RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000254190.3

CHSY1-201, Transcript of chondroitin sulfate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CHSY1, Length 4,550 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHSY1-201ENST00000254190 PTPRAP18433 802 aa24.55■■□□□ 1.52
CHSY1-201ENST00000254190 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
CHSY1-201ENST00000254190 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
CHSY1-201ENST00000254190 ASMTLO95671 621 aa24.55■■□□□ 1.52
CHSY1-201ENST00000254190 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa24.55■■□□□ 1.52
CHSY1-201ENST00000254190 SPANXN3Q5MJ09 141 aa24.55■■□□□ 1.52
CHSY1-201ENST00000254190 KIAA2013Q8IYS2 634 aa24.55■■□□□ 1.52
CHSY1-201ENST00000254190 MIER2Q8N344 545 aa24.55■■□□□ 1.52
CHSY1-201ENST00000254190 CDT1Q9H211 546 aa24.55■■□□□ 1.52
CHSY1-201ENST00000254190 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
CHSY1-201ENST00000254190 CASZ1Q86V15 1759 aa24.55■■□□□ 1.52
CHSY1-201ENST00000254190 INPP4BO15327 924 aa24.55■■□□□ 1.52
CHSY1-201ENST00000254190 CYBBP04839 570 aa24.55■■□□□ 1.52
CHSY1-201ENST00000254190 FITM2Q8N6M3 262 aa24.55■■□□□ 1.52
CHSY1-201ENST00000254190 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
CHSY1-201ENST00000254190 CROTQ9UKG9 612 aa24.55■■□□□ 1.52
CHSY1-201ENST00000254190 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
CHSY1-201ENST00000254190 MRASO14807 208 aa24.54■■□□□ 1.52
CHSY1-201ENST00000254190 TPBGLP0DKB5 382 aa24.54■■□□□ 1.52
CHSY1-201ENST00000254190 ATP6V1B2P21281 511 aa24.54■■□□□ 1.52
CHSY1-201ENST00000254190 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
CHSY1-201ENST00000254190 HORMAD1Q86X24 394 aa24.54■■□□□ 1.52
CHSY1-201ENST00000254190 C12orf56Q8IXR9 622 aa24.54■■□□□ 1.52
CHSY1-201ENST00000254190 C12orf29Q8N999 325 aa24.54■■□□□ 1.52
CHSY1-201ENST00000254190 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa24.54■■□□□ 1.52
CHSY1-201ENST00000254190 A0A0A0MRY4 1105 aa24.54■■□□□ 1.52
CHSY1-201ENST00000254190 SLC12A8A0AV02 714 aa24.54■■□□□ 1.52
CHSY1-201ENST00000254190 POMCP01189 267 aa24.54■■□□□ 1.52
CHSY1-201ENST00000254190 MMP8P22894 467 aa24.54■■□□□ 1.52
CHSY1-201ENST00000254190 PPP3CCP48454 512 aa24.54■■□□□ 1.52
CHSY1-201ENST00000254190 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
CHSY1-201ENST00000254190 SYTL3Q4VX76 610 aa24.54■■□□□ 1.52
CHSY1-201ENST00000254190 HELQQ8TDG4 1101 aa24.54■■□□□ 1.52
CHSY1-201ENST00000254190 SPATA13Q96N96 652 aa24.54■■□□□ 1.52
CHSY1-201ENST00000254190 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
CHSY1-201ENST00000254190 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
CHSY1-201ENST00000254190 B4GALT5O43286 388 aa24.54■■□□□ 1.52
CHSY1-201ENST00000254190 PLA2G6O60733 806 aa24.54■■□□□ 1.52
CHSY1-201ENST00000254190 SERPIND1P05546 499 aa24.54■■□□□ 1.52
CHSY1-201ENST00000254190 CDK7P50613 346 aa24.54■■□□□ 1.52
CHSY1-201ENST00000254190 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
CHSY1-201ENST00000254190 ADRM1Q16186 407 aa24.54■■□□□ 1.52
CHSY1-201ENST00000254190 SLC16A10Q8TF71 515 aa24.54■■□□□ 1.52
CHSY1-201ENST00000254190 ULBP1Q9BZM6 244 aa24.54■■□□□ 1.52
CHSY1-201ENST00000254190 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa24.54■■□□□ 1.52
CHSY1-201ENST00000254190 RECQL4O94761 1208 aa24.54■■□□□ 1.52
CHSY1-201ENST00000254190 SCNN1BP51168 640 aa24.54■■□□□ 1.52
CHSY1-201ENST00000254190 SLC1A5Q15758 541 aa24.54■■□□□ 1.52
CHSY1-201ENST00000254190 PRDM12Q9H4Q4 367 aa24.54■■□□□ 1.52
