RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423339.2

CCDC82-202, Transcript of coiled-coil domain containing 82, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC82, Length 1,878 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82-202ENST00000423339 CCDC134Q9H6E4 229 aa3.49□□□□□ -1.85
CCDC82-202ENST00000423339 SAP30LQ9HAJ7 183 aa3.49□□□□□ -1.85
CCDC82-202ENST00000423339 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
CCDC82-202ENST00000423339 PI4KBQ9UBF8 816 aa3.49□□□□□ -1.85
CCDC82-202ENST00000423339 SLC13A4Q9UKG4 626 aa3.49□□□□□ -1.85
CCDC82-202ENST00000423339 CRYL1Q9Y2S2 319 aa3.49□□□□□ -1.85
CCDC82-202ENST00000423339 DERAQ9Y315 318 aa3.49□□□□□ -1.85
CCDC82-202ENST00000423339 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa3.49□□□□□ -1.85
CCDC82-202ENST00000423339 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
CCDC82-202ENST00000423339 EYA2O00167 538 aa3.48□□□□□ -1.85
CCDC82-202ENST00000423339 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
CCDC82-202ENST00000423339 CYP3A4P08684 503 aa3.48□□□□□ -1.85
CCDC82-202ENST00000423339 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
CCDC82-202ENST00000423339 MATN1P21941 496 aa3.48□□□□□ -1.85
CCDC82-202ENST00000423339 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
CCDC82-202ENST00000423339 GPC5P78333 572 aa3.48□□□□□ -1.85
CCDC82-202ENST00000423339 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
CCDC82-202ENST00000423339 TFF2Q03403 129 aa3.48□□□□□ -1.85
CCDC82-202ENST00000423339 CBFBQ13951 182 aa3.48□□□□□ -1.85
CCDC82-202ENST00000423339 TMEM63BQ5T3F8 832 aa3.48□□□□□ -1.85
CCDC82-202ENST00000423339 SUMO4Q6EEV6 95 aa3.48□□□□□ -1.85
CCDC82-202ENST00000423339 TMEM57Q8N5G2 664 aa3.48□□□□□ -1.85
CCDC82-202ENST00000423339 LINC01465Q8N7H1 131 aa3.48□□□□□ -1.85
CCDC82-202ENST00000423339 TERB1Q8NA31 727 aa3.48□□□□□ -1.85
CCDC82-202ENST00000423339 USP38Q8NB14 1042 aa3.48□□□□□ -1.85
CCDC82-202ENST00000423339 OR52L2PQ8NGH6 319 aa3.48□□□□□ -1.85
CCDC82-202ENST00000423339 SLC2A12Q8TD20 617 aa3.48□□□□□ -1.85
CCDC82-202ENST00000423339 GOLGA1Q92805 767 aa3.48□□□□□ -1.85
CCDC82-202ENST00000423339 COG8Q96MW5 612 aa3.48□□□□□ -1.85
CCDC82-202ENST00000423339 CHODLQ9H9P2 273 aa3.48□□□□□ -1.85
CCDC82-202ENST00000423339 NOD2Q9HC29 1040 aa3.48□□□□□ -1.85
CCDC82-202ENST00000423339 VPS45Q9NRW7 570 aa3.48□□□□□ -1.85
CCDC82-202ENST00000423339 GGA3Q9NZ52 723 aa3.48□□□□□ -1.85
CCDC82-202ENST00000423339 KCND3Q9UK17 655 aa3.48□□□□□ -1.85
CCDC82-202ENST00000423339 KAT6BQ8WYB5 2073 aa3.48□□□□□ -1.85
CCDC82-202ENST00000423339 PRRT4C9JH25 899 aa3.47□□□□□ -1.85
CCDC82-202ENST00000423339 M0QYT0 321 aa3.47□□□□□ -1.85
CCDC82-202ENST00000423339 CA12O43570 354 aa3.47□□□□□ -1.85
CCDC82-202ENST00000423339 POLBP06746 335 aa3.47□□□□□ -1.85
CCDC82-202ENST00000423339 CYP21A2P08686 494 aa3.47□□□□□ -1.85
CCDC82-202ENST00000423339 ALADP13716 330 aa3.47□□□□□ -1.85
CCDC82-202ENST00000423339 RXRAP19793 462 aa3.47□□□□□ -1.85
CCDC82-202ENST00000423339 DUSP1P28562 367 aa3.47□□□□□ -1.85
CCDC82-202ENST00000423339 UBE3AQ05086 875 aa3.47□□□□□ -1.85
CCDC82-202ENST00000423339 CCDC15Q0P6D6 951 aa3.47□□□□□ -1.85
CCDC82-202ENST00000423339 LMAN2Q12907 356 aa3.47□□□□□ -1.85
CCDC82-202ENST00000423339 DCTN1Q14203 1278 aa3.47□□□□□ -1.85
CCDC82-202ENST00000423339 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa3.47□□□□□ -1.85
CCDC82-202ENST00000423339 ZNF425Q6IV72 752 aa3.47□□□□□ -1.85
CCDC82-202ENST00000423339 KIRREL2Q6UWL6 708 aa3.47□□□□□ -1.85
CCDC82-202ENST00000423339 C16orf89Q6UX73 402 aa3.47□□□□□ -1.85
