RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375175.1

TMOD1-202, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TMOD1, Length 2,516 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-202ENST00000375175 CBLBQ13191 982 aa13.56□□□□□ -0.24
TMOD1-202ENST00000375175 ZNF534Q76KX8 674 aa13.56□□□□□ -0.24
TMOD1-202ENST00000375175 NME8Q8N427 588 aa13.56□□□□□ -0.24
TMOD1-202ENST00000375175 MIPOL1Q8TD10 442 aa13.56□□□□□ -0.24
TMOD1-202ENST00000375175 APBB2Q92870 758 aa13.56□□□□□ -0.24
TMOD1-202ENST00000375175 C7orf26Q96N11 449 aa13.56□□□□□ -0.24
TMOD1-202ENST00000375175 RILPQ96NA2 401 aa13.56□□□□□ -0.24
TMOD1-202ENST00000375175 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
TMOD1-202ENST00000375175 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
TMOD1-202ENST00000375175 HES2Q9Y543 173 aa13.56□□□□□ -0.24
TMOD1-202ENST00000375175 F8W8V4 182 aa13.56□□□□□ -0.24
TMOD1-202ENST00000375175 BUD23O43709 281 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
TMOD1-202ENST00000375175 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
TMOD1-202ENST00000375175 TPSB2P20231 275 aa13.56□□□□□ -0.24
TMOD1-202ENST00000375175 ADCYAP1R1P41586 468 aa13.56□□□□□ -0.24
TMOD1-202ENST00000375175 AQP5P55064 265 aa13.56□□□□□ -0.24
TMOD1-202ENST00000375175 MAP7Q14244 749 aa13.56□□□□□ -0.24
TMOD1-202ENST00000375175 TPSAB1Q15661 275 aa13.56□□□□□ -0.24
TMOD1-202ENST00000375175 DPYSL2Q16555 572 aa13.56□□□□□ -0.24
TMOD1-202ENST00000375175 SOWAHAQ2M3V2 549 aa13.56□□□□□ -0.24
TMOD1-202ENST00000375175 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa13.56□□□□□ -0.24
TMOD1-202ENST00000375175 BSPRYQ5W0U4 402 aa13.56□□□□□ -0.24
TMOD1-202ENST00000375175 CES4AQ5XG92 561 aa13.56□□□□□ -0.24
TMOD1-202ENST00000375175 TAPT1Q6NXT6 567 aa13.56□□□□□ -0.24
TMOD1-202ENST00000375175 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa13.56□□□□□ -0.24
TMOD1-202ENST00000375175 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
TMOD1-202ENST00000375175 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa13.56□□□□□ -0.24
TMOD1-202ENST00000375175 SCUBE1Q8IWY4 988 aa13.56□□□□□ -0.24
TMOD1-202ENST00000375175 UNC5BQ8IZJ1 945 aa13.56□□□□□ -0.24
TMOD1-202ENST00000375175 CCDC185Q8N715 623 aa13.56□□□□□ -0.24
TMOD1-202ENST00000375175 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP13.56□□□□□ -0.24
TMOD1-202ENST00000375175 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
TMOD1-202ENST00000375175 BEST2Q8NFU1 509 aa13.56□□□□□ -0.24
TMOD1-202ENST00000375175 NLGN2Q8NFZ4 835 aa13.56□□□□□ -0.24
TMOD1-202ENST00000375175 CSPG4P5Q96PW8 444 aa13.56□□□□□ -0.24
TMOD1-202ENST00000375175 APOL6Q9BWW8 343 aa13.56□□□□□ -0.24
TMOD1-202ENST00000375175 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
TMOD1-202ENST00000375175 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
TMOD1-202ENST00000375175 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa13.56□□□□□ -0.24
TMOD1-202ENST00000375175 WDR27A2RRH5 827 aa13.55□□□□□ -0.24
TMOD1-202ENST00000375175 CRHR1P34998 444 aa13.55□□□□□ -0.24
TMOD1-202ENST00000375175 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
TMOD1-202ENST00000375175 PTPN9P43378 593 aa13.55□□□□□ -0.24
TMOD1-202ENST00000375175 NR2C2P49116 596 aa13.55□□□□□ -0.24
TMOD1-202ENST00000375175 SERPINB9P50453 376 aa13.55□□□□□ -0.24
TMOD1-202ENST00000375175 CRADDP78560 199 aa13.55□□□□□ -0.24
TMOD1-202ENST00000375175 STX3Q13277 289 aa13.55□□□□□ -0.24
TMOD1-202ENST00000375175 GRIK4Q16099 956 aa13.55□□□□□ -0.24
TMOD1-202ENST00000375175 ULK2Q8IYT8 1036 aa13.55□□□□□ -0.24
