RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368213.9

PTPRK-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRK, Length 5,816 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-205ENST00000368213 DENND1BQ6P3S1 775 aa11.01□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 USP27XA6NNY8 438 aa11□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 CCNE2O96020 404 aa11□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 TPH1P17752 444 aa11□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 GCKP35557 465 aa11□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 SEC13P55735 322 aa11□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 HTRA3P83110 453 aa11□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 PFKPQ01813 784 aa11□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 TAF10Q12962 218 aa11□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 TMC5Q6UXY8 1006 aa11□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 MON1AQ86VX9 555 aa11□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 HTR3CQ8WXA8 447 aa11□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 GLMNQ92990 594 aa11□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 SLC35C1Q96A29 364 aa11□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 TBL1YQ9BQ87 522 aa11□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 HPS4Q9NQG7 708 aa11□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 SHOC2Q9UQ13 582 aa11□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 CASZ1Q86V15 1759 aa11□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 A0A1B0GUA9 196 aa11□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 EVPLLA8MZ36 301 aa11□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 SYN3O14994 580 aa11□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 FKBP9O95302 570 aa11□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 C8AP07357 584 aa11□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 SLC10A3P09131 477 aa11□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 MAPK1P28482 360 aa11□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 NR2C2P49116 596 aa11□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 KYNUQ16719 465 aa11□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 VSTM1Q6UX27 236 aa11□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 FKBP9P1Q75LS8 142 aa11□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 MAGEC3Q8TD91 643 aa11□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 GPAMQ9HCL2 828 aa11□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 MGAT4DA6NG13 374 aa11□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 SERPINB8P50452 374 aa11□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 DLG4P78352 724 aa11□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 SH3D19Q5HYK7 790 aa11□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 PRR23BQ6ZRT6 265 aa11□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 PRUNE1Q86TP1 453 aa11□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 PACSIN1Q9BY11 444 aa11□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 YY1AP1Q9H869 796 aa11□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 ARL5CA6NH57 179 aa11□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 F8W810 466 aa11□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 GRM6O15303 877 aa11□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 GUCA1CO95843 209 aa11□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 GGCXP38435 758 aa11□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 KCNK10P57789 538 aa11□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 TEAD4Q15561 434 aa11□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 WDR24Q96S15 920 aa11□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 C17orf80Q9BSJ5 609 aa11□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 KCNK1O00180 336 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 TSPAN1O60635 241 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 PRIM2P49643 509 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 ITGA9Q13797 1035 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 CBWD6Q4V339 395 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 MPPE1Q53F39 396 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 ACTR8Q9H981 624 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 AHSPQ9NZD4 102 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 GULP1Q9UBP9 304 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 PTPRJQ12913 1337 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 PER2O15055 1255 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 PFKMP08237 780 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 RFC2P35250 354 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 PMS1P54277 932 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 STRA8Q7Z7C7 330 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 CAMKK1Q8N5S9 505 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 C3orf20Q8ND61 904 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 ERP44Q9BS26 406 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 A0A1W2PQY0 241 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 TRIM49D1C9J1S8 452 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 KELP23276 732 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 MIPP30301 263 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 SAPCD2Q86UD0 394 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 ARMC2Q8NEN0 867 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 PRKD2Q9BZL6 878 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 ELOVL6Q9H5J4 265 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 PLK2Q9NYY3 685 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRK-205ENST00000368213 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.8 ms