RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025354.3

Pggt1b-201, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pggt1b, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Krt27Q9Z320 448 aa13.02□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Szt2A2A9C3 3431 aa13.02□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fam171a2A2A699 822 aa13.02□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fam155bA2BDP1 471 aa13.02□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm10719E9Q7T3 227 aa13.02□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Raph1F2Z3U3 1266 aa13.02□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kbtbd2G3X9X1 623 aa13.02□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sypl2O89104 264 aa13.02□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PhbP67778 272 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Arhgap45Q3TBD2 1116 aa13.02□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Itga1Q3V3R4 1179 aa13.02□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn2r43Q80Z08 845 aa13.02□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hdac7Q8C2B3 938 aa13.02□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ccdc28bQ8CEG5 200 aa13.02□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Eif2b5Q8CHW4 717 aa13.02□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lin7aQ8JZS0 233 aa13.02□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Snx9Q91VH2 595 aa13.02□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sun1Q9D666 913 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hes6Q9JHE6 224 aa13.02□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Msl3Q9WVG9 525 aa13.02□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm3002E9PW72 216 aa13.01□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Adam19O35674 920 aa13.01□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cdh16O88338 830 aa13.01□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lamp2P17047 415 aa13.01□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cntn3Q07409 1028 aa13.01□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pik3r6Q3U6Q4 756 aa13.01□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr8Q60892 310 aa13.01□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Znf185Q62394 352 aa13.01□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 EfsQ64355 560 aa13.01□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1415Q7TQS4 311 aa13.01□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rimbp2Q80U40 1072 aa13.01□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Q8BHN7 327 aa13.01□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pdik1lQ8QZR7 341 aa13.01□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Prrg2Q8R182 198 aa13.01□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Znf426Q8R1D1 550 aa13.01□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1416Q8VGU4 312 aa13.01□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr449Q8VGW8 311 aa13.01□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 B3galt6Q91Z92 325 aa13.01□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ndufaf7Q9CWG8 436 aa13.01□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fam3aQ9D8T0 230 aa13.01□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Plxna1P70206 1894 aa13.01□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ccnyl1D3YUJ3 367 aa13.01□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm10717D3Z1I8 228 aa13.01□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Krt90E9Q1Z0 538 aa13.01□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr743L7N1Y2 311 aa13.01□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 P01644 108 aa13.01□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 P01645 108 aa13.01□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 P01646 108 aa13.01□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 P01647 108 aa13.01□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Smad1P70340 465 aa13.01□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Stx2Q00262 289 aa13.01□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Glt6d1Q2NKH9 311 aa13.01□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Foxd4Q60688 444 aa13.01□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Eif2dQ61211 570 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Arhgap20Q6IFT4 1182 aa13.01□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cpa4Q6P8K8 420 aa13.01□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Acap2Q6ZQK5 770 aa13.01□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kank2Q8BX02 843 aa13.01□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Acvr1cQ8K348 493 aa13.01□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tgif2lx2Q8K5B9 231 aa13.01□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hkdc1Q91W97 915 aa13.01□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rilpl2Q99LE1 197 aa13.01□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PmpcbQ9CXT8 489 aa13.01□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rmi1Q9D4G9 616 aa13.01□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Abt1Q9QYL7 269 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Myo7aP97479 2215 aa13□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nlrc5C3VPR6 1915 aa13□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 C6E9Q6D8 931 aa13□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm3424L7N298 263 aa13□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm8246M0QWX9 263 aa13□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Bmpr2O35607 1038 aa13□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cldn5O54942 218 aa13□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dnase1l3O55070 310 aa13□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gsta4P24472 222 aa13□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cyth2P63034 400 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Neurog2P70447 263 aa13□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 InscQ3HNM7 579 aa13□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Znf746Q3U133 652 aa13□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Elf3Q3UPW2 391 aa13□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sult1d1Q3UZZ6 295 aa13□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmcc1Q69ZZ6 649 aa13□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 N4bp1Q6A037 893 aa13□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fam185aQ7TPD2 378 aa13□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc2a12Q8BFW9 622 aa13□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dars2Q8BIP0 653 aa13□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Aste1Q8BIR2 672 aa13□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Anapc5Q8BTZ4 740 aa13□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Trub1Q8C0D0 338 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Timd2Q8R183 305 aa13□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vwa1Q8R2Z5 415 aa13□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Prkag2Q91WG5 566 aa13□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rnf112Q96DY5 654 aa13□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Q9D9D9 101 aa13□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Chrac1Q9JKP8 129 aa13□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Speer3W4VSP1 261 aa13□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm29133A0A1B0GT72 266 aa13□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Klhl41A2AUC9 606 aa13□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 C130060K24RikG3UWA8 416 aa13□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm379J3QQ19 296 aa13□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 AlplP09242 524 aa13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 19.3 ms