RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000006777.10

RHBDD2-201, Transcript of rhomboid domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RHBDD2, Length 1,802 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD2-201ENST00000006777 CCDC33Q8N5R6 958 aa22.08■■□□□ 1.12
RHBDD2-201ENST00000006777 CCNYQ8ND76 341 aa22.08■■□□□ 1.12
RHBDD2-201ENST00000006777 GPR152Q8TDT2 470 aa22.08■■□□□ 1.12
RHBDD2-201ENST00000006777 PYROXD1Q8WU10 500 aa22.08■■□□□ 1.12
RHBDD2-201ENST00000006777 LRRN4Q8WUT4 740 aa22.08■■□□□ 1.12
RHBDD2-201ENST00000006777 P2RY11Q96G91 374 aa22.08■■□□□ 1.12
RHBDD2-201ENST00000006777 TMEM106CQ9BVX2 250 aa22.08■■□□□ 1.12
RHBDD2-201ENST00000006777 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
RHBDD2-201ENST00000006777 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
RHBDD2-201ENST00000006777 SNX10Q9Y5X0 201 aa22.08■■□□□ 1.12
RHBDD2-201ENST00000006777 SMIM23A6NLE4 172 aa22.07■■□□□ 1.12
RHBDD2-201ENST00000006777 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
RHBDD2-201ENST00000006777 TPSB2P20231 275 aa22.07■■□□□ 1.12
RHBDD2-201ENST00000006777 HOXC13P31276 330 aa22.07■■□□□ 1.12
RHBDD2-201ENST00000006777 OR1D2P34982 312 aa22.07■■□□□ 1.12
RHBDD2-201ENST00000006777 TAF10Q12962 218 aa22.07■■□□□ 1.12
RHBDD2-201ENST00000006777 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
RHBDD2-201ENST00000006777 TPSAB1Q15661 275 aa22.07■■□□□ 1.12
RHBDD2-201ENST00000006777 LONRF1Q17RB8 773 aa22.07■■□□□ 1.12
RHBDD2-201ENST00000006777 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
RHBDD2-201ENST00000006777 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa22.07■■□□□ 1.12
RHBDD2-201ENST00000006777 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa22.07■■□□□ 1.12
RHBDD2-201ENST00000006777 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa22.07■■□□□ 1.12
RHBDD2-201ENST00000006777 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa22.07■■□□□ 1.12
RHBDD2-201ENST00000006777 CCDC13Q8IYE1 715 aa22.07■■□□□ 1.12
RHBDD2-201ENST00000006777 ATP11CQ8NB49 1132 aa22.07■■□□□ 1.12
RHBDD2-201ENST00000006777 MCUQ8NE86 351 aa22.07■■□□□ 1.12
RHBDD2-201ENST00000006777 SLC39A13Q96H72 371 aa22.07■■□□□ 1.12
RHBDD2-201ENST00000006777 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa22.07■■□□□ 1.12
RHBDD2-201ENST00000006777 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP22.07■■□□□ 1.12
RHBDD2-201ENST00000006777 HSFX1Q9UBD0 423 aa22.07■■□□□ 1.12
RHBDD2-201ENST00000006777 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
RHBDD2-201ENST00000006777 NUDT5Q9UKK9 219 aa22.07■■□□□ 1.12
RHBDD2-201ENST00000006777 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
RHBDD2-201ENST00000006777 MTSS1O43312 755 aa22.06■■□□□ 1.12
RHBDD2-201ENST00000006777 ATP5DP30049 168 aa22.06■■□□□ 1.12
RHBDD2-201ENST00000006777 PHBP35232 272 aa22.06■■□□□ 1.12
RHBDD2-201ENST00000006777 DSG1Q02413 1049 aa22.06■■□□□ 1.12
RHBDD2-201ENST00000006777 SEMA5AQ13591 1074 aa22.06■■□□□ 1.12
RHBDD2-201ENST00000006777 MANEALQ5VSG8 457 aa22.06■■□□□ 1.12
RHBDD2-201ENST00000006777 HDAC11Q96DB2 347 aa22.06■■□□□ 1.12
RHBDD2-201ENST00000006777 TBC1D31Q96DN5 1066 aa22.06■■□□□ 1.12
RHBDD2-201ENST00000006777 TTLL2Q9BWV7 592 aa22.06■■□□□ 1.12
RHBDD2-201ENST00000006777 SIK2Q9H0K1 926 aa22.06■■□□□ 1.12
RHBDD2-201ENST00000006777 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa22.06■■□□□ 1.12
RHBDD2-201ENST00000006777 PPCSQ9HAB8 311 aa22.06■■□□□ 1.12
RHBDD2-201ENST00000006777 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
RHBDD2-201ENST00000006777 SLC38A8A6NNN8 435 aa22.06■■□□□ 1.12
