RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392919.4

GNPTAB-202, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 760 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-202ENST00000392919 LOXL4Q96JB6 756 aa28.21■■■□□ 2.11
GNPTAB-202ENST00000392919 BBS2Q9BXC9 721 aa28.21■■■□□ 2.11
GNPTAB-202ENST00000392919 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP28.21■■■□□ 2.11
GNPTAB-202ENST00000392919 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP28.21■■■□□ 2.11
GNPTAB-202ENST00000392919 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP28.21■■■□□ 2.11
GNPTAB-202ENST00000392919 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP28.2■■■□□ 2.1
GNPTAB-202ENST00000392919 GJB6O95452 261 aa28.2■■■□□ 2.1
GNPTAB-202ENST00000392919 TPM1P09493 284 aa28.2■■■□□ 2.1
GNPTAB-202ENST00000392919 GZMAP12544 262 aa28.2■■■□□ 2.1
GNPTAB-202ENST00000392919 ADKP55263 362 aaKnown RBP28.2■■■□□ 2.1
GNPTAB-202ENST00000392919 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP28.2■■■□□ 2.1
GNPTAB-202ENST00000392919 ARCQ7LC44 396 aa28.2■■■□□ 2.1
GNPTAB-202ENST00000392919 NPY6RQ99463 290 aa28.2■■■□□ 2.1
GNPTAB-202ENST00000392919 ADAM33Q9BZ11 813 aa28.2■■■□□ 2.1
GNPTAB-202ENST00000392919 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP28.19■■■□□ 2.1
GNPTAB-202ENST00000392919 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa28.19■■■□□ 2.1
GNPTAB-202ENST00000392919 TYRP14679 529 aa28.19■■■□□ 2.1
GNPTAB-202ENST00000392919 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP28.19■■■□□ 2.1
GNPTAB-202ENST00000392919 C10orf76Q5T2E6 689 aa28.19■■■□□ 2.1
GNPTAB-202ENST00000392919 NUGGCQ68CJ6 796 aa28.19■■■□□ 2.1
GNPTAB-202ENST00000392919 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa28.19■■■□□ 2.1
GNPTAB-202ENST00000392919 FAM217AQ8IXS0 508 aa28.19■■■□□ 2.1
GNPTAB-202ENST00000392919 TERB1Q8NA31 727 aa28.19■■■□□ 2.1
GNPTAB-202ENST00000392919 BHMTQ93088 406 aa28.19■■■□□ 2.1
GNPTAB-202ENST00000392919 NT5C3BQ969T7 300 aa28.19■■■□□ 2.1
GNPTAB-202ENST00000392919 SMOC1Q9H4F8 434 aa28.19■■■□□ 2.1
GNPTAB-202ENST00000392919 FAM204AQ9H8W3 233 aa28.19■■■□□ 2.1
GNPTAB-202ENST00000392919 ABHD10Q9NUJ1 306 aa28.19■■■□□ 2.1
GNPTAB-202ENST00000392919 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP28.19■■■□□ 2.1
GNPTAB-202ENST00000392919 DDIT4Q9NX09 232 aa28.19■■■□□ 2.1
GNPTAB-202ENST00000392919 MARK1Q9P0L2 795 aa28.19■■■□□ 2.1
GNPTAB-202ENST00000392919 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa28.19■■■□□ 2.1
GNPTAB-202ENST00000392919 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa28.19■■■□□ 2.1
GNPTAB-202ENST00000392919 STOML2Q9UJZ1 356 aa28.19■■■□□ 2.1
GNPTAB-202ENST00000392919 LATS1O95835 1130 aa28.18■■■□□ 2.1
GNPTAB-202ENST00000392919 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP28.18■■■□□ 2.1
GNPTAB-202ENST00000392919 UNC45BQ8IWX7 931 aa28.18■■■□□ 2.1
GNPTAB-202ENST00000392919 C3orf20Q8ND61 904 aa28.18■■■□□ 2.1
GNPTAB-202ENST00000392919 JOSD2Q8TAC2 188 aa28.18■■■□□ 2.1
GNPTAB-202ENST00000392919 VCPIP1Q96JH7 1222 aa28.18■■■□□ 2.1
GNPTAB-202ENST00000392919 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP28.18■■■□□ 2.1
GNPTAB-202ENST00000392919 RRN3Q9NYV6 651 aa28.18■■■□□ 2.1
GNPTAB-202ENST00000392919 PLK2Q9NYY3 685 aa28.18■■■□□ 2.1
GNPTAB-202ENST00000392919 DCDC2BA2VCK2 349 aa28.17■■■□□ 2.1
GNPTAB-202ENST00000392919 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP28.17■■■□□ 2.1
GNPTAB-202ENST00000392919 CACNG3O60359 315 aa28.17■■■□□ 2.1
GNPTAB-202ENST00000392919 RTN2O75298 545 aa28.17■■■□□ 2.1
GNPTAB-202ENST00000392919 FTLP02792 175 aaPredicted RBP28.17■■■□□ 2.1
