RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637624.1

PXN-222, Transcript of paxillin, human

TSL 2

Gene PXN, Length 4,132 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PXN-222	ENST00000637624	SIN3B	O75182	1162 aa		12.47	□□□□□ -0.41
PXN-222	ENST00000637624	EGFR	P00533	1210 aa		12.47	□□□□□ -0.41
PXN-222	ENST00000637624	NR4A1	P22736	598 aa		12.47	□□□□□ -0.41
PXN-222	ENST00000637624	TAP1	Q03518	808 aa		12.47	□□□□□ -0.41
PXN-222	ENST00000637624	ZNF667	Q5HYK9	610 aa		12.47	□□□□□ -0.41
PXN-222	ENST00000637624	EFHC2	Q5JST6	749 aa		12.47	□□□□□ -0.41
PXN-222	ENST00000637624	GLIS1	Q8NBF1	620 aa		12.47	□□□□□ -0.41
PXN-222	ENST00000637624	FAM156A	Q8NDB6	213 aa		12.47	□□□□□ -0.41
PXN-222	ENST00000637624	TNIP2	Q8NFZ5	429 aa		12.47	□□□□□ -0.41
PXN-222	ENST00000637624	ZFP28	Q8NHY6	868 aa		12.47	□□□□□ -0.41
PXN-222	ENST00000637624	DCAF4	Q8WV16	495 aa		12.47	□□□□□ -0.41
PXN-222	ENST00000637624	MRI	Q9BWK5	157 aa		12.47	□□□□□ -0.41
PXN-222	ENST00000637624	CLK4	Q9HAZ1	481 aa	Known RBP	12.47	□□□□□ -0.41
PXN-222	ENST00000637624	PNPLA3	Q9NST1	481 aa		12.47	□□□□□ -0.41
PXN-222	ENST00000637624	COL11A2	P13942	1736 aa	Predicted RBP	12.46	□□□□□ -0.41
PXN-222	ENST00000637624	GOLGA8T	H3BQL2	631 aa		12.46	□□□□□ -0.41
PXN-222	ENST00000637624	TRAFD1	O14545	582 aa	Predicted RBP	12.46	□□□□□ -0.41
PXN-222	ENST00000637624	TCEA3	O75764	348 aa		12.46	□□□□□ -0.41
PXN-222	ENST00000637624	HSPA1A	P0DMV8	641 aa	Known RBP	12.46	□□□□□ -0.41
PXN-222	ENST00000637624	HSPA1B	P0DMV9	641 aa	Known RBP	12.46	□□□□□ -0.41
PXN-222	ENST00000637624	STT3A	P46977	705 aa		12.46	□□□□□ -0.41
PXN-222	ENST00000637624	HMGCS2	P54868	508 aa		12.46	□□□□□ -0.41
PXN-222	ENST00000637624	ANKRD22	Q5VYY1	191 aa		12.46	□□□□□ -0.41
PXN-222	ENST00000637624	CDKL3	Q8IVW4	592 aa	Predicted RBP	12.46	□□□□□ -0.41
PXN-222	ENST00000637624	CDAN1	Q8IWY9	1227 aa		12.46	□□□□□ -0.41
PXN-222	ENST00000637624	DDIAS	Q8IXT1	998 aa		12.46	□□□□□ -0.41
PXN-222	ENST00000637624	C12orf50	Q8NA57	414 aa	Predicted RBP	12.46	□□□□□ -0.41
PXN-222	ENST00000637624	LRRN4	Q8WUT4	740 aa		12.46	□□□□□ -0.41
PXN-222	ENST00000637624	SERAC1	Q96JX3	654 aa		12.46	□□□□□ -0.41
PXN-222	ENST00000637624	TRPC7	Q9HCX4	862 aa		12.46	□□□□□ -0.41
PXN-222	ENST00000637624	GPATCH2L	Q9NWQ4	482 aa		12.46	□□□□□ -0.41
PXN-222	ENST00000637624	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		12.46	□□□□□ -0.41
PXN-222	ENST00000637624	FAM198A	Q9UFP1	575 aa		12.46	□□□□□ -0.41
PXN-222	ENST00000637624	SUN2	Q9UH99	717 aa		12.46	□□□□□ -0.41
PXN-222	ENST00000637624	DCDC2	Q9UHG0	476 aa		12.46	□□□□□ -0.41
PXN-222	ENST00000637624	NID2	Q14112	1375 aa		12.46	□□□□□ -0.41
PXN-222	ENST00000637624	ENTPD3	O75355	529 aa		12.46	□□□□□ -0.41
PXN-222	ENST00000637624	PSMA4	P25789	261 aa	Known RBP	12.46	□□□□□ -0.41
PXN-222	ENST00000637624	SPR	P35270	261 aa	Predicted RBP	12.46	□□□□□ -0.41
PXN-222	ENST00000637624	WASHC5	Q12768	1159 aa		12.46	□□□□□ -0.41
PXN-222	ENST00000637624		Q3C1V9	767 aa		12.46	□□□□□ -0.41
PXN-222	ENST00000637624	PDCD4	Q53EL6	469 aa	Known RBP	12.46	□□□□□ -0.41
PXN-222	ENST00000637624	FAM151A	Q8WW52	585 aa		12.46	□□□□□ -0.41
PXN-222	ENST00000637624	SHC3	Q92529	594 aa		12.46	□□□□□ -0.41
PXN-222	ENST00000637624	ANKRD36BP1	Q96IX9	119 aa		12.46	□□□□□ -0.41
PXN-222	ENST00000637624	DEFB129	Q9H1M3	183 aa		12.46	□□□□□ -0.41
PXN-222	ENST00000637624	CCDC167	Q9P0B6	97 aa		12.46	□□□□□ -0.41
PXN-222	ENST00000637624	ASNA1	O43681	348 aa		12.46	□□□□□ -0.42
PXN-222	ENST00000637624	EPHA3	P29320	983 aa		12.46	□□□□□ -0.42
PXN-222	ENST00000637624	LSM3	P62310	102 aa	Known RBP	12.46	□□□□□ -0.42
PXN-222	ENST00000637624	NME3	Q13232	169 aa		12.46	□□□□□ -0.42
PXN-222	ENST00000637624	TRIM25	Q14258	630 aa	Known RBP	12.46	□□□□□ -0.42
PXN-222	ENST00000637624	PLEKHG4	Q58EX7	1191 aa		12.46	□□□□□ -0.42
PXN-222	ENST00000637624	CMPK2	Q5EBM0	449 aa		12.46	□□□□□ -0.42
PXN-222	ENST00000637624	CES3	Q6UWW8	571 aa		12.46	□□□□□ -0.42
PXN-222	ENST00000637624	TMEM179	Q6ZVK1	233 aa		12.46	□□□□□ -0.42