RHBDD2-201ENST00000006777 E7EVH7 732 aa22.06■■□□□ 1.12
RHBDD2-201ENST00000006777 RNF103O00237 685 aa22.06■■□□□ 1.12
RHBDD2-201ENST00000006777 ADAM12O43184 909 aa22.06■■□□□ 1.12
RHBDD2-201ENST00000006777 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
RHBDD2-201ENST00000006777 METTL18O95568 372 aa22.06■■□□□ 1.12
RHBDD2-201ENST00000006777 HPDP32754 393 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
RHBDD2-201ENST00000006777 SLCO1A2P46721 670 aa22.06■■□□□ 1.12
RHBDD2-201ENST00000006777 LBX1P52954 281 aa22.06■■□□□ 1.12
RHBDD2-201ENST00000006777 TBX4P57082 545 aa22.06■■□□□ 1.12
RHBDD2-201ENST00000006777 C1QTNF8P60827 252 aa22.06■■□□□ 1.12
RHBDD2-201ENST00000006777 PPP2R2AP63151 447 aa22.06■■□□□ 1.12
RHBDD2-201ENST00000006777 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
RHBDD2-201ENST00000006777 GALNT2Q10471 571 aa22.06■■□□□ 1.12
RHBDD2-201ENST00000006777 BBS9Q3SYG4 887 aa22.06■■□□□ 1.12
RHBDD2-201ENST00000006777 MSS51Q4VC12 460 aa22.06■■□□□ 1.12
RHBDD2-201ENST00000006777 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
RHBDD2-201ENST00000006777 NPWQ8N729 165 aa22.06■■□□□ 1.12
RHBDD2-201ENST00000006777 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
RHBDD2-201ENST00000006777 C1orf74Q96LT6 269 aa22.06■■□□□ 1.12
RHBDD2-201ENST00000006777 CAPS2Q9BXY5 557 aa22.06■■□□□ 1.12
RHBDD2-201ENST00000006777 VPS37BQ9H9H4 285 aa22.06■■□□□ 1.12
RHBDD2-201ENST00000006777 NEU3Q9UQ49 428 aa22.06■■□□□ 1.12
RHBDD2-201ENST00000006777 CDH16O75309 829 aa22.05■■□□□ 1.12
RHBDD2-201ENST00000006777 APRTP07741 180 aa22.05■■□□□ 1.12
RHBDD2-201ENST00000006777 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa22.05■■□□□ 1.12
RHBDD2-201ENST00000006777 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
RHBDD2-201ENST00000006777 ATF6P18850 670 aa22.05■■□□□ 1.12
RHBDD2-201ENST00000006777 CDK16Q00536 496 aa22.05■■□□□ 1.12
RHBDD2-201ENST00000006777 SKIDA1Q1XH10 827 aa22.05■■□□□ 1.12
RHBDD2-201ENST00000006777 CCDC38Q502W7 563 aa22.05■■□□□ 1.12
RHBDD2-201ENST00000006777 FAXCQ5TGI0 409 aa22.05■■□□□ 1.12
RHBDD2-201ENST00000006777 TPGS2Q68CL5 300 aa22.05■■□□□ 1.12
RHBDD2-201ENST00000006777 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
RHBDD2-201ENST00000006777 FAM117BQ6P1L5 589 aa22.05■■□□□ 1.12
RHBDD2-201ENST00000006777 LZTR1Q8N653 840 aa22.05■■□□□ 1.12
RHBDD2-201ENST00000006777 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa22.05■■□□□ 1.12
RHBDD2-201ENST00000006777 FBXO36Q8NEA4 188 aa22.05■■□□□ 1.12
RHBDD2-201ENST00000006777 SPG21Q9NZD8 308 aa22.05■■□□□ 1.12
RHBDD2-201ENST00000006777 APOEP02649 317 aa22.04■■□□□ 1.12
RHBDD2-201ENST00000006777 SRGAP2BP0DMP2 458 aa22.04■■□□□ 1.12
RHBDD2-201ENST00000006777 RPL17P18621 184 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
RHBDD2-201ENST00000006777 ATP1A2P50993 1020 aa22.04■■□□□ 1.12
RHBDD2-201ENST00000006777 COG7P83436 770 aa22.04■■□□□ 1.12
RHBDD2-201ENST00000006777 ZNF33AQ06730 810 aa22.04■■□□□ 1.12
RHBDD2-201ENST00000006777 EFEMP1Q12805 493 aa22.04■■□□□ 1.12
RHBDD2-201ENST00000006777 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
RHBDD2-201ENST00000006777 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
RHBDD2-201ENST00000006777 ANKMY2Q8IV38 441 aa22.04■■□□□ 1.12
RHBDD2-201ENST00000006777 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
RHBDD2-201ENST00000006777 CLSTN3Q9BQT9 956 aa22.04■■□□□ 1.12
RHBDD2-201ENST00000006777 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
RHBDD2-201ENST00000006777 PRDM10Q9NQV6 1147 aa22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms