RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373212.5

SH3BGRL-201, Transcript of SH3 domain binding glutamate rich protein like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BGRL, Length 1,923 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRL-201ENST00000373212 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
SH3BGRL-201ENST00000373212 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
SH3BGRL-201ENST00000373212 SMOC2Q9H3U7 446 aa6.78□□□□□ -1.32
SH3BGRL-201ENST00000373212 MKNK2Q9HBH9 465 aa6.78□□□□□ -1.32
SH3BGRL-201ENST00000373212 TMEM140Q9NV12 185 aa6.78□□□□□ -1.32
SH3BGRL-201ENST00000373212 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
SH3BGRL-201ENST00000373212 SORCS3Q9UPU3 1222 aa6.78□□□□□ -1.32
SH3BGRL-201ENST00000373212 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa6.78□□□□□ -1.32
SH3BGRL-201ENST00000373212 VPS13AQ96RL7 3174 aa6.77□□□□□ -1.32
SH3BGRL-201ENST00000373212 CEP250Q9BV73 2442 aa6.77□□□□□ -1.33
SH3BGRL-201ENST00000373212 UNC5CO95185 931 aa6.77□□□□□ -1.33
SH3BGRL-201ENST00000373212 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
SH3BGRL-201ENST00000373212 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
SH3BGRL-201ENST00000373212 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
SH3BGRL-201ENST00000373212 CYP4F8P98187 520 aa6.77□□□□□ -1.33
SH3BGRL-201ENST00000373212 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
SH3BGRL-201ENST00000373212 PPP2R5CQ13362 524 aa6.77□□□□□ -1.33
SH3BGRL-201ENST00000373212 WTAPQ15007 396 aa6.77□□□□□ -1.33
SH3BGRL-201ENST00000373212 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
SH3BGRL-201ENST00000373212 KIAA0408Q6ZU52 694 aa6.77□□□□□ -1.33
SH3BGRL-201ENST00000373212 TMTC3Q6ZXV5 915 aa6.77□□□□□ -1.33
SH3BGRL-201ENST00000373212 ARMC8Q8IUR7 673 aa6.77□□□□□ -1.33
SH3BGRL-201ENST00000373212 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
SH3BGRL-201ENST00000373212 CCDC28AQ8IWP9 274 aa6.77□□□□□ -1.33
SH3BGRL-201ENST00000373212 NDUFAF2Q8N183 169 aa6.77□□□□□ -1.33
SH3BGRL-201ENST00000373212 C8orf58Q8NAV2 365 aa6.77□□□□□ -1.33
SH3BGRL-201ENST00000373212 REPS2Q8NFH8 660 aa6.77□□□□□ -1.33
SH3BGRL-201ENST00000373212 SPSB4Q96A44 273 aa6.77□□□□□ -1.33
SH3BGRL-201ENST00000373212 CDHR1Q96JP9 859 aa6.77□□□□□ -1.33
SH3BGRL-201ENST00000373212 RNPEPQ9H4A4 650 aa6.77□□□□□ -1.33
SH3BGRL-201ENST00000373212 NOD2Q9HC29 1040 aa6.77□□□□□ -1.33
SH3BGRL-201ENST00000373212 DTLQ9NZJ0 730 aa6.77□□□□□ -1.33
SH3BGRL-201ENST00000373212 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
SH3BGRL-201ENST00000373212 NUDT5Q9UKK9 219 aa6.77□□□□□ -1.33
SH3BGRL-201ENST00000373212 DAPP1Q9UN19 280 aa6.77□□□□□ -1.33
SH3BGRL-201ENST00000373212 ACTL7AQ9Y615 435 aa6.77□□□□□ -1.33
SH3BGRL-201ENST00000373212 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
SH3BGRL-201ENST00000373212 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
SH3BGRL-201ENST00000373212 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
SH3BGRL-201ENST00000373212 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
SH3BGRL-201ENST00000373212 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
SH3BGRL-201ENST00000373212 ZNF839A8K0R7 811 aa6.76□□□□□ -1.33
SH3BGRL-201ENST00000373212 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa6.76□□□□□ -1.33
SH3BGRL-201ENST00000373212 N4BP3O15049 544 aa6.76□□□□□ -1.33
SH3BGRL-201ENST00000373212 LRG1P02750 347 aa6.76□□□□□ -1.33
SH3BGRL-201ENST00000373212 CSF1P09603 554 aa6.76□□□□□ -1.33
SH3BGRL-201ENST00000373212 C1QTNF9P0C862 333 aa6.76□□□□□ -1.33
