RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000274711.6

LRRTM2-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM2, Length 6,017 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2-201ENST00000274711 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
LRRTM2-201ENST00000274711 CDK8P49336 464 aa3.44□□□□□ -1.86
LRRTM2-201ENST00000274711 EFNA5P52803 228 aa3.44□□□□□ -1.86
LRRTM2-201ENST00000274711 GJA9P57773 515 aa3.44□□□□□ -1.86
LRRTM2-201ENST00000274711 CYP4F2P78329 520 aa3.44□□□□□ -1.86
LRRTM2-201ENST00000274711 DLG4P78352 724 aa3.44□□□□□ -1.86
LRRTM2-201ENST00000274711 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
LRRTM2-201ENST00000274711 PPP2R2BQ00005 443 aa3.44□□□□□ -1.86
LRRTM2-201ENST00000274711 CYP4F3Q08477 520 aa3.44□□□□□ -1.86
LRRTM2-201ENST00000274711 VPS72Q15906 364 aa3.44□□□□□ -1.86
LRRTM2-201ENST00000274711 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
LRRTM2-201ENST00000274711 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
LRRTM2-201ENST00000274711 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
LRRTM2-201ENST00000274711 GLRA4Q5JXX5 417 aa3.44□□□□□ -1.86
LRRTM2-201ENST00000274711 FNBP1LQ5T0N5 605 aa3.44□□□□□ -1.86
LRRTM2-201ENST00000274711 FAXCQ5TGI0 409 aa3.44□□□□□ -1.86
LRRTM2-201ENST00000274711 PLET1Q6UQ28 207 aa3.44□□□□□ -1.86
LRRTM2-201ENST00000274711 MFSD7Q6UXD7 560 aa3.44□□□□□ -1.86
LRRTM2-201ENST00000274711 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa3.44□□□□□ -1.86
LRRTM2-201ENST00000274711 PAGE2Q7Z2X7 111 aa3.44□□□□□ -1.86
LRRTM2-201ENST00000274711 SLCO6A1Q86UG4 719 aa3.44□□□□□ -1.86
LRRTM2-201ENST00000274711 NT5DC4Q86YG4 428 aa3.44□□□□□ -1.86
LRRTM2-201ENST00000274711 FAM126BQ8IXS8 530 aa3.44□□□□□ -1.86
LRRTM2-201ENST00000274711 DEPDC4Q8N2C3 294 aa3.44□□□□□ -1.86
LRRTM2-201ENST00000274711 FBXW8Q8N3Y1 598 aa3.44□□□□□ -1.86
LRRTM2-201ENST00000274711 RNF148Q8N7C7 305 aa3.44□□□□□ -1.86
LRRTM2-201ENST00000274711 FNDC5Q8NAU1 212 aa3.44□□□□□ -1.86
LRRTM2-201ENST00000274711 PYDC1Q8WXC3 89 aa3.44□□□□□ -1.86
LRRTM2-201ENST00000274711 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP3.44□□□□□ -1.86
LRRTM2-201ENST00000274711 HIST1H2ACQ93077 130 aa3.44□□□□□ -1.86
LRRTM2-201ENST00000274711 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
LRRTM2-201ENST00000274711 SLC38A2Q96QD8 506 aa3.44□□□□□ -1.86
LRRTM2-201ENST00000274711 CCDC3Q9BQI4 270 aa3.44□□□□□ -1.86
LRRTM2-201ENST00000274711 TBCDQ9BTW9 1192 aa3.44□□□□□ -1.86
LRRTM2-201ENST00000274711 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
LRRTM2-201ENST00000274711 MND1Q9BWT6 205 aa3.44□□□□□ -1.86
LRRTM2-201ENST00000274711 CST11Q9H112 138 aa3.44□□□□□ -1.86
LRRTM2-201ENST00000274711 PTPRHQ9HD43 1115 aa3.44□□□□□ -1.86
LRRTM2-201ENST00000274711 SEC31BQ9NQW1 1179 aa3.44□□□□□ -1.86
LRRTM2-201ENST00000274711 BTG4Q9NY30 223 aa3.44□□□□□ -1.86
LRRTM2-201ENST00000274711 WHRNQ9P202 907 aa3.44□□□□□ -1.86
LRRTM2-201ENST00000274711 PI4KBQ9UBF8 816 aa3.44□□□□□ -1.86
LRRTM2-201ENST00000274711 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP3.44□□□□□ -1.86
LRRTM2-201ENST00000274711 SNX7Q9UNH6 387 aa3.44□□□□□ -1.86
LRRTM2-201ENST00000274711 DMTF1Q9Y222 760 aa3.44□□□□□ -1.86
LRRTM2-201ENST00000274711 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
LRRTM2-201ENST00000274711 ALG6Q9Y672 507 aa3.44□□□□□ -1.86
LRRTM2-201ENST00000274711 SMARCA4P51532 1647 aa3.44□□□□□ -1.86
LRRTM2-201ENST00000274711 ABCC1P33527 1531 aa3.44□□□□□ -1.86
