RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417855.1

TTLL4-205, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 4, human

TSL 3

Gene TTLL4, Length 601 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL4-205	ENST00000417855	SEC62	Q99442	399 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
TTLL4-205	ENST00000417855	WDR11	Q9BZH6	1224 aa		2.59	□□□□□ -1.99
TTLL4-205	ENST00000417855	PABPC3	Q9H361	631 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
TTLL4-205	ENST00000417855	RIC8A	Q9NPQ8	531 aa		2.59	□□□□□ -1.99
TTLL4-205	ENST00000417855	VSX1	Q9NZR4	365 aa	Predicted RBP	2.59	□□□□□ -1.99
TTLL4-205	ENST00000417855	CEP72	Q9P209	647 aa		2.59	□□□□□ -1.99
TTLL4-205	ENST00000417855	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
TTLL4-205	ENST00000417855	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		2.59	□□□□□ -1.99
TTLL4-205	ENST00000417855	VPS51	Q9UID3	782 aa		2.59	□□□□□ -1.99
TTLL4-205	ENST00000417855	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
TTLL4-205	ENST00000417855	GPR52	Q9Y2T5	361 aa		2.59	□□□□□ -1.99
TTLL4-205	ENST00000417855	ZBTB32	Q9Y2Y4	487 aa	Predicted RBP	2.59	□□□□□ -1.99
TTLL4-205	ENST00000417855	DERA	Q9Y315	318 aa		2.59	□□□□□ -1.99
TTLL4-205	ENST00000417855	KDR	P35968	1356 aa		2.59	□□□□□ -2
TTLL4-205	ENST00000417855	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		2.59	□□□□□ -2
TTLL4-205	ENST00000417855	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	2.59	□□□□□ -2
TTLL4-205	ENST00000417855	CENPVL1	A0A0U1RR11	272 aa		2.58	□□□□□ -2
TTLL4-205	ENST00000417855	TMEM191C	A6NGB0	347 aa		2.58	□□□□□ -2
TTLL4-205	ENST00000417855	SAC3D1	A6NKF1	404 aa		2.58	□□□□□ -2
TTLL4-205	ENST00000417855	C3orf70	A6NLC5	250 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
TTLL4-205	ENST00000417855		H0Y3Z8	333 aa		2.58	□□□□□ -2
TTLL4-205	ENST00000417855	AP4M1	O00189	453 aa		2.58	□□□□□ -2
TTLL4-205	ENST00000417855	ZNF213	O14771	459 aa		2.58	□□□□□ -2
TTLL4-205	ENST00000417855	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
TTLL4-205	ENST00000417855	PCDH17	O14917	1159 aa		2.58	□□□□□ -2
TTLL4-205	ENST00000417855	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
TTLL4-205	ENST00000417855	FAM155B	O75949	473 aa		2.58	□□□□□ -2
TTLL4-205	ENST00000417855	ZFPL1	O95159	310 aa		2.58	□□□□□ -2
TTLL4-205	ENST00000417855	AGR2	O95994	175 aa		2.58	□□□□□ -2
TTLL4-205	ENST00000417855	LMNA	P02545	664 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
TTLL4-205	ENST00000417855	TFRC	P02786	760 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
TTLL4-205	ENST00000417855	TK1	P04183	234 aa		2.58	□□□□□ -2
TTLL4-205	ENST00000417855	PDHA1	P08559	390 aa		2.58	□□□□□ -2
TTLL4-205	ENST00000417855	IL6R	P08887	468 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
TTLL4-205	ENST00000417855	C1S	P09871	688 aa		2.58	□□□□□ -2
TTLL4-205	ENST00000417855	GYS1	P13807	737 aa		2.58	□□□□□ -2
TTLL4-205	ENST00000417855	VEGFA	P15692	232 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
TTLL4-205	ENST00000417855	MATN1	P21941	496 aa		2.58	□□□□□ -2
TTLL4-205	ENST00000417855	KLRK1	P26718	216 aa		2.58	□□□□□ -2
TTLL4-205	ENST00000417855	ELF1	P32519	619 aa		2.58	□□□□□ -2
TTLL4-205	ENST00000417855	MCM7	P33993	719 aa		2.58	□□□□□ -2
TTLL4-205	ENST00000417855	GRK5	P34947	590 aa		2.58	□□□□□ -2
TTLL4-205	ENST00000417855	THBS4	P35443	961 aa		2.58	□□□□□ -2
TTLL4-205	ENST00000417855	IGHMBP2	P38935	993 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
TTLL4-205	ENST00000417855	RIPK4	P57078	832 aa		2.58	□□□□□ -2
TTLL4-205	ENST00000417855	JAG1	P78504	1218 aa		2.58	□□□□□ -2
TTLL4-205	ENST00000417855	TLE2	Q04725	743 aa		2.58	□□□□□ -2