SH3BGRL-201ENST00000373212 UCP3P55916 312 aa6.76□□□□□ -1.33
SH3BGRL-201ENST00000373212 DLG4P78352 724 aa6.76□□□□□ -1.33
SH3BGRL-201ENST00000373212 ATP8B2P98198 1209 aa6.76□□□□□ -1.33
SH3BGRL-201ENST00000373212 BFSP2Q13515 415 aa6.76□□□□□ -1.33
SH3BGRL-201ENST00000373212 LAPTM4AQ15012 233 aa6.76□□□□□ -1.33
SH3BGRL-201ENST00000373212 RASA2Q15283 850 aa6.76□□□□□ -1.33
SH3BGRL-201ENST00000373212 RPS6KA2Q15349 733 aa6.76□□□□□ -1.33
SH3BGRL-201ENST00000373212 GPR68Q15743 365 aa6.76□□□□□ -1.33
SH3BGRL-201ENST00000373212 BTBD16Q32M84 506 aa6.76□□□□□ -1.33
SH3BGRL-201ENST00000373212 CTXN3Q4LDR2 81 aa6.76□□□□□ -1.33
SH3BGRL-201ENST00000373212 SNX30Q5VWJ9 437 aa6.76□□□□□ -1.33
SH3BGRL-201ENST00000373212 NUGGCQ68CJ6 796 aa6.76□□□□□ -1.33
SH3BGRL-201ENST00000373212 TLK2Q86UE8 772 aa6.76□□□□□ -1.33
SH3BGRL-201ENST00000373212 OR7D4Q8NG98 312 aa6.76□□□□□ -1.33
SH3BGRL-201ENST00000373212 SSH3Q8TE77 659 aa6.76□□□□□ -1.33
SH3BGRL-201ENST00000373212 ZNF480Q8WV37 535 aa6.76□□□□□ -1.33
SH3BGRL-201ENST00000373212 SUSD6Q92537 303 aa6.76□□□□□ -1.33
SH3BGRL-201ENST00000373212 STAMQ92783 540 aa6.76□□□□□ -1.33
SH3BGRL-201ENST00000373212 BTBD2Q9BX70 525 aa6.76□□□□□ -1.33
SH3BGRL-201ENST00000373212 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa6.76□□□□□ -1.33
SH3BGRL-201ENST00000373212 BCO1Q9HAY6 547 aa6.76□□□□□ -1.33
SH3BGRL-201ENST00000373212 CD248Q9HCU0 757 aa6.76□□□□□ -1.33
SH3BGRL-201ENST00000373212 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
SH3BGRL-201ENST00000373212 H7C0S8 307 aa6.76□□□□□ -1.33
SH3BGRL-201ENST00000373212 SLC30A4O14863 429 aa6.76□□□□□ -1.33
SH3BGRL-201ENST00000373212 GRM6O15303 877 aa6.76□□□□□ -1.33
SH3BGRL-201ENST00000373212 TMEM63AO94886 807 aa6.76□□□□□ -1.33
SH3BGRL-201ENST00000373212 CXCL10P02778 98 aa6.76□□□□□ -1.33
SH3BGRL-201ENST00000373212 SBK3P0C264 359 aa6.76□□□□□ -1.33
SH3BGRL-201ENST00000373212 CKBP12277 381 aa6.76□□□□□ -1.33
SH3BGRL-201ENST00000373212 BTF3P20290 206 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
SH3BGRL-201ENST00000373212 SLC11A2P49281 568 aa6.76□□□□□ -1.33
SH3BGRL-201ENST00000373212 CTXN1P60606 82 aa6.76□□□□□ -1.33
SH3BGRL-201ENST00000373212 KRT83P78385 493 aa6.76□□□□□ -1.33
SH3BGRL-201ENST00000373212 CD83Q01151 205 aa6.76□□□□□ -1.33
SH3BGRL-201ENST00000373212 MTM1Q13496 603 aa6.76□□□□□ -1.33
SH3BGRL-201ENST00000373212 SLC29A2Q14542 456 aa6.76□□□□□ -1.33
SH3BGRL-201ENST00000373212 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP6.76□□□□□ -1.33
SH3BGRL-201ENST00000373212 KDELC2Q7Z4H8 507 aa6.76□□□□□ -1.33
SH3BGRL-201ENST00000373212 NPAS3Q8IXF0 933 aa6.76□□□□□ -1.33
SH3BGRL-201ENST00000373212 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa6.76□□□□□ -1.33
SH3BGRL-201ENST00000373212 ZNF384Q8TF68 577 aa6.76□□□□□ -1.33
SH3BGRL-201ENST00000373212 DNAAF4Q8WXU2 420 aa6.76□□□□□ -1.33
SH3BGRL-201ENST00000373212 PEX11GQ96HA9 241 aa6.76□□□□□ -1.33
SH3BGRL-201ENST00000373212 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
SH3BGRL-201ENST00000373212 RTP3Q9BQQ7 232 aa6.76□□□□□ -1.33
SH3BGRL-201ENST00000373212 REEP2Q9BRK0 252 aa6.76□□□□□ -1.33
SH3BGRL-201ENST00000373212 KATNBL1Q9H079 304 aa6.76□□□□□ -1.33
SH3BGRL-201ENST00000373212 PDCL3Q9H2J4 239 aa6.76□□□□□ -1.33
SH3BGRL-201ENST00000373212 ADAMTS10Q9H324 1103 aa6.76□□□□□ -1.33
SH3BGRL-201ENST00000373212 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
SH3BGRL-201ENST00000373212 TRPS1Q9UHF7 1281 aa6.76□□□□□ -1.33
SH3BGRL-201ENST00000373212 ACAD8Q9UKU7 415 aa6.76□□□□□ -1.33
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