RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636616.1

EFHC1-223, Transcript of EF-hand domain containing 1, human

TSL 5

Gene EFHC1, Length 1,636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFHC1-223	ENST00000636616	KLHL24	Q6TFL4	600 aa		5.35	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	5.35	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	LRRC8D	Q7L1W4	858 aa		5.35	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	MCM10	Q7L590	875 aa		5.35	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	UBE2Q1	Q7Z7E8	422 aa		5.35	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	SDCCAG8	Q86SQ7	713 aa	Predicted RBP	5.35	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	LILRA3	Q8N6C8	439 aa	Predicted RBP	5.35	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	LINC01356	Q8N9X3	169 aa		5.35	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	FBXO18	Q8NFZ0	1043 aa		5.35	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	METTL6	Q8TCB7	284 aa		5.35	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	STAM	Q92783	540 aa		5.35	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	DYDC2	Q96IM9	177 aa		5.35	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	MED15	Q96RN5	788 aa		5.35	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	PHF7	Q9BWX1	381 aa	Predicted RBP	5.35	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	BTBD2	Q9BX70	525 aa		5.35	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC25A18	Q9H1K4	315 aa		5.35	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	MUC13	Q9H3R2	512 aa		5.35	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		5.35	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	NTM	Q9P121	344 aa		5.35	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	GTF3C4	Q9UKN8	822 aa		5.35	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	BRWD3	Q6RI45	1802 aa		5.35	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		5.35	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616		A0A1B0GTL3	188 aa		5.34	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	FAM90A20P	A6NIJ5	464 aa		5.34	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	HMMR	O75330	724 aa		5.34	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	KNG1	P01042	644 aa		5.34	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	CHGB	P05060	677 aa		5.34	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	HOXB7	P09629	217 aa		5.34	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	UBL4A	P11441	157 aa		5.34	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	ALAS1	P13196	640 aa		5.34	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	ALAD	P13716	330 aa		5.34	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF28	P17035	718 aa		5.34	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	FGFR4	P22455	802 aa		5.34	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	AKT1	P31749	480 aa		5.34	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	KIF5B	P33176	963 aa		5.34	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	MSH2	P43246	934 aa		5.34	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	HARS2	P49590	506 aa	Known RBP	5.34	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	PDE6C	P51160	858 aa		5.34	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	PSMC6	P62333	389 aa		5.34	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	POU6F2	P78424	691 aa	Predicted RBP	5.34	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	IL13RA1	P78552	427 aa		5.34	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	DCTN2	Q13561	401 aa	Known RBP	5.34	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC29A2	Q14542	456 aa		5.34	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	PUM1	Q14671	1186 aa	Known RBP eCLIP	5.34	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	STIL	Q15468	1287 aa		5.34	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	KYNU	Q16719	465 aa		5.34	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	DGKD	Q16760	1214 aa		5.34	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	FAXC	Q5TGI0	409 aa		5.34	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	TCERG1L	Q5VWI1	586 aa		5.34	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	TRMT10B	Q6PF06	316 aa	Known RBP	5.34	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF790	Q6PG37	636 aa		5.34	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	INO80C	Q6PI98	192 aa	Predicted RBP	5.34	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	IKBIP	Q70UQ0	350 aa		5.34	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	SLFN11	Q7Z7L1	901 aa		5.34	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	LRRC56	Q8IYG6	542 aa	Predicted RBP	5.34	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	TAGAP	Q8N103	731 aa		5.34	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	TP53I13	Q8NBR0	393 aa	Predicted RBP	5.34	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	PIK3C3	Q8NEB9	887 aa		5.34	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	REPS2	Q8NFH8	660 aa		5.34	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF480	Q8WV37	535 aa		5.34	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	ZCCHC14	Q8WYQ9	949 aa	Known RBP	5.34	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	PIGB	Q92521	554 aa		5.34	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF845	Q96IR2	970 aa	Predicted RBP	5.34	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	TEX13A	Q9BXU3	409 aa	Predicted RBP	5.34	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	NDST4	Q9H3R1	872 aa		5.34	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	CHMP4B	Q9H444	224 aa	Known RBP	5.34	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	PDE7B	Q9NP56	450 aa		5.34	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	PDRG1	Q9NUG6	133 aa		5.34	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	DECR2	Q9NUI1	292 aa		5.34	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	POLR3B	Q9NW08	1133 aa	Predicted RBP	5.34	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	DNAI1	Q9UI46	699 aa		5.34	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		5.34	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	ACTL7A	Q9Y615	435 aa		5.34	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	SBF2	Q86WG5	1849 aa		5.34	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	TRIM64C	A6NLI5	447 aa		5.34	□□□□□ -1.56
EFHC1-223	ENST00000636616		H0Y858	1186 aa		5.34	□□□□□ -1.56
EFHC1-223	ENST00000636616		H7C4K7	107 aa		5.34	□□□□□ -1.56
EFHC1-223	ENST00000636616	ADAM20	O43506	726 aa		5.34	□□□□□ -1.56
EFHC1-223	ENST00000636616	TBX10	O75333	385 aa		5.34	□□□□□ -1.56
EFHC1-223	ENST00000636616	TFRC	P02786	760 aa	Known RBP	5.34	□□□□□ -1.56
EFHC1-223	ENST00000636616	CYP21A2	P08686	494 aa		5.34	□□□□□ -1.56
EFHC1-223	ENST00000636616	CPA1	P15085	419 aa		5.34	□□□□□ -1.56
EFHC1-223	ENST00000636616	STMN1	P16949	149 aa		5.34	□□□□□ -1.56
EFHC1-223	ENST00000636616	ATP5F1	P24539	256 aa	Predicted RBP	5.34	□□□□□ -1.56
EFHC1-223	ENST00000636616	SERPINA4	P29622	427 aa		5.34	□□□□□ -1.56
EFHC1-223	ENST00000636616	EIF2D	P41214	584 aa	Known RBP	5.34	□□□□□ -1.56
EFHC1-223	ENST00000636616	HNF4A	P41235	474 aa		5.34	□□□□□ -1.56
EFHC1-223	ENST00000636616	CD86	P42081	329 aa		5.34	□□□□□ -1.56
EFHC1-223	ENST00000636616	PAFAH1B1	P43034	410 aa		5.34	□□□□□ -1.56
EFHC1-223	ENST00000636616	CPT1A	P50416	773 aa		5.34	□□□□□ -1.56
EFHC1-223	ENST00000636616	RBP5	P82980	135 aa		5.34	□□□□□ -1.56
EFHC1-223	ENST00000636616	UBXN1	Q04323	297 aa		5.34	□□□□□ -1.56
EFHC1-223	ENST00000636616	KRTAP1-1	Q07627	177 aa		5.34	□□□□□ -1.56
EFHC1-223	ENST00000636616	AP1B1	Q10567	949 aa		5.34	□□□□□ -1.56
EFHC1-223	ENST00000636616	NPY5R	Q15761	445 aa		5.34	□□□□□ -1.56
EFHC1-223	ENST00000636616	NRN1L	Q496H8	165 aa		5.34	□□□□□ -1.56
EFHC1-223	ENST00000636616	GALNTL6	Q49A17	601 aa		5.34	□□□□□ -1.56
EFHC1-223	ENST00000636616	BMP2KL	Q5H9B9	411 aa		5.34	□□□□□ -1.56
EFHC1-223	ENST00000636616	LRCH2	Q5VUJ6	765 aa		5.34	□□□□□ -1.56
EFHC1-223	ENST00000636616	MCTP2	Q6DN12	878 aa		5.34	□□□□□ -1.56

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