RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409189.7

CCL20-202, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 839 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-202ENST00000409189 AKAP13Q12802 2813 aa7□□□□□ -1.29
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CCL20-202ENST00000409189 CCDC169A6NNP5 214 aa6.99□□□□□ -1.29
CCL20-202ENST00000409189 H7BY64 318 aa6.99□□□□□ -1.29
CCL20-202ENST00000409189 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP6.99□□□□□ -1.292e-23■■□□□ 11.7
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CCL20-202ENST00000409189 SLC16A4O15374 487 aa6.99□□□□□ -1.29
CCL20-202ENST00000409189 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
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CCL20-202ENST00000409189 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
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CCL20-202ENST00000409189 C2orf40Q9H1Z8 148 aa6.99□□□□□ -1.29
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CCL20-202ENST00000409189 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa6.99□□□□□ -1.29
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CCL20-202ENST00000409189 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa6.99□□□□□ -1.29
CCL20-202ENST00000409189 ERAP1Q9NZ08 941 aa6.99□□□□□ -1.29
CCL20-202ENST00000409189 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
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CCL20-202ENST00000409189 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
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CCL20-202ENST00000409189 POF1BQ8WVV4 589 aa6.98□□□□□ -1.29
CCL20-202ENST00000409189 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
CCL20-202ENST00000409189 GLG1Q92896 1179 aa6.98□□□□□ -1.29
CCL20-202ENST00000409189 PPP1R14AQ96A00 147 aa6.98□□□□□ -1.29
CCL20-202ENST00000409189 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
CCL20-202ENST00000409189 BICD1Q96G01 975 aa6.98□□□□□ -1.29
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