RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366365.2

SNHG20-201, Transcript of small nucleolar RNA host gene 20, humanhuman

TSL 2

Gene SNHG20, Length 1,028 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG20-201ENST00000366365 BMT2Q1RMZ1 405 aa11.14□□□□□ -0.63
SNHG20-201ENST00000366365 SOWAHAQ2M3V2 549 aa11.14□□□□□ -0.63
SNHG20-201ENST00000366365 PRRT3Q5FWE3 981 aa11.14□□□□□ -0.63
SNHG20-201ENST00000366365 STXBP5Q5T5C0 1151 aa11.14□□□□□ -0.63
SNHG20-201ENST00000366365 SHC4Q6S5L8 630 aa11.14□□□□□ -0.63
SNHG20-201ENST00000366365 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa11.14□□□□□ -0.63
SNHG20-201ENST00000366365 LIMS2Q7Z4I7 341 aa11.14□□□□□ -0.63
SNHG20-201ENST00000366365 CBWD2Q8IUF1 395 aa11.14□□□□□ -0.63
SNHG20-201ENST00000366365 SCN4BQ8IWT1 228 aa11.14□□□□□ -0.63
SNHG20-201ENST00000366365 AHI1Q8N157 1196 aa11.14□□□□□ -0.63
SNHG20-201ENST00000366365 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa11.14□□□□□ -0.63
SNHG20-201ENST00000366365 CAMKK1Q8N5S9 505 aa11.14□□□□□ -0.63
SNHG20-201ENST00000366365 PDZD8Q8NEN9 1154 aa11.14□□□□□ -0.63
SNHG20-201ENST00000366365 CXorf38Q8TB03 319 aa11.14□□□□□ -0.63
SNHG20-201ENST00000366365 RIN3Q8TB24 985 aa11.14□□□□□ -0.63
SNHG20-201ENST00000366365 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa11.14□□□□□ -0.63
SNHG20-201ENST00000366365 TMEM174Q8WUU8 243 aa11.14□□□□□ -0.63
SNHG20-201ENST00000366365 KCTD13Q8WZ19 329 aa11.14□□□□□ -0.63
SNHG20-201ENST00000366365 TNIP3Q96KP6 325 aa11.14□□□□□ -0.63
SNHG20-201ENST00000366365 FAM83CQ9BQN1 747 aa11.14□□□□□ -0.63
SNHG20-201ENST00000366365 YIPF2Q9BWQ6 316 aa11.14□□□□□ -0.63
SNHG20-201ENST00000366365 ELOVL4Q9GZR5 314 aa11.14□□□□□ -0.63
SNHG20-201ENST00000366365 AKTIPQ9H8T0 292 aa11.14□□□□□ -0.63
SNHG20-201ENST00000366365 GTSE1Q9NYZ3 720 aa11.14□□□□□ -0.63
SNHG20-201ENST00000366365 SIX4Q9UIU6 781 aa11.14□□□□□ -0.63
SNHG20-201ENST00000366365 SLC8A2Q9UPR5 921 aa11.14□□□□□ -0.63
SNHG20-201ENST00000366365 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa11.14□□□□□ -0.63
SNHG20-201ENST00000366365 MYO15AQ9UKN7 3530 aa11.14□□□□□ -0.63
SNHG20-201ENST00000366365 ZNF292O60281 2723 aa11.14□□□□□ -0.63
SNHG20-201ENST00000366365 VPS13AQ96RL7 3174 aa11.13□□□□□ -0.63
SNHG20-201ENST00000366365 SHISA7A6NL88 538 aa11.13□□□□□ -0.63
SNHG20-201ENST00000366365 AKAP3O75969 853 aa11.13□□□□□ -0.63
SNHG20-201ENST00000366365 KCNH1O95259 989 aa11.13□□□□□ -0.63
SNHG20-201ENST00000366365 PRAMEF12O95522 483 aa11.13□□□□□ -0.63
SNHG20-201ENST00000366365 NFATC1O95644 943 aa11.13□□□□□ -0.63
SNHG20-201ENST00000366365 RPN1P04843 607 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
SNHG20-201ENST00000366365 HDCP19113 662 aa11.13□□□□□ -0.63
SNHG20-201ENST00000366365 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
SNHG20-201ENST00000366365 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
SNHG20-201ENST00000366365 CYP24A1Q07973 514 aa11.13□□□□□ -0.63
SNHG20-201ENST00000366365 MAP4K2Q12851 820 aa11.13□□□□□ -0.63
SNHG20-201ENST00000366365 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
SNHG20-201ENST00000366365 MTF1Q14872 753 aa11.13□□□□□ -0.63
SNHG20-201ENST00000366365 PON2Q15165 354 aa11.13□□□□□ -0.63
SNHG20-201ENST00000366365 WDR72Q3MJ13 1102 aa11.13□□□□□ -0.63
SNHG20-201ENST00000366365 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
SNHG20-201ENST00000366365 RESP18Q5W5W9 173 aa11.13□□□□□ -0.63
SNHG20-201ENST00000366365 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
SNHG20-201ENST00000366365 TXNDC8Q6A555 127 aa11.13□□□□□ -0.63