PXN-222	ENST00000637624	BANP	Q8N9N5	519 aa		12.46	□□□□□ -0.42
PXN-222	ENST00000637624	NCLN	Q969V3	563 aa		12.46	□□□□□ -0.42
PXN-222	ENST00000637624	SLITRK1	Q96PX8	696 aa		12.46	□□□□□ -0.42
PXN-222	ENST00000637624	KCNMB3	Q9NPA1	279 aa		12.46	□□□□□ -0.42
PXN-222	ENST00000637624	PCDH12	Q9NPG4	1184 aa		12.46	□□□□□ -0.42
PXN-222	ENST00000637624	AVEN	Q9NQS1	362 aa	Predicted RBP	12.46	□□□□□ -0.42
PXN-222	ENST00000637624	ACSS2	Q9NR19	701 aa		12.46	□□□□□ -0.42
PXN-222	ENST00000637624	HEATR9	A2RTY3	570 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PXN-222	ENST00000637624	NDUFB5	O43674	189 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PXN-222	ENST00000637624	EIF4B	P23588	611 aa	Known RBP	12.45	□□□□□ -0.42
PXN-222	ENST00000637624	HAL	P42357	657 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PXN-222	ENST00000637624	RAD23A	P54725	363 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PXN-222	ENST00000637624	ORC1	Q13415	861 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PXN-222	ENST00000637624	CUL2	Q13617	745 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PXN-222	ENST00000637624	DPYSL3	Q14195	570 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PXN-222	ENST00000637624	MTX3	Q5HYI7	312 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PXN-222	ENST00000637624	FNBP1L	Q5T0N5	605 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PXN-222	ENST00000637624	ADGRD1	Q6QNK2	874 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PXN-222	ENST00000637624	TMC7	Q7Z402	723 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PXN-222	ENST00000637624	TNS4	Q8IZW8	715 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PXN-222	ENST00000637624	PCYOX1L	Q8NBM8	494 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PXN-222	ENST00000637624	TRPM4	Q8TD43	1214 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PXN-222	ENST00000637624	KREMEN1	Q96MU8	473 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PXN-222	ENST00000637624	MBOAT7	Q96N66	472 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PXN-222	ENST00000637624	MRGBP	Q9NV56	204 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PXN-222	ENST00000637624	ASTN2	O75129	1339 aa	Predicted RBP	12.45	□□□□□ -0.42
PXN-222	ENST00000637624	TMEM150B	A6NC51	233 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PXN-222	ENST00000637624	PTGES3L	E9PB15	166 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PXN-222	ENST00000637624	MAGEB2	O15479	319 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PXN-222	ENST00000637624	SLITRK3	O94933	977 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PXN-222	ENST00000637624	MAG	P20916	626 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PXN-222	ENST00000637624	RGS7	P49802	495 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PXN-222	ENST00000637624	KPNA2	P52292	529 aa	Known RBP	12.45	□□□□□ -0.42
PXN-222	ENST00000637624	MAP3K10	Q02779	954 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PXN-222	ENST00000637624	MYLK3	Q32MK0	819 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PXN-222	ENST00000637624	SPDYE2	Q495Y8	402 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PXN-222	ENST00000637624	GALNT18	Q6P9A2	607 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PXN-222	ENST00000637624	POTEH	Q6S545	545 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PXN-222	ENST00000637624	FRA10AC1	Q70Z53	315 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PXN-222	ENST00000637624	TDRP	Q86YL5	185 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PXN-222	ENST00000637624	CCDC60	Q8IWA6	550 aa	Predicted RBP	12.45	□□□□□ -0.42
PXN-222	ENST00000637624	ADCY4	Q8NFM4	1077 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PXN-222	ENST00000637624	FBXO27	Q8NI29	283 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PXN-222	ENST00000637624	HELQ	Q8TDG4	1101 aa		12.45	□□□□□ -0.42

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