TTLL4-205	ENST00000417855	UBE3A	Q05086	875 aa		2.58	□□□□□ -2
TTLL4-205	ENST00000417855	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		2.58	□□□□□ -2
TTLL4-205	ENST00000417855	MAPK7	Q13164	816 aa		2.58	□□□□□ -2
TTLL4-205	ENST00000417855	FOXE3	Q13461	319 aa		2.58	□□□□□ -2
TTLL4-205	ENST00000417855	FZD5	Q13467	585 aa		2.58	□□□□□ -2
TTLL4-205	ENST00000417855	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
TTLL4-205	ENST00000417855	GRM4	Q14833	912 aa		2.58	□□□□□ -2
TTLL4-205	ENST00000417855	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
TTLL4-205	ENST00000417855	GPR162	Q16538	588 aa		2.58	□□□□□ -2
TTLL4-205	ENST00000417855	BTBD16	Q32M84	506 aa		2.58	□□□□□ -2
TTLL4-205	ENST00000417855	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		2.58	□□□□□ -2
TTLL4-205	ENST00000417855	CTXN3	Q4LDR2	81 aa		2.58	□□□□□ -2
TTLL4-205	ENST00000417855	GLE1	Q53GS7	698 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
TTLL4-205	ENST00000417855	PCID2	Q5JVF3	399 aa		2.58	□□□□□ -2
TTLL4-205	ENST00000417855	L1TD1	Q5T7N2	865 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
TTLL4-205	ENST00000417855	NAA35	Q5VZE5	725 aa		2.58	□□□□□ -2
TTLL4-205	ENST00000417855	DGAT2L7P	Q6IED9	249 aa		2.58	□□□□□ -2
TTLL4-205	ENST00000417855	ANKRD16	Q6P6B7	361 aa		2.58	□□□□□ -2
TTLL4-205	ENST00000417855	PTCHD4	Q6ZW05	846 aa		2.58	□□□□□ -2
TTLL4-205	ENST00000417855	USP51	Q70EK9	711 aa		2.58	□□□□□ -2
TTLL4-205	ENST00000417855	RRAGA	Q7L523	313 aa		2.58	□□□□□ -2
TTLL4-205	ENST00000417855	SLC29A4	Q7RTT9	530 aa		2.58	□□□□□ -2
TTLL4-205	ENST00000417855	MAVS	Q7Z434	540 aa		2.58	□□□□□ -2
TTLL4-205	ENST00000417855	GRASP	Q7Z6J2	395 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
TTLL4-205	ENST00000417855	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
TTLL4-205	ENST00000417855	SLC44A3	Q8N4M1	653 aa		2.58	□□□□□ -2
TTLL4-205	ENST00000417855	CEP70	Q8NHQ1	597 aa		2.58	□□□□□ -2
TTLL4-205	ENST00000417855	SCAMP5	Q8TAC9	235 aa		2.58	□□□□□ -2
TTLL4-205	ENST00000417855	EXOC6	Q8TAG9	804 aa		2.58	□□□□□ -2
TTLL4-205	ENST00000417855	ACTRT2	Q8TDY3	377 aa		2.58	□□□□□ -2
TTLL4-205	ENST00000417855	SH3RF3	Q8TEJ3	882 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
TTLL4-205	ENST00000417855	TFAP2B	Q92481	460 aa		2.58	□□□□□ -2
TTLL4-205	ENST00000417855	ARHGAP45	Q92619	1136 aa		2.58	□□□□□ -2
TTLL4-205	ENST00000417855	MPP4	Q96JB8	637 aa		2.58	□□□□□ -2
TTLL4-205	ENST00000417855	COQ10A	Q96MF6	247 aa		2.58	□□□□□ -2
TTLL4-205	ENST00000417855	COG8	Q96MW5	612 aa		2.58	□□□□□ -2
TTLL4-205	ENST00000417855	WDR24	Q96S15	920 aa		2.58	□□□□□ -2
TTLL4-205	ENST00000417855	PIGS	Q96S52	555 aa		2.58	□□□□□ -2
TTLL4-205	ENST00000417855	HAPLN3	Q96S86	360 aa		2.58	□□□□□ -2
TTLL4-205	ENST00000417855	ADAM2	Q99965	735 aa		2.58	□□□□□ -2
TTLL4-205	ENST00000417855	DDX23	Q9BUQ8	820 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
TTLL4-205	ENST00000417855	C1QTNF3	Q9BXJ4	246 aa		2.58	□□□□□ -2
TTLL4-205	ENST00000417855	SLC26A6	Q9BXS9	759 aa		2.58	□□□□□ -2
TTLL4-205	ENST00000417855	CHODL	Q9H9P2	273 aa		2.58	□□□□□ -2
TTLL4-205	ENST00000417855	JMJD4	Q9H9V9	463 aa		2.58	□□□□□ -2
TTLL4-205	ENST00000417855	MLXIP	Q9HAP2	919 aa		2.58	□□□□□ -2
TTLL4-205	ENST00000417855	USP29	Q9HBJ7	922 aa		2.58	□□□□□ -2
TTLL4-205	ENST00000417855	SLC2A4RG	Q9NR83	387 aa		2.58	□□□□□ -2
TTLL4-205	ENST00000417855	RASSF1	Q9NS23	344 aa		2.58	□□□□□ -2
TTLL4-205	ENST00000417855	RXFP3	Q9NSD7	469 aa		2.58	□□□□□ -2
TTLL4-205	ENST00000417855	IRAK4	Q9NWZ3	460 aa		2.58	□□□□□ -2
TTLL4-205	ENST00000417855	PDP2	Q9P2J9	529 aa		2.58	□□□□□ -2
TTLL4-205	ENST00000417855	RIMKLB	Q9ULI2	386 aa		2.58	□□□□□ -2

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.8 ms