SNHG20-201ENST00000366365 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa11.13□□□□□ -0.63
SNHG20-201ENST00000366365 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa11.13□□□□□ -0.63
SNHG20-201ENST00000366365 C11orf74Q86VG3 221 aa11.13□□□□□ -0.63
SNHG20-201ENST00000366365 STKLD1Q8NE28 680 aa11.13□□□□□ -0.63
SNHG20-201ENST00000366365 OR6B3Q8NGW1 331 aa11.13□□□□□ -0.63
SNHG20-201ENST00000366365 OVCA2Q8WZ82 227 aa11.13□□□□□ -0.63
SNHG20-201ENST00000366365 TAF4BQ92750 862 aa11.13□□□□□ -0.63
SNHG20-201ENST00000366365 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
SNHG20-201ENST00000366365 RSPRY1Q96DX4 576 aa11.13□□□□□ -0.63
SNHG20-201ENST00000366365 LOXL4Q96JB6 756 aa11.13□□□□□ -0.63
SNHG20-201ENST00000366365 C8orf48Q96LL4 319 aa11.13□□□□□ -0.63
SNHG20-201ENST00000366365 SLITRK1Q96PX8 696 aa11.13□□□□□ -0.63
SNHG20-201ENST00000366365 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa11.13□□□□□ -0.63
SNHG20-201ENST00000366365 PKMYT1Q99640 499 aa11.13□□□□□ -0.63
SNHG20-201ENST00000366365 TRPC7Q9HCX4 862 aa11.13□□□□□ -0.63
SNHG20-201ENST00000366365 EXOC1Q9NV70 894 aa11.13□□□□□ -0.63
SNHG20-201ENST00000366365 COMMD8Q9NX08 183 aa11.13□□□□□ -0.63
SNHG20-201ENST00000366365 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
SNHG20-201ENST00000366365 NDOR1Q9UHB4 597 aa11.13□□□□□ -0.63
SNHG20-201ENST00000366365 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa11.13□□□□□ -0.63
SNHG20-201ENST00000366365 MIA3Q5JRA6 1907 aa11.13□□□□□ -0.63
SNHG20-201ENST00000366365 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa11.13□□□□□ -0.63
SNHG20-201ENST00000366365 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
SNHG20-201ENST00000366365 TDGF1P13385 188 aa11.12□□□□□ -0.63
SNHG20-201ENST00000366365 CPEP16870 476 aa11.12□□□□□ -0.63
SNHG20-201ENST00000366365 HOXC12P31275 282 aa11.12□□□□□ -0.63
SNHG20-201ENST00000366365 CYP2J2P51589 502 aa11.12□□□□□ -0.63
SNHG20-201ENST00000366365 NOP14P78316 857 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
SNHG20-201ENST00000366365 CYP27A1Q02318 531 aa11.12□□□□□ -0.63
SNHG20-201ENST00000366365 TMEM196Q5HYL7 178 aa11.12□□□□□ -0.63
SNHG20-201ENST00000366365 CDPF1Q6NVV7 123 aa11.12□□□□□ -0.63
SNHG20-201ENST00000366365 TSSK4Q6SA08 328 aa11.12□□□□□ -0.63
SNHG20-201ENST00000366365 CEP68Q76N32 757 aa11.12□□□□□ -0.63
SNHG20-201ENST00000366365 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
SNHG20-201ENST00000366365 TMEM150AQ86TG1 271 aa11.12□□□□□ -0.63
SNHG20-201ENST00000366365 WDR5BQ86VZ2 330 aa11.12□□□□□ -0.63
SNHG20-201ENST00000366365 OR5B17Q8NGF7 314 aa11.12□□□□□ -0.63
SNHG20-201ENST00000366365 ATL2Q8NHH9 583 aa11.12□□□□□ -0.63
SNHG20-201ENST00000366365 OSCP1Q8WVF1 389 aa11.12□□□□□ -0.63
SNHG20-201ENST00000366365 SCFD1Q8WVM8 642 aa11.12□□□□□ -0.63
SNHG20-201ENST00000366365 MYLPFQ96A32 169 aa11.12□□□□□ -0.63
SNHG20-201ENST00000366365 CCDC127Q96BQ5 260 aa11.12□□□□□ -0.63
SNHG20-201ENST00000366365 P2RY13Q9BPV8 354 aa11.12□□□□□ -0.63
SNHG20-201ENST00000366365 RTKNQ9BST9 563 aa11.12□□□□□ -0.63
SNHG20-201ENST00000366365 TTLL2Q9BWV7 592 aa11.12□□□□□ -0.63
SNHG20-201ENST00000366365 PRDM14Q9GZV8 571 aa11.12□□□□□ -0.63
SNHG20-201ENST00000366365 IKZF4Q9H2S9 585 aa11.12□□□□□ -0.63
SNHG20-201ENST00000366365 SEMA6CQ9H3T2 930 aa11.12□□□□□ -0.63
SNHG20-201ENST00000366365 TMLHEQ9NVH6 421 aa11.12□□□□□ -0.63
SNHG20-201ENST00000366365 DLL3Q9NYJ7 618 aa11.12□□□□□ -0.63
SNHG20-201ENST00000366365 RCOR1Q9UKL0 485 aa11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.8 ms