RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326294.3

PTPRCAP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRCAP, Length 1,292 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAP-201ENST00000326294 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 PARD6AQ9NPB6 346 aa20.26■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP20.26■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 INVSQ9Y283 1065 aa20.26■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 GOLGA8SH3BPF8 625 aa20.25■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 M0QYT0 321 aa20.25■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 NPC1O15118 1278 aa20.25■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC2A3P11169 496 aa20.25■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 BCKDHBP21953 392 aa20.25■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 MMP8P22894 467 aa20.25■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 FLT3P36888 993 aa20.25■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 SULT1E1P49888 294 aa20.25■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 ARID5AQ03989 594 aa20.25■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF234Q14588 700 aa20.25■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa20.25■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 FILIP1LQ4L180 1135 aa20.25■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 CHST9Q7L1S5 443 aa20.25■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 ADIPOR2Q86V24 386 aa20.25■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 AHI1Q8N157 1196 aa20.25■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 CFAP52Q8N1V2 620 aa20.25■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 BAP1Q92560 729 aa20.25■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 NT5C3BQ969T7 300 aa20.25■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 PIGVQ9NUD9 493 aa20.25■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 RRN3Q9NYV6 651 aa20.25■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM59LQ9UK28 342 aa20.25■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 STAP1Q9ULZ2 295 aa20.25■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 A0A1W2PQC6 194 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 EPN2O95208 641 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 UNGP13051 313 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 NDUFV2P19404 249 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 ABCB4P21439 1286 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRKCHP24723 683 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 P2RY2P41231 377 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 CENPCQ03188 943 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 SPEM2Q0P670 501 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 FUT11Q495W5 492 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC30A5Q8TAD4 765 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 FIBINQ8TAL6 211 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 RLN3Q8WXF3 142 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 RNF34Q969K3 372 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 LOXL4Q96JB6 756 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 C11orf70Q9BRQ4 267 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 THADAQ6YHU6 1953 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 F5H5T6 163 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 TIMM44O43615 452 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 LMAN2Q12907 356 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 PTP4A2Q12974 167 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 PTPRNQ16849 979 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 MAP7D1Q3KQU3 841 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 PMS2CLQ68D20 193 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 MBLAC2Q68D91 279 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 C11orf74Q86VG3 221 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 PGBD3Q8N328 593 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 CARNMT1Q8N4J0 409 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 FRMD1Q8N878 549 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 TBCBQ99426 244 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC6A17Q9H1V8 727 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 ANLNQ9NQW6 1124 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 MYO6Q9UM54 1294 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 I6L893 689 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 LRP3O75074 770 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 PAGE1O75459 146 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 FERP16591 822 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 GGCXP38435 758 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 CXCR3P49682 368 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 CDH18Q13634 790 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 STARD3Q14849 445 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 E2F5Q15329 346 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 ELF2Q15723 593 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC25A52Q3SY17 297 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 FSCBQ5H9T9 825 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 ARCQ7LC44 396 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 BNIPLQ7Z465 357 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 SPACA7Q96KW9 195 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 AGPAT1Q99943 283 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 TTYH3Q9C0H2 523 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 USP18Q9UMW8 372 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 HS3ST4Q9Y661 456 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 DMXL1Q9Y485 3027 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 NUP205Q92621 2012 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 LRRC53A6NM62 1247 aa20.21■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 ADCY5O95622 1261 aa20.21■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 CAVIN2O95810 425 aa20.21■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 SERPINC1P01008 464 aa20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.4 ms