TMOD1-202ENST00000375175 PYROXD2Q8N2H3 581 aa13.55□□□□□ -0.24
TMOD1-202ENST00000375175 NETO2Q8NC67 525 aa13.55□□□□□ -0.24
TMOD1-202ENST00000375175 PPTC7Q8NI37 304 aa13.55□□□□□ -0.24
TMOD1-202ENST00000375175 SHKBP1Q8TBC3 707 aa13.55□□□□□ -0.24
TMOD1-202ENST00000375175 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
TMOD1-202ENST00000375175 WWP1Q9H0M0 922 aa13.55□□□□□ -0.24
TMOD1-202ENST00000375175 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
TMOD1-202ENST00000375175 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
TMOD1-202ENST00000375175 SIRPGQ9P1W8 387 aa13.55□□□□□ -0.24
TMOD1-202ENST00000375175 HMX2A2RU54 273 aa13.55□□□□□ -0.24
TMOD1-202ENST00000375175 MAGEC1O60732 1142 aa13.55□□□□□ -0.24
TMOD1-202ENST00000375175 CIB2O75838 187 aa13.55□□□□□ -0.24
TMOD1-202ENST00000375175 BPGMP07738 259 aa13.55□□□□□ -0.24
TMOD1-202ENST00000375175 CYP2C8P10632 490 aa13.55□□□□□ -0.24
TMOD1-202ENST00000375175 GOT1P17174 413 aa13.55□□□□□ -0.24
TMOD1-202ENST00000375175 MAGEA3P43357 314 aa13.55□□□□□ -0.24
TMOD1-202ENST00000375175 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
TMOD1-202ENST00000375175 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
TMOD1-202ENST00000375175 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
TMOD1-202ENST00000375175 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
TMOD1-202ENST00000375175 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa13.55□□□□□ -0.24
TMOD1-202ENST00000375175 C16orf46Q6P387 395 aa13.55□□□□□ -0.24
TMOD1-202ENST00000375175 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
TMOD1-202ENST00000375175 CATSPER4Q7RTX7 472 aa13.55□□□□□ -0.24
TMOD1-202ENST00000375175 RASSF3Q86WH2 238 aa13.55□□□□□ -0.24
TMOD1-202ENST00000375175 TREML1Q86YW5 311 aa13.55□□□□□ -0.24
TMOD1-202ENST00000375175 OR6Y1Q8NGX8 325 aa13.55□□□□□ -0.24
TMOD1-202ENST00000375175 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
TMOD1-202ENST00000375175 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP13.55□□□□□ -0.24
TMOD1-202ENST00000375175 LGMNQ99538 433 aa13.55□□□□□ -0.24
TMOD1-202ENST00000375175 C16orf70Q9BSU1 422 aa13.55□□□□□ -0.24
TMOD1-202ENST00000375175 THTPAQ9BU02 230 aa13.55□□□□□ -0.24
TMOD1-202ENST00000375175 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
TMOD1-202ENST00000375175 MTMR10Q9NXD2 777 aa13.55□□□□□ -0.24
TMOD1-202ENST00000375175 DTLQ9NZJ0 730 aa13.55□□□□□ -0.24
TMOD1-202ENST00000375175 GMEB1Q9Y692 573 aa13.55□□□□□ -0.24
TMOD1-202ENST00000375175 OTOFQ9HC10 1997 aa13.55□□□□□ -0.24
TMOD1-202ENST00000375175 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa13.54□□□□□ -0.24
TMOD1-202ENST00000375175 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
TMOD1-202ENST00000375175 TMCC1O94876 653 aa13.54□□□□□ -0.24
TMOD1-202ENST00000375175 ARL4AP40617 200 aa13.54□□□□□ -0.24
TMOD1-202ENST00000375175 ACTR3P61158 418 aa13.54□□□□□ -0.24
TMOD1-202ENST00000375175 KDSRQ06136 332 aa13.54□□□□□ -0.24
TMOD1-202ENST00000375175 BST2Q10589 180 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
TMOD1-202ENST00000375175 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
TMOD1-202ENST00000375175 SFT2D3Q587I9 215 aa13.54□□□□□ -0.24
TMOD1-202ENST00000375175 C1orf146Q5VVC0 180 aa13.54□□□□□ -0.24
TMOD1-202ENST00000375175 SLC26A9Q7LBE3 791 aa13.54□□□□□ -0.24
TMOD1-202ENST00000375175 PDSS2Q86YH6 399 aa13.54□□□□□ -0.24
TMOD1-202ENST00000375175 HTR3CQ8WXA8 447 aa13.54□□□□□ -0.24
TMOD1-202ENST00000375175 C20orf27Q9GZN8 174 aa13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.4 ms