GNPTAB-202ENST00000392919 RRM1P23921 792 aa28.17■■■□□ 2.1
GNPTAB-202ENST00000392919 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP28.17■■■□□ 2.1
GNPTAB-202ENST00000392919 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP28.17■■■□□ 2.1
GNPTAB-202ENST00000392919 EOGTQ5NDL2 527 aa28.17■■■□□ 2.1
GNPTAB-202ENST00000392919 GRAMD4Q6IC98 578 aa28.17■■■□□ 2.1
GNPTAB-202ENST00000392919 CPXM2Q8N436 756 aa28.17■■■□□ 2.1
GNPTAB-202ENST00000392919 EMC1Q8N766 993 aa28.17■■■□□ 2.1
GNPTAB-202ENST00000392919 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP28.17■■■□□ 2.1
GNPTAB-202ENST00000392919 AZIN2Q96A70 460 aa28.17■■■□□ 2.1
GNPTAB-202ENST00000392919 ISCUQ9H1K1 167 aa28.17■■■□□ 2.1
GNPTAB-202ENST00000392919 RXFP3Q9NSD7 469 aa28.17■■■□□ 2.1
GNPTAB-202ENST00000392919 STAP1Q9ULZ2 295 aa28.17■■■□□ 2.1
GNPTAB-202ENST00000392919 ABCA7Q8IZY2 2146 aa28.16■■■□□ 2.1
GNPTAB-202ENST00000392919 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa28.16■■■□□ 2.1
GNPTAB-202ENST00000392919 A0A087X0T9 212 aa28.16■■■□□ 2.1
GNPTAB-202ENST00000392919 M0QYT0 321 aa28.16■■■□□ 2.1
GNPTAB-202ENST00000392919 FAM228BP0C875 321 aa28.16■■■□□ 2.1
GNPTAB-202ENST00000392919 KRT3P12035 628 aa28.16■■■□□ 2.1
GNPTAB-202ENST00000392919 SDHBP21912 280 aa28.16■■■□□ 2.1
GNPTAB-202ENST00000392919 BCKDHBP21953 392 aa28.16■■■□□ 2.1
GNPTAB-202ENST00000392919 GBP1P32455 592 aa28.16■■■□□ 2.1
GNPTAB-202ENST00000392919 CHKAP35790 457 aa28.16■■■□□ 2.1
GNPTAB-202ENST00000392919 SLC25A52Q3SY17 297 aa28.16■■■□□ 2.1
GNPTAB-202ENST00000392919 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
GNPTAB-202ENST00000392919 VPS36Q86VN1 386 aa28.16■■■□□ 2.1
GNPTAB-202ENST00000392919 CNGA4Q8IV77 575 aa28.16■■■□□ 2.1
GNPTAB-202ENST00000392919 TBCBQ99426 244 aa28.16■■■□□ 2.1
GNPTAB-202ENST00000392919 SELENOOQ9BVL4 669 aa28.16■■■□□ 2.1
GNPTAB-202ENST00000392919 COX16Q9P0S2 106 aa28.16■■■□□ 2.1
GNPTAB-202ENST00000392919 C2CD4BA6NLJ0 364 aa28.15■■■□□ 2.1
GNPTAB-202ENST00000392919 SIGLEC16A6NMB1 481 aa28.15■■■□□ 2.1
GNPTAB-202ENST00000392919 PRRT4C9JH25 899 aa28.15■■■□□ 2.1
GNPTAB-202ENST00000392919 GFRA2O00451 464 aa28.15■■■□□ 2.1
GNPTAB-202ENST00000392919 ACSL4O60488 711 aa28.15■■■□□ 2.1
GNPTAB-202ENST00000392919 ZNF806P0C7X5 589 aa28.15■■■□□ 2.1
GNPTAB-202ENST00000392919 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP28.15■■■□□ 2.1
GNPTAB-202ENST00000392919 WASP42768 502 aa28.15■■■□□ 2.1
GNPTAB-202ENST00000392919 SULT1E1P49888 294 aa28.15■■■□□ 2.1
GNPTAB-202ENST00000392919 NME3Q13232 169 aa28.15■■■□□ 2.1
GNPTAB-202ENST00000392919 PLA2G2CQ5R387 149 aa28.15■■■□□ 2.1
GNPTAB-202ENST00000392919 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa28.15■■■□□ 2.1
GNPTAB-202ENST00000392919 ADGRF1Q5T601 910 aa28.15■■■□□ 2.1
GNPTAB-202ENST00000392919 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa28.15■■■□□ 2.1
GNPTAB-202ENST00000392919 FRMD1Q8N878 549 aa28.15■■■□□ 2.1
GNPTAB-202ENST00000392919 NETO1Q8TDF5 533 aa28.15■■■□□ 2.1
GNPTAB-202ENST00000392919 RXFP2Q8WXD0 754 aa28.15■■■□□ 2.1
GNPTAB-202ENST00000392919 RLN3Q8WXF3 142 aa28.15■■■□□ 2.1
GNPTAB-202ENST00000392919 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP28.15■■■□□ 2.1
GNPTAB-202ENST00000392919 CFAP57Q96MR6 1250 aa28.15■■■□□ 2.1
GNPTAB-202ENST00000392919 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP28.15■■■□□ 2.1
GNPTAB-202ENST00000392919 ACOX2Q99424 681 aa28.15■■■□□ 2.1
GNPTAB-202ENST00000392919 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP28.15■■■□□ 2.1
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