RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296387.5

CLDN19-201, Transcript of claudin 19, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CLDN19, Length 2,859 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19-201ENST00000296387 SLC6A3Q01959 620 aa13□□□□□ -0.33
CLDN19-201ENST00000296387 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
CLDN19-201ENST00000296387 SEMA5AQ13591 1074 aa13□□□□□ -0.33
CLDN19-201ENST00000296387 AMHR2Q16671 573 aa13□□□□□ -0.33
CLDN19-201ENST00000296387 DCAF15Q66K64 600 aa13□□□□□ -0.33
CLDN19-201ENST00000296387 DLK2Q6UY11 383 aa13□□□□□ -0.33
CLDN19-201ENST00000296387 SATL1Q86VE3 508 aa13□□□□□ -0.33
CLDN19-201ENST00000296387 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
CLDN19-201ENST00000296387 PPP4R1Q8TF05 950 aa13□□□□□ -0.33
CLDN19-201ENST00000296387 ARNTL2Q8WYA1 636 aa13□□□□□ -0.33
CLDN19-201ENST00000296387 GCNAQ96QF7 691 aa13□□□□□ -0.33
CLDN19-201ENST00000296387 NT5C1AQ9BXI3 368 aa13□□□□□ -0.33
CLDN19-201ENST00000296387 SYBUQ9NX95 663 aa13□□□□□ -0.33
CLDN19-201ENST00000296387 PTPRFP10586 1907 aa13□□□□□ -0.33
CLDN19-201ENST00000296387 CAPN8A6NHC0 703 aa12.99□□□□□ -0.33
CLDN19-201ENST00000296387 RALBP11234 206 aa12.99□□□□□ -0.33
CLDN19-201ENST00000296387 TYK2P29597 1187 aa12.99□□□□□ -0.33
CLDN19-201ENST00000296387 PGGT1BP53609 377 aa12.99□□□□□ -0.33
CLDN19-201ENST00000296387 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
CLDN19-201ENST00000296387 TMEM132DQ14C87 1099 aa12.99□□□□□ -0.33
CLDN19-201ENST00000296387 MMEL1Q495T6 779 aa12.99□□□□□ -0.33
CLDN19-201ENST00000296387 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa12.99□□□□□ -0.33
CLDN19-201ENST00000296387 NAPRTQ6XQN6 538 aa12.99□□□□□ -0.33
CLDN19-201ENST00000296387 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
CLDN19-201ENST00000296387 ZNF781Q8N8C0 355 aa12.99□□□□□ -0.33
CLDN19-201ENST00000296387 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa12.99□□□□□ -0.33
CLDN19-201ENST00000296387 MAPK15Q8TD08 544 aa12.99□□□□□ -0.33
CLDN19-201ENST00000296387 ACTRT2Q8TDY3 377 aa12.99□□□□□ -0.33
CLDN19-201ENST00000296387 FAM167AQ96KS9 214 aa12.99□□□□□ -0.33
CLDN19-201ENST00000296387 CSPG4P5Q96PW8 444 aa12.99□□□□□ -0.33
CLDN19-201ENST00000296387 CYP3A43Q9HB55 503 aa12.99□□□□□ -0.33
CLDN19-201ENST00000296387 COPG2Q9UBF2 871 aa12.99□□□□□ -0.33
CLDN19-201ENST00000296387 ITGA11Q9UKX5 1188 aa12.99□□□□□ -0.33
CLDN19-201ENST00000296387 PCDHGB4Q9UN71 923 aa12.99□□□□□ -0.33
CLDN19-201ENST00000296387 AP4E1Q9UPM8 1137 aa12.99□□□□□ -0.33
CLDN19-201ENST00000296387 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa12.99□□□□□ -0.33
CLDN19-201ENST00000296387 A0A087WZ62 844 aa12.99□□□□□ -0.33
CLDN19-201ENST00000296387 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa12.99□□□□□ -0.33
CLDN19-201ENST00000296387 GOLGA8OA6NCC3 632 aa12.99□□□□□ -0.33
CLDN19-201ENST00000296387 C19orf81C9J6K1 198 aa12.99□□□□□ -0.33
CLDN19-201ENST00000296387 GOLGA8NF8WBI6 632 aa12.99□□□□□ -0.33
CLDN19-201ENST00000296387 H3BNX3 289 aa12.99□□□□□ -0.33
CLDN19-201ENST00000296387 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
CLDN19-201ENST00000296387 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa12.99□□□□□ -0.33
CLDN19-201ENST00000296387 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa12.99□□□□□ -0.33
CLDN19-201ENST00000296387 TP53INP2Q8IXH6 220 aa12.99□□□□□ -0.33
CLDN19-201ENST00000296387 C7orf31Q8N865 590 aa12.99□□□□□ -0.33
CLDN19-201ENST00000296387 HTR3CQ8WXA8 447 aa12.99□□□□□ -0.33
