RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000271628.8

SF3B4-201, Transcript of splicing factor 3b subunit 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SF3B4, Length 2,085 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B4-201ENST00000271628 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa15.77■□□□□ 0.12
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SF3B4-201ENST00000271628 RASA4O43374 803 aa15.74■□□□□ 0.11
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SF3B4-201ENST00000271628 PGLYRP2Q96PD5 576 aa15.74■□□□□ 0.11
SF3B4-201ENST00000271628 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
SF3B4-201ENST00000271628 TTPALQ9BTX7 342 aa15.74■□□□□ 0.11
SF3B4-201ENST00000271628 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa15.74■□□□□ 0.11
SF3B4-201ENST00000271628 SCN5AQ14524 2016 aa15.74■□□□□ 0.11
SF3B4-201ENST00000271628 A0A1W2PQH9 124 aa15.74■□□□□ 0.11
SF3B4-201ENST00000271628 FAM92AA1XBS5 289 aa15.74■□□□□ 0.11
SF3B4-201ENST00000271628 TBC1D4O60343 1298 aa15.74■□□□□ 0.11
SF3B4-201ENST00000271628 SLC2A3P11169 496 aa15.74■□□□□ 0.11
SF3B4-201ENST00000271628 MLNP12872 115 aa15.74■□□□□ 0.11
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