RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421999.7

CMSS1-201, Transcript of cms1 ribosomal small subunit homolog (yeast), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CMSS1, Length 4,330 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMSS1-201ENST00000421999 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
CMSS1-201ENST00000421999 NCAM2O15394 837 aa10□□□□□ -0.81
CMSS1-201ENST00000421999 SMIM24O75264 130 aa10□□□□□ -0.81
CMSS1-201ENST00000421999 TKTP29401 623 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
CMSS1-201ENST00000421999 FLT3P36888 993 aa10□□□□□ -0.81
CMSS1-201ENST00000421999 FDFT1P37268 417 aa10□□□□□ -0.81
CMSS1-201ENST00000421999 POM121L1PQ3SYA9 428 aa10□□□□□ -0.81
CMSS1-201ENST00000421999 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
CMSS1-201ENST00000421999 LZTR1Q8N653 840 aa10□□□□□ -0.81
CMSS1-201ENST00000421999 LMO3Q8TAP4 145 aa10□□□□□ -0.81
CMSS1-201ENST00000421999 CENPKQ9BS16 269 aa10□□□□□ -0.81
CMSS1-201ENST00000421999 KCND1Q9NSA2 647 aa10□□□□□ -0.81
CMSS1-201ENST00000421999 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
CMSS1-201ENST00000421999 COG5Q9UP83 839 aa10□□□□□ -0.81
CMSS1-201ENST00000421999 NCANO14594 1321 aa10□□□□□ -0.81
CMSS1-201ENST00000421999 NRP1O14786 923 aa10□□□□□ -0.81
CMSS1-201ENST00000421999 MDM4O15151 490 aa10□□□□□ -0.81
CMSS1-201ENST00000421999 CAND2O75155 1236 aa10□□□□□ -0.81
CMSS1-201ENST00000421999 SPAG7O75391 227 aa10□□□□□ -0.81
CMSS1-201ENST00000421999 RHOBTB1O94844 696 aa10□□□□□ -0.81
CMSS1-201ENST00000421999 KCNE1P15382 129 aa10□□□□□ -0.81
CMSS1-201ENST00000421999 FNTAP49354 379 aa10□□□□□ -0.81
CMSS1-201ENST00000421999 GATMP50440 423 aa10□□□□□ -0.81
CMSS1-201ENST00000421999 TAS2R40P59535 323 aa10□□□□□ -0.81
CMSS1-201ENST00000421999 MTA1Q13330 715 aa10□□□□□ -0.81
CMSS1-201ENST00000421999 MRNIPQ6NTE8 343 aa10□□□□□ -0.81
CMSS1-201ENST00000421999 ARMC6Q6NXE6 501 aa10□□□□□ -0.81
CMSS1-201ENST00000421999 AGMOQ6ZNB7 445 aa10□□□□□ -0.81
CMSS1-201ENST00000421999 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
CMSS1-201ENST00000421999 PPIL6Q8IXY8 311 aa10□□□□□ -0.81
CMSS1-201ENST00000421999 KREMEN2Q8NCW0 462 aa10□□□□□ -0.81
CMSS1-201ENST00000421999 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa10□□□□□ -0.81
CMSS1-201ENST00000421999 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
CMSS1-201ENST00000421999 CLDND1Q9NY35 253 aa10□□□□□ -0.81
CMSS1-201ENST00000421999 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
CMSS1-201ENST00000421999 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa10□□□□□ -0.81
CMSS1-201ENST00000421999 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
CMSS1-201ENST00000421999 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa10□□□□□ -0.81
CMSS1-201ENST00000421999 TMEM191CA6NGB0 347 aa10□□□□□ -0.81
CMSS1-201ENST00000421999 CTIFO43310 598 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
CMSS1-201ENST00000421999 ATP8B1O43520 1251 aa10□□□□□ -0.81
CMSS1-201ENST00000421999 ADAMTS4O75173 837 aa10□□□□□ -0.81
CMSS1-201ENST00000421999 KITP10721 976 aa10□□□□□ -0.81
CMSS1-201ENST00000421999 SPRP35270 261 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
CMSS1-201ENST00000421999 MAGEA4P43358 317 aa10□□□□□ -0.81
CMSS1-201ENST00000421999 PLA2G4AP47712 749 aa10□□□□□ -0.81
CMSS1-201ENST00000421999 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
CMSS1-201ENST00000421999 SMARCB1Q12824 385 aa10□□□□□ -0.81
CMSS1-201ENST00000421999 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
