RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000630659.2

BBS1-225, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 5 BASIC

Gene BBS1, Length 1,934 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-225	ENST00000630659	CYP4A22	Q5TCH4	519 aa		15.8	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	DCUN1D2	Q6PH85	259 aa		15.8	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	RIPOR1	Q6ZS17	1223 aa		15.8	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	DHDDS	Q86SQ9	333 aa		15.8	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	RNF180	Q86T96	592 aa		15.8	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	FAM172A	Q8WUF8	416 aa		15.8	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	PRICKLE1	Q96MT3	831 aa	Predicted RBP	15.8	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	DCLK3	Q9C098	648 aa		15.8	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	KLHL4	Q9C0H6	718 aa		15.8	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659		Q9H521	79 aa		15.8	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	FOXO6	A8MYZ6	492 aa		15.79	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	GPR182	O15218	404 aa		15.79	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	PSTPIP1	O43586	416 aa		15.79	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	CABYR	O75952	493 aa		15.79	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	AMPD1	P23109	780 aa		15.79	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	THPO	P40225	353 aa		15.79	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	ADCY1	Q08828	1119 aa		15.79	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	ANKRD20A4	Q4UJ75	823 aa		15.79	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	SLC44A4	Q53GD3	710 aa		15.79	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	PLEKHG4	Q58EX7	1191 aa		15.79	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	FBXO47	Q5MNV8	452 aa		15.79	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	IZUMO3	Q5VZ72	239 aa		15.79	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	LCLAT1	Q6UWP7	414 aa		15.79	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	RHOT1	Q8IXI2	618 aa		15.79	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	PXYLP1	Q8TE99	480 aa		15.79	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	DDI1	Q8WTU0	396 aa		15.79	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	MCEE	Q96PE7	176 aa		15.79	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	RBM15	Q96T37	977 aa	Known RBP eCLIP	15.79	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	TSSK1B	Q9BXA7	367 aa		15.79	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	MANSC1	Q9H8J5	431 aa		15.79	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	KANSL3	Q9P2N6	904 aa		15.79	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	NEU2	Q9Y3R4	380 aa		15.79	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659		A0A0G2JND7	137 aa		15.78	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	GNRH1	P01148	92 aa		15.78	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	SPATA31D3	P0C874	917 aa		15.78	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	GCA	P28676	217 aa		15.78	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	GPD2	P43304	727 aa		15.78	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	SOX4	Q06945	474 aa	Predicted RBP	15.78	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	SPATA31D4	Q6ZUB0	917 aa		15.78	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	DPH6	Q7L8W6	267 aa		15.78	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	UNC93A	Q86WB7	457 aa		15.78	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	HACE1	Q8IYU2	909 aa		15.78	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	ZBED8	Q8IZ13	594 aa		15.78	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	OXNAD1	Q96HP4	312 aa	Predicted RBP	15.78	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	CPXM1	Q96SM3	734 aa		15.78	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	MRPS26	Q9BYN8	205 aa	Known RBP	15.78	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	EBF3	Q9H4W6	596 aa		15.78	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	FAM105A	Q9NUU6	356 aa		15.78	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	GDAP2	Q9NXN4	497 aa		15.78	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	UST	Q9Y2C2	406 aa		15.78	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	NR2E3	Q9Y5X4	410 aa		15.78	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	THSD7B	Q9C0I4	1608 aa		15.78	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	KPNA7	A9QM74	516 aa		15.78	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	SPECC1L-ADORA2A	F8WAN1	911 aa		15.78	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	MAGEA10	P43363	369 aa	Predicted RBP	15.78	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	TAF6	P49848	677 aa		15.78	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	TAS2R40	P59535	323 aa		15.78	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	PSMC1	P62191	440 aa	Known RBP	15.78	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	PTK7	Q13308	1070 aa		15.78	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	ITGA7	Q13683	1181 aa		15.78	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	PKN2	Q16513	984 aa	Known RBP	15.78	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	CCNG2	Q16589	344 aa		15.78	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	SOWAHA	Q2M3V2	549 aa		15.78	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	SATL1	Q86VE3	508 aa		15.78	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	ULK2	Q8IYT8	1036 aa		15.78	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	RFWD2	Q8NHY2	731 aa		15.78	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	UBA3	Q8TBC4	463 aa		15.78	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	C1orf54	Q8WWF1	131 aa		15.78	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	NMD3	Q96D46	503 aa	Known RBP	15.78	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	MTBP	Q96DY7	904 aa		15.78	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	TMEM120A	Q9BXJ8	343 aa		15.78	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	TMEM165	Q9HC07	324 aa		15.78	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	DCTN4	Q9UJW0	460 aa		15.78	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	TSPAN16	Q9UKR8	245 aa		15.78	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	GOLGA8S	H3BPF8	625 aa		15.77	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	PTGES	O14684	152 aa		15.77	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	VCL	P18206	1134 aa		15.77	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	LRPAP1	P30533	357 aa		15.77	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	GABRB2	P47870	512 aa		15.77	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	ACLY	P53396	1101 aa		15.77	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF252P-AS1	Q0IIN9	211 aa		15.77	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	PIGH	Q14442	188 aa	Predicted RBP	15.77	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	SV2C	Q496J9	727 aa		15.77	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	C1orf146	Q5VVC0	180 aa		15.77	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	ACOT1	Q86TX2	421 aa		15.77	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	XYLT1	Q86Y38	959 aa		15.77	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	OR6B3	Q8NGW1	331 aa		15.77	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	C9orf72	Q96LT7	481 aa		15.77	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	PPP1R10	Q96QC0	940 aa	Known RBP	15.77	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	AGO3	Q9H9G7	860 aa	Known RBP	15.77	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	GOLGA2P5	Q9HBQ8	144 aa		15.77	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	FAIM	Q9NVQ4	179 aa		15.77	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	KCNK4	Q9NYG8	393 aa		15.77	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	TJP2	Q9UDY2	1190 aa		15.77	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	TAGLN3	Q9UI15	199 aa		15.77	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	PLA2G4C	Q9UP65	541 aa		15.77	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659	SORCS3	Q9UPU3	1222 aa		15.77	■□□□□ 0.12
BBS1-225	ENST00000630659		B2RBV5	119 aa		15.76	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	FCHO1	O14526	889 aa		15.76	■□□□□ 0.11
BBS1-225	ENST00000630659	KLF11	O14901	512 aa		15.76	■□□□□ 0.11

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