RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639482.1

SPIN3-222, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 3

Gene SPIN3, Length 3,719 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-222	ENST00000639482	SPDYA	Q5MJ70	313 aa		10.35	□□□□□ -0.75
SPIN3-222	ENST00000639482	PDPK2P	Q6A1A2	396 aa		10.35	□□□□□ -0.75
SPIN3-222	ENST00000639482	FAM156A	Q8NDB6	213 aa		10.35	□□□□□ -0.75
SPIN3-222	ENST00000639482	PTPN18	Q99952	460 aa		10.35	□□□□□ -0.75
SPIN3-222	ENST00000639482	SSU72	Q9NP77	194 aa	Known RBP	10.35	□□□□□ -0.75
SPIN3-222	ENST00000639482	DMAP1	Q9NPF5	467 aa	Predicted RBP	10.35	□□□□□ -0.75
SPIN3-222	ENST00000639482	KCNH4	Q9UQ05	1017 aa		10.35	□□□□□ -0.75
SPIN3-222	ENST00000639482	IGKV6D-21	A0A0A0MT36	114 aa		10.34	□□□□□ -0.75
SPIN3-222	ENST00000639482	TRUB2	O95900	331 aa	Known RBP	10.34	□□□□□ -0.75
SPIN3-222	ENST00000639482	LDHA	P00338	332 aa	Known RBP	10.34	□□□□□ -0.75
SPIN3-222	ENST00000639482	ITGB3	P05106	788 aa		10.34	□□□□□ -0.75
SPIN3-222	ENST00000639482	ENO3	P13929	434 aa	Predicted RBP	10.34	□□□□□ -0.75
SPIN3-222	ENST00000639482	INSRR	P14616	1297 aa		10.34	□□□□□ -0.75
SPIN3-222	ENST00000639482	VAV1	P15498	845 aa		10.34	□□□□□ -0.75
SPIN3-222	ENST00000639482	PML	P29590	882 aa		10.34	□□□□□ -0.75
SPIN3-222	ENST00000639482	TYK2	P29597	1187 aa		10.34	□□□□□ -0.75
SPIN3-222	ENST00000639482	MLH1	P40692	756 aa		10.34	□□□□□ -0.75
SPIN3-222	ENST00000639482	DYNC1I2	Q13409	638 aa	Known RBP	10.34	□□□□□ -0.75
SPIN3-222	ENST00000639482	SNAPC2	Q13487	334 aa		10.34	□□□□□ -0.75
SPIN3-222	ENST00000639482	CNGA3	Q16281	694 aa		10.34	□□□□□ -0.75
SPIN3-222	ENST00000639482	RBM44	Q6ZP01	1051 aa	Known RBP	10.34	□□□□□ -0.75
SPIN3-222	ENST00000639482	FRMD7	Q6ZUT3	714 aa		10.34	□□□□□ -0.75
SPIN3-222	ENST00000639482	USP50	Q70EL3	339 aa	Predicted RBP	10.34	□□□□□ -0.75
SPIN3-222	ENST00000639482	TRIM42	Q8IWZ5	723 aa		10.34	□□□□□ -0.75
SPIN3-222	ENST00000639482	ADGRF2	Q8IZF7	708 aa		10.34	□□□□□ -0.75
SPIN3-222	ENST00000639482	DDX51	Q8N8A6	666 aa	Known RBP eCLIP	10.34	□□□□□ -0.75
SPIN3-222	ENST00000639482	PIWIL2	Q8TC59	973 aa	Known RBP	10.34	□□□□□ -0.75
SPIN3-222	ENST00000639482	AZIN2	Q96A70	460 aa		10.34	□□□□□ -0.75
SPIN3-222	ENST00000639482	PRPF18	Q99633	342 aa	Known RBP	10.34	□□□□□ -0.75
SPIN3-222	ENST00000639482	CCDC106	Q9BWC9	280 aa		10.34	□□□□□ -0.75
SPIN3-222	ENST00000639482	RSAD1	Q9HA92	442 aa		10.34	□□□□□ -0.75