LRRTM2-201ENST00000274711 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa3.44□□□□□ -1.86
LRRTM2-201ENST00000274711 USP17L5A8MUK1 530 aa3.44□□□□□ -1.86
LRRTM2-201ENST00000274711 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
LRRTM2-201ENST00000274711 PLIN3O60664 434 aa3.44□□□□□ -1.86
LRRTM2-201ENST00000274711 KDM4BO94953 1096 aa3.44□□□□□ -1.86
LRRTM2-201ENST00000274711 KCNH1O95259 989 aa3.44□□□□□ -1.86
LRRTM2-201ENST00000274711 MT-CO1P00395 513 aa3.44□□□□□ -1.86
LRRTM2-201ENST00000274711 SERPINE1P05121 402 aa3.44□□□□□ -1.86
LRRTM2-201ENST00000274711 PRKCBP05771 671 aa3.44□□□□□ -1.86
LRRTM2-201ENST00000274711 UQCRBP14927 111 aa3.44□□□□□ -1.86
LRRTM2-201ENST00000274711 UCHL3P15374 230 aa3.44□□□□□ -1.86
LRRTM2-201ENST00000274711 IL13P35225 146 aa3.44□□□□□ -1.86
LRRTM2-201ENST00000274711 HPCAL1P37235 193 aa3.44□□□□□ -1.86
LRRTM2-201ENST00000274711 IREB2P48200 963 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
LRRTM2-201ENST00000274711 HARS2P49590 506 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
LRRTM2-201ENST00000274711 GALK1P51570 392 aa3.44□□□□□ -1.86
LRRTM2-201ENST00000274711 MAPK7Q13164 816 aa3.44□□□□□ -1.86
LRRTM2-201ENST00000274711 PLD1Q13393 1074 aa3.44□□□□□ -1.86
LRRTM2-201ENST00000274711 IL18Q14116 193 aa3.44□□□□□ -1.86
LRRTM2-201ENST00000274711 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP3.44□□□□□ -1.86
LRRTM2-201ENST00000274711 HMBOX1Q6NT76 420 aa3.44□□□□□ -1.86
LRRTM2-201ENST00000274711 FAM171BQ6P995 826 aa3.44□□□□□ -1.86
LRRTM2-201ENST00000274711 AFTPHQ6ULP2 937 aa3.44□□□□□ -1.86
LRRTM2-201ENST00000274711 SMIM5Q71RC9 77 aa3.44□□□□□ -1.86
LRRTM2-201ENST00000274711 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa3.44□□□□□ -1.86
LRRTM2-201ENST00000274711 ARPINQ7Z6K5 226 aa3.44□□□□□ -1.86
LRRTM2-201ENST00000274711 SNX32Q86XE0 403 aa3.44□□□□□ -1.86
LRRTM2-201ENST00000274711 PHACTR4Q8IZ21 702 aa3.44□□□□□ -1.86
LRRTM2-201ENST00000274711 OFCC1Q8IZS5 231 aa3.44□□□□□ -1.86
LRRTM2-201ENST00000274711 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
LRRTM2-201ENST00000274711 OXER1Q8TDS5 423 aa3.44□□□□□ -1.86
LRRTM2-201ENST00000274711 PIGKQ92643 395 aa3.44□□□□□ -1.86
LRRTM2-201ENST00000274711 KAT2BQ92831 832 aa3.44□□□□□ -1.86
LRRTM2-201ENST00000274711 PMM1Q92871 262 aa3.44□□□□□ -1.86
LRRTM2-201ENST00000274711 GMCL1Q96IK5 515 aa3.44□□□□□ -1.86
LRRTM2-201ENST00000274711 ART5Q96L15 291 aa3.44□□□□□ -1.86
LRRTM2-201ENST00000274711 VPS35Q96QK1 796 aa3.44□□□□□ -1.86
LRRTM2-201ENST00000274711 TRIM2Q9C040 744 aa3.44□□□□□ -1.86
LRRTM2-201ENST00000274711 GREM2Q9H772 168 aa3.44□□□□□ -1.86
LRRTM2-201ENST00000274711 LRRC40Q9H9A6 602 aa3.44□□□□□ -1.86
LRRTM2-201ENST00000274711 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP3.44□□□□□ -1.86
LRRTM2-201ENST00000274711 HPF1Q9NWY4 346 aa3.44□□□□□ -1.86
LRRTM2-201ENST00000274711 SLC24A2Q9UI40 661 aa3.44□□□□□ -1.86
LRRTM2-201ENST00000274711 INVSQ9Y283 1065 aa3.44□□□□□ -1.86
LRRTM2-201ENST00000274711 AP3M1Q9Y2T2 418 aa3.44□□□□□ -1.86
LRRTM2-201ENST00000274711 LEMD3Q9Y2U8 911 aa3.44□□□□□ -1.86
LRRTM2-201ENST00000274711 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa3.43□□□□□ -1.86
LRRTM2-201ENST00000274711 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa3.43□□□□□ -1.86
LRRTM2-201ENST00000274711 PPM1BO75688 479 aa3.43□□□□□ -1.86
LRRTM2-201ENST00000274711 C9P02748 559 aa3.43□□□□□ -1.86
LRRTM2-201ENST00000274711 ITGALP20701 1170 aa3.43□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.9 ms