RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384540.1

RNU6-601P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 601, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-601P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-601P-201ENST00000384540 PCDHA7Q9UN72 937 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-601P-201ENST00000384540 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
RNU6-601P-201ENST00000384540 DPPA5A6NC42 116 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-601P-201ENST00000384540 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
RNU6-601P-201ENST00000384540 NPC1O15118 1278 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-601P-201ENST00000384540 MDM4O15151 490 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-601P-201ENST00000384540 CHRNB1P11230 501 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-601P-201ENST00000384540 PLA2G2AP14555 144 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-601P-201ENST00000384540 TGM2P21980 687 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-601P-201ENST00000384540 STT3AP46977 705 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-601P-201ENST00000384540 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-601P-201ENST00000384540 MSANTD2Q6P1R3 559 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-601P-201ENST00000384540 NPIPB3Q92617 1050 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-601P-201ENST00000384540 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
RNU6-601P-201ENST00000384540 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
RNU6-601P-201ENST00000384540 MYLK2Q9H1R3 596 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-601P-201ENST00000384540 TASP1Q9H6P5 420 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-601P-201ENST00000384540 FBXO28Q9NVF7 368 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-601P-201ENST00000384540 RGL1Q9NZL6 768 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-601P-201ENST00000384540 UTS2RQ9UKP6 389 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-601P-201ENST00000384540 CA14Q9ULX7 337 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-601P-201ENST00000384540 LAMP3Q9UQV4 416 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-601P-201ENST00000384540 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-601P-201ENST00000384540 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-601P-201ENST00000384540 H0YGN5 161 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-601P-201ENST00000384540 RHODO00212 210 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-601P-201ENST00000384540 APOL1O14791 398 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-601P-201ENST00000384540 KRT86O43790 486 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-601P-201ENST00000384540 CNTN5O94779 1100 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-601P-201ENST00000384540 NDST3O95803 873 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-601P-201ENST00000384540 SLC5A1P13866 664 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-601P-201ENST00000384540 MT3P25713 68 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-601P-201ENST00000384540 RFX2P48378 723 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-601P-201ENST00000384540 PRIM2P49643 509 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-601P-201ENST00000384540 GAD2Q05329 585 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-601P-201ENST00000384540 KRT81Q14533 505 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-601P-201ENST00000384540 ASIC2Q16515 512 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-601P-201ENST00000384540 MAPKAPK3Q16644 382 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-601P-201ENST00000384540 TTC39AQ5SRH9 613 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-601P-201ENST00000384540 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
RNU6-601P-201ENST00000384540 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
RNU6-601P-201ENST00000384540 KRT27Q7Z3Y8 459 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-601P-201ENST00000384540 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
RNU6-601P-201ENST00000384540 IQCF1Q8N6M8 205 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-601P-201ENST00000384540 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-601P-201ENST00000384540 ATP2A3Q93084 1043 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-601P-201ENST00000384540 FAR2Q96K12 515 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-601P-201ENST00000384540 ZNF347Q96SE7 839 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-601P-201ENST00000384540 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
RNU6-601P-201ENST00000384540 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-601P-201ENST00000384540 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
RNU6-601P-201ENST00000384540 AAMDCQ9H7C9 122 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-601P-201ENST00000384540 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-601P-201ENST00000384540 SPAG4Q9NPE6 437 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-601P-201ENST00000384540 STARD7Q9NQZ5 370 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-601P-201ENST00000384540 GJB4Q9NTQ9 266 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-601P-201ENST00000384540 SLC8A2Q9UPR5 921 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-601P-201ENST00000384540 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-601P-201ENST00000384540 GAGE12JA6NER3 117 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-601P-201ENST00000384540 FOXO6A8MYZ6 492 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-601P-201ENST00000384540 KAT7O95251 611 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-601P-201ENST00000384540 ITGA5P08648 1049 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-601P-201ENST00000384540 IGFBP2P18065 325 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-601P-201ENST00000384540 TNFRSF8P28908 595 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-601P-201ENST00000384540 CIITAP33076 1130 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-601P-201ENST00000384540 SLC37A1P57057 533 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-601P-201ENST00000384540 EGR4Q05215 589 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-601P-201ENST00000384540 CSHL1Q14406 222 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-601P-201ENST00000384540 P3H1Q32P28 736 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-601P-201ENST00000384540 WDR93Q6P2C0 686 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-601P-201ENST00000384540 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-601P-201ENST00000384540 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-601P-201ENST00000384540 RASGRP3Q8IV61 690 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-601P-201ENST00000384540 EXD3Q8N9H8 876 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-601P-201ENST00000384540 GLIS1Q8NBF1 620 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-601P-201ENST00000384540 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-601P-201ENST00000384540 TMEM174Q8WUU8 243 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-601P-201ENST00000384540 OIT3Q8WWZ8 545 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-601P-201ENST00000384540 INPP5DQ92835 1189 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-601P-201ENST00000384540 VPS33BQ9H267 617 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-601P-201ENST00000384540 MAP6D1Q9H9H5 199 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-601P-201ENST00000384540 CD93Q9NPY3 652 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-601P-201ENST00000384540 FSCN3Q9NQT6 498 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-601P-201ENST00000384540 ICKQ9UPZ9 632 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-601P-201ENST00000384540 DTNAQ9Y4J8 743 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-601P-201ENST00000384540 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-601P-201ENST00000384540 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-601P-201ENST00000384540 FAM234BA2RU67 622 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-601P-201ENST00000384540 J3KTA2 159 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-601P-201ENST00000384540 NKX2-8O15522 239 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-601P-201ENST00000384540 KLKB1P03952 638 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-601P-201ENST00000384540 SRGAP2BP0DMP2 458 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-601P-201ENST00000384540 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
RNU6-601P-201ENST00000384540 MLH1P40692 756 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-601P-201ENST00000384540 KCNJ4P48050 445 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-601P-201ENST00000384540 RASSF2P50749 326 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-601P-201ENST00000384540 LTBQ06643 244 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-601P-201ENST00000384540 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
RNU6-601P-201ENST00000384540 PMS2P11Q13670 270 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-601P-201ENST00000384540 SLC35G1Q2M3R5 365 aa3.04□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.2 ms