208ENST00000424082 NDST1P52848 882 aa18.82■□□□□ 0.6
RALGPS1-208ENST00000424082 BOLA3Q53S33 107 aa18.82■□□□□ 0.6
RALGPS1-208ENST00000424082 OLFML2BQ68BL8 750 aa18.82■□□□□ 0.6
RALGPS1-208ENST00000424082 ISLR2Q6UXK2 745 aa18.82■□□□□ 0.6
RALGPS1-208ENST00000424082 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.8 ms