SPIN3-222	ENST00000639482	POPDC2	Q9HBU9	364 aa		10.34	□□□□□ -0.75
SPIN3-222	ENST00000639482	PSAT1	Q9Y617	370 aa		10.34	□□□□□ -0.75
SPIN3-222	ENST00000639482		A0A087WZ62	844 aa		10.34	□□□□□ -0.75
SPIN3-222	ENST00000639482	C15orf38-AP3S2	A0A0A6YYH1	394 aa		10.34	□□□□□ -0.75
SPIN3-222	ENST00000639482		E7ESA3	106 aa		10.34	□□□□□ -0.75
SPIN3-222	ENST00000639482	DKC1	O60832	514 aa	Known RBP eCLIP	10.34	□□□□□ -0.75
SPIN3-222	ENST00000639482	CELF2	O95319	508 aa	Known RBP	10.34	□□□□□ -0.75
SPIN3-222	ENST00000639482	AMH	P03971	560 aa		10.34	□□□□□ -0.75
SPIN3-222	ENST00000639482	NAMPT	P43490	491 aa		10.34	□□□□□ -0.75
SPIN3-222	ENST00000639482	MAP7	Q14244	749 aa		10.34	□□□□□ -0.75
SPIN3-222	ENST00000639482	PDCD2	Q16342	344 aa	Predicted RBP	10.34	□□□□□ -0.75
SPIN3-222	ENST00000639482	SLC5A9	Q2M3M2	681 aa		10.34	□□□□□ -0.75
SPIN3-222	ENST00000639482	FAM160B1	Q5W0V3	765 aa		10.34	□□□□□ -0.75
SPIN3-222	ENST00000639482	ARPIN	Q7Z6K5	226 aa		10.34	□□□□□ -0.75
SPIN3-222	ENST00000639482	CAND1	Q86VP6	1230 aa	Known RBP	10.34	□□□□□ -0.75
SPIN3-222	ENST00000639482	XYLT1	Q86Y38	959 aa		10.34	□□□□□ -0.75
SPIN3-222	ENST00000639482	SPNS2	Q8IVW8	549 aa		10.34	□□□□□ -0.75
SPIN3-222	ENST00000639482	SCUBE3	Q8IX30	993 aa		10.34	□□□□□ -0.75
SPIN3-222	ENST00000639482	CCNY	Q8ND76	341 aa		10.34	□□□□□ -0.75
SPIN3-222	ENST00000639482	FDXACB1	Q9BRP7	624 aa	Predicted RBP	10.34	□□□□□ -0.75
SPIN3-222	ENST00000639482	B3GNT5	Q9BYG0	378 aa		10.34	□□□□□ -0.75
SPIN3-222	ENST00000639482	WDR55	Q9H6Y2	383 aa	Predicted RBP	10.34	□□□□□ -0.75
SPIN3-222	ENST00000639482	C17orf75	Q9HAS0	396 aa		10.34	□□□□□ -0.75
SPIN3-222	ENST00000639482	ASNSD1	Q9NWL6	643 aa		10.34	□□□□□ -0.75
SPIN3-222	ENST00000639482	MFHAS1	Q9Y4C4	1052 aa		10.34	□□□□□ -0.75
SPIN3-222	ENST00000639482	DTNA	Q9Y4J8	743 aa		10.34	□□□□□ -0.75
SPIN3-222	ENST00000639482	SLC15A5	A6NIM6	579 aa		10.34	□□□□□ -0.75
SPIN3-222	ENST00000639482	MSC	O60682	206 aa		10.34	□□□□□ -0.75
SPIN3-222	ENST00000639482	MAF	O75444	373 aa	Predicted RBP	10.34	□□□□□ -0.75
SPIN3-222	ENST00000639482	MICAL2	O94851	1124 aa		10.34	□□□□□ -0.75
SPIN3-222	ENST00000639482	HSPA4L	O95757	839 aa		10.34	□□□□□ -0.75
SPIN3-222	ENST00000639482	PRKCB	P05771	671 aa		10.34	□□□□□ -0.75
SPIN3-222	ENST00000639482	SERPINA6	P08185	405 aa		10.34	□□□□□ -0.75
SPIN3-222	ENST00000639482	ERVK-10	P10266	1014 aa		10.34	□□□□□ -0.75
SPIN3-222	ENST00000639482	FOLH1	Q04609	750 aa		10.34	□□□□□ -0.75