CMSS1-201ENST00000421999 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
CMSS1-201ENST00000421999 FBXL19Q6PCT2 694 aa10□□□□□ -0.81
CMSS1-201ENST00000421999 C4orf22Q6V702 233 aa10□□□□□ -0.81
CMSS1-201ENST00000421999 NUDCD3Q8IVD9 361 aa10□□□□□ -0.81
CMSS1-201ENST00000421999 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
CMSS1-201ENST00000421999 ALG3Q92685 438 aa10□□□□□ -0.81
CMSS1-201ENST00000421999 YIPF2Q9BWQ6 316 aa10□□□□□ -0.81
CMSS1-201ENST00000421999 A0A0G2JND7 137 aa9.99□□□□□ -0.81
CMSS1-201ENST00000421999 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa9.99□□□□□ -0.81
CMSS1-201ENST00000421999 GOLGA8OA6NCC3 632 aa9.99□□□□□ -0.81
CMSS1-201ENST00000421999 GOLGA8NF8WBI6 632 aa9.99□□□□□ -0.81
CMSS1-201ENST00000421999 ITGALP20701 1170 aa9.99□□□□□ -0.81
CMSS1-201ENST00000421999 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
CMSS1-201ENST00000421999 STAT4Q14765 748 aa9.99□□□□□ -0.81
CMSS1-201ENST00000421999 TAF5Q15542 800 aa9.99□□□□□ -0.81
CMSS1-201ENST00000421999 SH2D4BQ5SQS7 431 aa9.99□□□□□ -0.81
CMSS1-201ENST00000421999 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa9.99□□□□□ -0.81
CMSS1-201ENST00000421999 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
CMSS1-201ENST00000421999 HDAC7Q8WUI4 952 aa9.99□□□□□ -0.81
CMSS1-201ENST00000421999 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
CMSS1-201ENST00000421999 C10orf88Q9H8K7 445 aa9.99□□□□□ -0.81
CMSS1-201ENST00000421999 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
CMSS1-201ENST00000421999 PTPRHQ9HD43 1115 aa9.99□□□□□ -0.81
CMSS1-201ENST00000421999 SLC39A10Q9ULF5 831 aa9.99□□□□□ -0.81
CMSS1-201ENST00000421999 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa9.99□□□□□ -0.81
CMSS1-201ENST00000421999 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
CMSS1-201ENST00000421999 TBL1XO60907 577 aa9.99□□□□□ -0.81
CMSS1-201ENST00000421999 LCA5LO95447 670 aa9.99□□□□□ -0.81
CMSS1-201ENST00000421999 IGSF6O95976 241 aa9.99□□□□□ -0.81
CMSS1-201ENST00000421999 PTK6Q13882 451 aa9.99□□□□□ -0.81
CMSS1-201ENST00000421999 ZNF662Q6ZS27 426 aa9.99□□□□□ -0.81
CMSS1-201ENST00000421999 MON1BQ7L1V2 547 aa9.99□□□□□ -0.81
CMSS1-201ENST00000421999 FBXO10Q9UK96 956 aa9.99□□□□□ -0.81
CMSS1-201ENST00000421999 PCDHGC3Q9UN70 934 aa9.99□□□□□ -0.81
CMSS1-201ENST00000421999 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa9.99□□□□□ -0.81
CMSS1-201ENST00000421999 ADGRA2Q96PE1 1338 aa9.99□□□□□ -0.81
CMSS1-201ENST00000421999 HEATR9A2RTY3 570 aa9.99□□□□□ -0.81
CMSS1-201ENST00000421999 PDZK1P1A8MUH7 402 aa9.99□□□□□ -0.81
CMSS1-201ENST00000421999 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
CMSS1-201ENST00000421999 BCL2L1Q07817 233 aa9.99□□□□□ -0.81
CMSS1-201ENST00000421999 POU6F1Q14863 301 aa9.99□□□□□ -0.81
CMSS1-201ENST00000421999 ACAP1Q15027 740 aa9.99□□□□□ -0.81
CMSS1-201ENST00000421999 LRRC14Q15048 493 aa9.99□□□□□ -0.81
CMSS1-201ENST00000421999 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
CMSS1-201ENST00000421999 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa9.99□□□□□ -0.81
CMSS1-201ENST00000421999 XYLT1Q86Y38 959 aa9.99□□□□□ -0.81
CMSS1-201ENST00000421999 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
CMSS1-201ENST00000421999 TSPAN17Q96FV3 270 aa9.99□□□□□ -0.81
CMSS1-201ENST00000421999 ZBTB18Q99592 522 aa9.99□□□□□ -0.81
CMSS1-201ENST00000421999 ACBD6Q9BR61 282 aa9.99□□□□□ -0.81
CMSS1-201ENST00000421999 PITPNM3Q9BZ71 974 aa9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 89 ms