RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285679.10

USP25-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 3,973 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-201ENST00000285679 ETV4P43268 484 aa15.69■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 IDH3AP50213 366 aa15.69■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa15.69■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP15.69■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 TSPAN14Q8NG11 270 aa15.69■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 SLC4A5Q9BY07 1137 aa15.69■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 WDR41Q9HAD4 459 aa15.69■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 CCDC167Q9P0B6 97 aa15.69■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP15.69■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 PIGNO95427 931 aa15.69■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 METTL18O95568 372 aa15.69■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 ASLP04424 464 aa15.69■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP15.69■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 GK3PQ14409 553 aa15.69■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 STXBP2Q15833 593 aa15.69■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP15.69■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 TSPAN16Q9UKR8 245 aa15.69■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 CDYLQ9Y232 598 aa15.69■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 NAMPTP43490 491 aa15.69■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 PLK1P53350 603 aa15.69■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 SLC18A2Q05940 514 aa15.69■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 ITKQ08881 620 aa15.69■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 NOMO1Q15155 1222 aa15.69■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 TLR1Q15399 786 aa15.69■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 TBC1D25Q3MII6 688 aa15.69■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa15.69■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 NUP93Q8N1F7 819 aa15.69■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 ITFG2Q969R8 447 aa15.69■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 OMDQ99983 421 aa15.69■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 B3GNT5Q9BYG0 378 aa15.69■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa15.69■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 XPOTO43592 962 aaKnown RBP15.68■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 TRMUO75648 421 aaKnown RBP15.68■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 CRTAMO95727 393 aa15.68■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 TGM2P21980 687 aa15.68■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 ME2P23368 584 aa15.68■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 MPSTP25325 297 aa15.68■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 SPRP35270 261 aaPredicted RBP15.68■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP15.68■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 CDH15P55291 814 aa15.68■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 BOLA3Q53S33 107 aa15.68■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 FAM160B1Q5W0V3 765 aa15.68■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP15.68■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 TMC7Q7Z402 723 aa15.68■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 PLD5Q8N7P1 536 aa15.68■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP15.68■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 CIB1Q99828 191 aa15.68■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP15.68■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP15.68■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 EFCAB1Q9HAE3 211 aa15.68■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 RRN3Q9NYV6 651 aa15.68■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 PSMD13Q9UNM6 376 aa15.68■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP15.68■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 SLC15A5A6NIM6 579 aa15.68■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP15.68■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 ITGAXP20702 1163 aa15.68■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 CLCN3P51790 818 aa15.68■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 LSAMPQ13449 338 aa15.68■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 ATF7IP2Q5U623 682 aa15.68■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 JADE1Q6IE81 842 aa15.68■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa15.68■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 HPDLQ96IR7 371 aa15.68■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP15.68■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 HMGXB4Q9UGU5 601 aa15.68■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 WDR46O15213 610 aaKnown RBP15.68■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 RFPL1O75677 317 aa15.68■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 PSMD7P51665 324 aa15.68■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 RALGDSQ12967 914 aa15.68■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 OLIG2Q13516 323 aa15.68■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 CCNIQ14094 377 aa15.68■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa15.68■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP15.68■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa15.68■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 LAMB1P07942 1786 aa15.68■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 CRHR1P34998 444 aa15.68■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 THOP1P52888 689 aa15.68■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 STX1BP61266 288 aa15.68■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 TGFB2P61812 414 aa15.68■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 GLRA4Q5JXX5 417 aa15.68■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 WDR49Q8IV35 697 aa15.68■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 BRSK2Q8IWQ3 736 aa15.68■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP15.68■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 TMEM176AQ96HP8 235 aa15.68■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 FAM210AQ96ND0 272 aa15.68■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 CCDC106Q9BWC9 280 aa15.68■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP15.67■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 ADORA2AP29274 412 aa15.67■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 NDST1P52848 882 aa15.67■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 TMEM62Q0P6H9 643 aa15.67■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 SURF1Q15526 300 aa15.67■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 CA9Q16790 459 aa15.67■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 PACS1Q6VY07 963 aa15.67■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa15.67■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 GPR141Q7Z602 305 aa15.67■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 FBXL18Q96ME1 805 aa15.67■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 OR52B2Q96RD2 323 aa15.67■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP15.67■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 MED10Q9BTT4 135 aa15.67■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 B4GALT5O43286 388 aa15.67■□□□□ 0.1
USP25-201ENST00000285679 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.9 ms