SPIN3-222	ENST00000639482	AMHR2	Q16671	573 aa		10.34	□□□□□ -0.75
SPIN3-222	ENST00000639482	PPM1L	Q5SGD2	360 aa		10.34	□□□□□ -0.75
SPIN3-222	ENST00000639482	DPP9	Q86TI2	863 aa		10.34	□□□□□ -0.75
SPIN3-222	ENST00000639482	ZSCAN18	Q8TBC5	510 aa	Predicted RBP	10.34	□□□□□ -0.75
SPIN3-222	ENST00000639482	FAM172A	Q8WUF8	416 aa		10.34	□□□□□ -0.75
SPIN3-222	ENST00000639482	NR1H4	Q96RI1	486 aa	Predicted RBP	10.34	□□□□□ -0.75
SPIN3-222	ENST00000639482	LPIN3	Q9BQK8	851 aa		10.34	□□□□□ -0.75
SPIN3-222	ENST00000639482	FAM49A	Q9H0Q0	323 aa	Predicted RBP	10.34	□□□□□ -0.75
SPIN3-222	ENST00000639482	COPS7B	Q9H9Q2	264 aa	Predicted RBP	10.34	□□□□□ -0.75
SPIN3-222	ENST00000639482	GALNT8	Q9NY28	637 aa		10.34	□□□□□ -0.75
SPIN3-222	ENST00000639482	CDH22	Q9UJ99	828 aa		10.34	□□□□□ -0.75
SPIN3-222	ENST00000639482	AKT3	Q9Y243	479 aa		10.34	□□□□□ -0.75
SPIN3-222	ENST00000639482	DICER1	Q9UPY3	1922 aa	Known RBP	10.34	□□□□□ -0.75
SPIN3-222	ENST00000639482	APOL1	O14791	398 aa		10.33	□□□□□ -0.76
SPIN3-222	ENST00000639482	TFE3	P19532	575 aa	Predicted RBP	10.33	□□□□□ -0.76
SPIN3-222	ENST00000639482	EIF4B	P23588	611 aa	Known RBP	10.33	□□□□□ -0.76
SPIN3-222	ENST00000639482	CCR10	P46092	362 aa		10.33	□□□□□ -0.76
SPIN3-222	ENST00000639482	MSLN	Q13421	630 aa	Predicted RBP	10.33	□□□□□ -0.76
SPIN3-222	ENST00000639482	CCNI	Q14094	377 aa		10.33	□□□□□ -0.76
SPIN3-222	ENST00000639482	KCNJ11	Q14654	390 aa		10.33	□□□□□ -0.76
SPIN3-222	ENST00000639482	ZBTB46	Q86UZ6	589 aa		10.33	□□□□□ -0.76
SPIN3-222	ENST00000639482	PLD5	Q8N7P1	536 aa		10.33	□□□□□ -0.76
SPIN3-222	ENST00000639482	NAT14	Q8WUY8	206 aa		10.33	□□□□□ -0.76
SPIN3-222	ENST00000639482	ZNF778	Q96MU6	729 aa		10.33	□□□□□ -0.76
SPIN3-222	ENST00000639482	C7orf26	Q96N11	449 aa		10.33	□□□□□ -0.76
SPIN3-222	ENST00000639482	APOL2	Q9BQE5	337 aa		10.33	□□□□□ -0.76
SPIN3-222	ENST00000639482	NIFK	Q9BYG3	293 aa	Known RBP	10.33	□□□□□ -0.76
SPIN3-222	ENST00000639482	THAP1	Q9NVV9	213 aa		10.33	□□□□□ -0.76
SPIN3-222	ENST00000639482	PAK5	Q9P286	719 aa		10.33	□□□□□ -0.76
SPIN3-222	ENST00000639482	POMP	Q9Y244	141 aa		10.33	□□□□□ -0.76
SPIN3-222	ENST00000639482	ZNFX1	Q9P2E3	1918 aa	Known RBP	10.33	□□□□□ -0.76
SPIN3-222	ENST00000639482	ARID2	Q68CP9	1835 aa		10.33	□□□□□ -0.76
SPIN3-222	ENST00000639482	DNAJC25-GNG10	A0A024R161	153 aa		10.33	□□□□□ -0.76
SPIN3-222	ENST00000639482	TCRBV5S1A1T	A0A578	114 aa		10.33	□□□□□ -0.76

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