CLDN19-201ENST00000296387 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP12.99□□□□□ -0.33
CLDN19-201ENST00000296387 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
CLDN19-201ENST00000296387 CENPKQ9BS16 269 aa12.99□□□□□ -0.33
CLDN19-201ENST00000296387 ZNF112Q9UJU3 913 aa12.99□□□□□ -0.33
CLDN19-201ENST00000296387 SORCS3Q9UPU3 1222 aa12.99□□□□□ -0.33
CLDN19-201ENST00000296387 DPYSL4O14531 572 aa12.99□□□□□ -0.33
CLDN19-201ENST00000296387 MDM4O15151 490 aa12.99□□□□□ -0.33
CLDN19-201ENST00000296387 USP12O75317 370 aa12.99□□□□□ -0.33
CLDN19-201ENST00000296387 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
CLDN19-201ENST00000296387 DLG2Q15700 870 aa12.99□□□□□ -0.33
CLDN19-201ENST00000296387 SOWAHAQ2M3V2 549 aa12.99□□□□□ -0.33
CLDN19-201ENST00000296387 CHST13Q8NET6 341 aa12.99□□□□□ -0.33
CLDN19-201ENST00000296387 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
CLDN19-201ENST00000296387 SPATA33Q96N06 139 aa12.99□□□□□ -0.33
CLDN19-201ENST00000296387 EPAS1Q99814 870 aa12.99□□□□□ -0.33
CLDN19-201ENST00000296387 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
CLDN19-201ENST00000296387 PDZD7Q9H5P4 517 aa12.99□□□□□ -0.33
CLDN19-201ENST00000296387 COG4Q9H9E3 785 aa12.99□□□□□ -0.33
CLDN19-201ENST00000296387 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa12.99□□□□□ -0.33
CLDN19-201ENST00000296387 DPP3Q9NY33 737 aa12.99□□□□□ -0.33
CLDN19-201ENST00000296387 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa12.99□□□□□ -0.33
CLDN19-201ENST00000296387 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa12.98□□□□□ -0.33
CLDN19-201ENST00000296387 ALDH1A2O94788 518 aa12.98□□□□□ -0.33
CLDN19-201ENST00000296387 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
CLDN19-201ENST00000296387 COX4I1P13073 169 aa12.98□□□□□ -0.33
CLDN19-201ENST00000296387 P4HA1P13674 534 aa12.98□□□□□ -0.33
CLDN19-201ENST00000296387 LCP1P13796 627 aa12.98□□□□□ -0.33
CLDN19-201ENST00000296387 EDNRBP24530 442 aa12.98□□□□□ -0.33
CLDN19-201ENST00000296387 PSMB4P28070 264 aa12.98□□□□□ -0.33
CLDN19-201ENST00000296387 SERPINB5P36952 375 aa12.98□□□□□ -0.33
CLDN19-201ENST00000296387 CCR10P46092 362 aa12.98□□□□□ -0.33
CLDN19-201ENST00000296387 IRF9Q00978 393 aa12.98□□□□□ -0.33
CLDN19-201ENST00000296387 INCA1Q0VD86 236 aa12.98□□□□□ -0.33
CLDN19-201ENST00000296387 PDK3Q15120 406 aa12.98□□□□□ -0.33
CLDN19-201ENST00000296387 STEAP4Q687X5 459 aa12.98□□□□□ -0.33
CLDN19-201ENST00000296387 ADAM32Q8TC27 787 aa12.98□□□□□ -0.33
CLDN19-201ENST00000296387 ATP2A3Q93084 1043 aa12.98□□□□□ -0.33
CLDN19-201ENST00000296387 OR52B2Q96RD2 323 aa12.98□□□□□ -0.33
CLDN19-201ENST00000296387 TBCBQ99426 244 aa12.98□□□□□ -0.33
CLDN19-201ENST00000296387 DPEP3Q9H4B8 488 aa12.98□□□□□ -0.33
CLDN19-201ENST00000296387 CAB39LQ9H9S4 337 aa12.98□□□□□ -0.33
CLDN19-201ENST00000296387 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP12.98□□□□□ -0.33
CLDN19-201ENST00000296387 DNAJC28Q9NX36 388 aa12.98□□□□□ -0.33
CLDN19-201ENST00000296387 CLIC5Q9NZA1 410 aa12.98□□□□□ -0.33
CLDN19-201ENST00000296387 COX16Q9P0S2 106 aa12.98□□□□□ -0.33
CLDN19-201ENST00000296387 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP12.98□□□□□ -0.33
CLDN19-201ENST00000296387 SNX9Q9Y5X1 595 aa12.98□□□□□ -0.33
CLDN19-201ENST00000296387 SCN1AP35498 2009 aa12.98□□□□□ -0.33
CLDN19-201ENST00000296387 MFSD11O43934 449 aa12.98□□□□□ -0.33
CLDN19-201ENST00000296387 VTNP04004 478 aa12.98□□□□□ -0.33
CLDN19-201ENST00000296387 ATICP31939 592 aa12.98□□□□□ -0.33
CLDN19-201ENST00000296387 BTKQ06187 659 aa12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.1 ms