CHSY1-201ENST00000254190 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa24.54■■□□□ 1.52
CHSY1-201ENST00000254190 CCNE2O96020 404 aa24.53■■□□□ 1.52
CHSY1-201ENST00000254190 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
CHSY1-201ENST00000254190 MFSD5Q6N075 450 aa24.53■■□□□ 1.52
CHSY1-201ENST00000254190 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
CHSY1-201ENST00000254190 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa24.53■■□□□ 1.52
CHSY1-201ENST00000254190 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa24.53■■□□□ 1.52
CHSY1-201ENST00000254190 PEX1O43933 1283 aa24.53■■□□□ 1.52
CHSY1-201ENST00000254190 S100A5P33763 92 aa24.53■■□□□ 1.52
CHSY1-201ENST00000254190 JAM2P57087 298 aa24.53■■□□□ 1.52
CHSY1-201ENST00000254190 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
CHSY1-201ENST00000254190 LGMNQ99538 433 aa24.53■■□□□ 1.52
CHSY1-201ENST00000254190 DPYSL4O14531 572 aa24.53■■□□□ 1.52
CHSY1-201ENST00000254190 NPY2RP49146 381 aa24.53■■□□□ 1.52
CHSY1-201ENST00000254190 ECHDC2Q86YB7 292 aa24.53■■□□□ 1.52
CHSY1-201ENST00000254190 ZNF398Q8TD17 642 aa24.53■■□□□ 1.52
CHSY1-201ENST00000254190 ZNF556Q9HAH1 456 aa24.53■■□□□ 1.52
CHSY1-201ENST00000254190 SYTL2Q9HCH5 934 aa24.53■■□□□ 1.52
CHSY1-201ENST00000254190 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
CHSY1-201ENST00000254190 MAP3K10Q02779 954 aa24.52■■□□□ 1.52
CHSY1-201ENST00000254190 ARHGEF7Q14155 803 aa24.52■■□□□ 1.52
CHSY1-201ENST00000254190 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
CHSY1-201ENST00000254190 SNX17Q15036 470 aa24.52■■□□□ 1.52
CHSY1-201ENST00000254190 TNS4Q8IZW8 715 aa24.52■■□□□ 1.52
CHSY1-201ENST00000254190 DDHD1Q8NEL9 900 aa24.52■■□□□ 1.52
CHSY1-201ENST00000254190 PLA2G4CQ9UP65 541 aa24.52■■□□□ 1.52
CHSY1-201ENST00000254190 C5orf58C9J3I9 102 aa24.52■■□□□ 1.52
CHSY1-201ENST00000254190 F5H5T6 163 aa24.52■■□□□ 1.52
CHSY1-201ENST00000254190 TMED10P49755 219 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
CHSY1-201ENST00000254190 TUBP50607 506 aa24.52■■□□□ 1.52
CHSY1-201ENST00000254190 HUNKP57058 714 aa24.52■■□□□ 1.52
CHSY1-201ENST00000254190 PARP6Q2NL67 630 aa24.52■■□□□ 1.52
CHSY1-201ENST00000254190 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
CHSY1-201ENST00000254190 LRMDAQ9H2I8 198 aa24.52■■□□□ 1.52
CHSY1-201ENST00000254190 NID2Q14112 1375 aa24.52■■□□□ 1.52
CHSY1-201ENST00000254190 USP17L7P0C7H9 530 aa24.52■■□□□ 1.52
CHSY1-201ENST00000254190 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
CHSY1-201ENST00000254190 NR6A1Q15406 480 aa24.52■■□□□ 1.52
CHSY1-201ENST00000254190 LPCAT2Q7L5N7 544 aa24.52■■□□□ 1.52
CHSY1-201ENST00000254190 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
CHSY1-201ENST00000254190 TRHDEQ9UKU6 1024 aa24.52■■□□□ 1.52
CHSY1-201ENST00000254190 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
CHSY1-201ENST00000254190 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa24.52■■□□□ 1.52
CHSY1-201ENST00000254190 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
CHSY1-201ENST00000254190 TM4SF1P30408 202 aa24.52■■□□□ 1.52
CHSY1-201ENST00000254190 SLC11A2P49281 568 aa24.52■■□□□ 1.52
CHSY1-201ENST00000254190 NUP107P57740 925 aa24.52■■□□□ 1.52
CHSY1-201ENST00000254190 NRF1Q16656 503 aa24.52■■□□□ 1.52
CHSY1-201ENST00000254190 PTPN20Q4JDL3 420 aa24.52■■□□□ 1.52
CHSY1-201ENST00000254190 SLC44A4Q53GD3 710 aa24.52■■□□□ 1.52
CHSY1-201ENST00000254190 MPP4Q96JB8 637 aa24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.7 ms