CCDC82-202ENST00000423339 TRIM72Q6ZMU5 477 aa3.47□□□□□ -1.85
CCDC82-202ENST00000423339 SYT13Q7L8C5 426 aa3.47□□□□□ -1.85
CCDC82-202ENST00000423339 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
CCDC82-202ENST00000423339 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
CCDC82-202ENST00000423339 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
CCDC82-202ENST00000423339 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
CCDC82-202ENST00000423339 MPP4Q96JB8 637 aa3.47□□□□□ -1.85
CCDC82-202ENST00000423339 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
CCDC82-202ENST00000423339 SNX18Q96RF0 628 aa3.47□□□□□ -1.85
CCDC82-202ENST00000423339 NPAS1Q99742 590 aa3.47□□□□□ -1.85
CCDC82-202ENST00000423339 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
CCDC82-202ENST00000423339 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
CCDC82-202ENST00000423339 CIPCQ9C0C6 399 aa3.47□□□□□ -1.85
CCDC82-202ENST00000423339 CDCP1Q9H5V8 836 aa3.47□□□□□ -1.85
CCDC82-202ENST00000423339 TMEM160Q9NX00 188 aa3.47□□□□□ -1.85
CCDC82-202ENST00000423339 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa3.47□□□□□ -1.85
CCDC82-202ENST00000423339 SAC3D1A6NKF1 404 aa3.47□□□□□ -1.85
CCDC82-202ENST00000423339 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
CCDC82-202ENST00000423339 PRAMEF2O60811 474 aa3.47□□□□□ -1.85
CCDC82-202ENST00000423339 KRT38O76015 456 aa3.47□□□□□ -1.85
CCDC82-202ENST00000423339 BMP15O95972 392 aa3.47□□□□□ -1.85
CCDC82-202ENST00000423339 MBPP02686 304 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
CCDC82-202ENST00000423339 CNTFP26441 200 aa3.47□□□□□ -1.85
CCDC82-202ENST00000423339 CCR5P51681 352 aa3.47□□□□□ -1.85
CCDC82-202ENST00000423339 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP3.47□□□□□ -1.85
CCDC82-202ENST00000423339 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
CCDC82-202ENST00000423339 RPL15P61313 204 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
CCDC82-202ENST00000423339 CFHR3Q02985 330 aa3.47□□□□□ -1.85
CCDC82-202ENST00000423339 CHRNDQ07001 517 aa3.47□□□□□ -1.85
CCDC82-202ENST00000423339 ANKRD1Q15327 319 aa3.47□□□□□ -1.85
CCDC82-202ENST00000423339 PROSER3Q2NL68 480 aa3.47□□□□□ -1.85
CCDC82-202ENST00000423339 CTXN3Q4LDR2 81 aa3.47□□□□□ -1.85
CCDC82-202ENST00000423339 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa3.47□□□□□ -1.85
CCDC82-202ENST00000423339 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa3.47□□□□□ -1.85
CCDC82-202ENST00000423339 ANKRD40Q6AI12 368 aa3.47□□□□□ -1.85
CCDC82-202ENST00000423339 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
CCDC82-202ENST00000423339 CEP70Q8NHQ1 597 aa3.47□□□□□ -1.85
CCDC82-202ENST00000423339 HASPINQ8TF76 798 aa3.47□□□□□ -1.85
CCDC82-202ENST00000423339 DPF1Q92782 380 aa3.47□□□□□ -1.85
CCDC82-202ENST00000423339 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
CCDC82-202ENST00000423339 KAZALD1Q96I82 304 aa3.47□□□□□ -1.85
CCDC82-202ENST00000423339 MMS19Q96T76 1030 aa3.47□□□□□ -1.85
CCDC82-202ENST00000423339 UNC45AQ9H3U1 944 aa3.47□□□□□ -1.85
CCDC82-202ENST00000423339 SEMA5BQ9P283 1151 aa3.47□□□□□ -1.85
CCDC82-202ENST00000423339 BAG5Q9UL15 447 aa3.47□□□□□ -1.85
CCDC82-202ENST00000423339 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
CCDC82-202ENST00000423339 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
CCDC82-202ENST00000423339 J3KRW8 73 aa3.46□□□□□ -1.86
CCDC82-202ENST00000423339 SEPT4O43236 478 aa3.46□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.2 ms