RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 MTMR10Q9NXD2 777 aa19.22■□□□□ 0.67
SH3BP1-202ENST00000417536 DTLQ9NZJ0 730 aa19.22■□□□□ 0.67
SH3BP1-202ENST00000417536 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa19.22■□□□□ 0.67
SH3BP1-202ENST00000417536 EMCNQ9ULC0 261 aa19.22■□□□□ 0.67
SH3BP1-202ENST00000417536 HES2Q9Y543 173 aa19.22■□□□□ 0.67
SH3BP1-202ENST00000417536 CITO14578 2027 aa19.22■□□□□ 0.67
SH3BP1-202ENST00000417536 USP1O94782 785 aa19.22■□□□□ 0.67
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC25A3Q00325 362 aa19.22■□□□□ 0.67
SH3BP1-202ENST00000417536 MAP2K5Q13163 448 aa19.22■□□□□ 0.67
SH3BP1-202ENST00000417536 SEMA5AQ13591 1074 aa19.22■□□□□ 0.67
SH3BP1-202ENST00000417536 MBLAC2Q68D91 279 aa19.22■□□□□ 0.67
SH3BP1-202ENST00000417536 MTHFD1LQ6UB35 978 aa19.22■□□□□ 0.67
SH3BP1-202ENST00000417536 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP19.22■□□□□ 0.67
SH3BP1-202ENST00000417536 TLK2Q86UE8 772 aa19.22■□□□□ 0.67
SH3BP1-202ENST00000417536 IFNL1Q8IU54 200 aa19.22■□□□□ 0.67
SH3BP1-202ENST00000417536 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP19.22■□□□□ 0.67
SH3BP1-202ENST00000417536 LGMNQ99538 433 aa19.22■□□□□ 0.67
SH3BP1-202ENST00000417536 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP19.21■□□□□ 0.67
SH3BP1-202ENST00000417536 LCP1P13796 627 aa19.21■□□□□ 0.67
SH3BP1-202ENST00000417536 VAV1P15498 845 aa19.21■□□□□ 0.67
SH3BP1-202ENST00000417536 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa19.21■□□□□ 0.67
SH3BP1-202ENST00000417536 TIFABQ6ZNK6 161 aa19.21■□□□□ 0.67
SH3BP1-202ENST00000417536 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP19.21■□□□□ 0.67
SH3BP1-202ENST00000417536 TSC22D3Q99576 134 aa19.21■□□□□ 0.67
SH3BP1-202ENST00000417536 DPEP3Q9H4B8 488 aa19.21■□□□□ 0.67
SH3BP1-202ENST00000417536 E2F8A0AVK6 867 aa19.21■□□□□ 0.67
SH3BP1-202ENST00000417536 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP19.21■□□□□ 0.67
SH3BP1-202ENST00000417536 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP19.21■□□□□ 0.67
SH3BP1-202ENST00000417536 GOT1P17174 413 aa19.21■□□□□ 0.67
SH3BP1-202ENST00000417536 GMPRP36959 345 aa19.21■□□□□ 0.67
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC1A6P48664 564 aa19.21■□□□□ 0.67
SH3BP1-202ENST00000417536 CDK18Q07002 472 aa19.21■□□□□ 0.67
SH3BP1-202ENST00000417536 TRIM32Q13049 653 aa19.21■□□□□ 0.67
SH3BP1-202ENST00000417536 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP19.21■□□□□ 0.67
SH3BP1-202ENST00000417536 TBCCQ15814 346 aa19.21■□□□□ 0.67
SH3BP1-202ENST00000417536 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa19.21■□□□□ 0.67
SH3BP1-202ENST00000417536 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa19.21■□□□□ 0.67
SH3BP1-202ENST00000417536 OR52E8Q6IFG1 317 aa19.21■□□□□ 0.67
SH3BP1-202ENST00000417536 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP19.21■□□□□ 0.67
SH3BP1-202ENST00000417536 TTC39CQ8N584 583 aa19.21■□□□□ 0.67
SH3BP1-202ENST00000417536 PHC3Q8NDX5 983 aa19.21■□□□□ 0.67
SH3BP1-202ENST00000417536 OR6B3Q8NGW1 331 aa19.21■□□□□ 0.67
SH3BP1-202ENST00000417536 HTR3CQ8WXA8 447 aa19.21■□□□□ 0.67
SH3BP1-202ENST00000417536 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa19.21■□□□□ 0.67
SH3BP1-202ENST00000417536 PSAT1Q9Y617 370 aa19.21■□□□□ 0.67
SH3BP1-202ENST00000417536 MYADML2A6NDP7 307 aa19.2■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 ARHGAP42A6NI28 874 aa19.2■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP19.2■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 AP2B1P63010 937 aa19.2■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 SARNPP82979 210 aaKnown RBP19.2■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 SOWAHAQ2M3V2 549 aa19.2■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 IZUMO2Q6UXV1 221 aa19.2■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 PACS1Q6VY07 963 aa19.2■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 GSTCDQ8NEC7 633 aa19.2■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 OSMRQ99650 979 aa19.2■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP19.2■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa19.2■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 PIDD1Q9HB75 910 aa19.2■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP19.2■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 NDE1Q9NXR1 346 aa19.2■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 PPM1HQ9ULR3 514 aa19.2■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 TSPAN1O60635 241 aa19.2■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 MYL3P08590 195 aa19.2■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP19.2■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 YY1P25490 414 aa19.2■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 MGAT1P26572 445 aa19.2■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 ADORA2BP29275 332 aa19.2■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 NR2C2P49116 596 aa19.2■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 RSPH3Q86UC2 560 aa19.2■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa19.2■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP19.2■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 SOX13Q9UN79 622 aa19.2■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 CNTFP26441 200 aa19.19■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 CPOXP36551 454 aa19.19■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 CACNA2D1P54289 1103 aa19.19■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 TUBB3Q13509 450 aa19.19■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 DGKDQ16760 1214 aa19.19■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF484Q5JVG2 852 aa19.19■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 MORN1Q5T089 497 aa19.19■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP19.19■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP19.19■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 PLIN3O60664 434 aa19.19■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 GLRA3O75311 464 aa19.19■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 STAU1O95793 577 aaKnown RBP19.19■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 CCDC130P13994 396 aa19.19■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 AOC1P19801 751 aa19.19■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 PTPN9P43378 593 aa19.19■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 PDE1BQ01064 536 aa19.19■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 POU5F1BQ06416 359 aa19.19■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 PPM1JQ5JR12 505 aa19.19■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 CES3Q6UWW8 571 aa19.19■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 ATG14Q6ZNE5 492 aa19.19■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 CDKL2Q92772 493 aa19.19■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP19.19■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 PNPOQ9NVS9 261 aa19.19■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 A0A088AWK7 358 aa19.18■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 PDGFRBP09619 1106 aa19.18■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 SETSIPP0DME0 302 aa19.18■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 NIPAL4Q0D2K0 466 aa19.18■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 PCLAFQ15004 111 aa19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.4 ms