RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626061.2

SNAP23-222, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 5 BASIC

Gene SNAP23, Length 237 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-222	ENST00000626061	MLXIPL	Q9NP71	852 aa		6.69	□□□□□ -1.34
SNAP23-222	ENST00000626061	KLHL11	Q9NVR0	708 aa		6.69	□□□□□ -1.34
SNAP23-222	ENST00000626061	THAP10	Q9P2Z0	257 aa	Predicted RBP	6.69	□□□□□ -1.34
SNAP23-222	ENST00000626061	FHOD1	Q9Y613	1164 aa		6.69	□□□□□ -1.34
SNAP23-222	ENST00000626061	CACNA1C	Q13936	2221 aa		6.69	□□□□□ -1.34
SNAP23-222	ENST00000626061		A0A1B0GUA9	196 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SNAP23-222	ENST00000626061	CDC14C	A4D256	554 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SNAP23-222	ENST00000626061	RPLP0	P05388	317 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
SNAP23-222	ENST00000626061	VSIG8	P0DPA2	414 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SNAP23-222	ENST00000626061	MAP4	P27816	1152 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
SNAP23-222	ENST00000626061	HNRNPH3	P31942	346 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
SNAP23-222	ENST00000626061	PBX1	P40424	430 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SNAP23-222	ENST00000626061	ARSD	P51689	593 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SNAP23-222	ENST00000626061	GALC	P54803	685 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SNAP23-222	ENST00000626061	ZBTB16	Q05516	673 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SNAP23-222	ENST00000626061	SOX4	Q06945	474 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
SNAP23-222	ENST00000626061	PDE4C	Q08493	712 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SNAP23-222	ENST00000626061	ENPP2	Q13822	863 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SNAP23-222	ENST00000626061	KCNJ12	Q14500	433 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SNAP23-222	ENST00000626061	ZNF235	Q14590	738 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SNAP23-222	ENST00000626061	AMHR2	Q16671	573 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SNAP23-222	ENST00000626061	UBE2S	Q16763	222 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SNAP23-222	ENST00000626061	LONRF1	Q17RB8	773 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SNAP23-222	ENST00000626061	DUS1L	Q6P1R4	473 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
SNAP23-222	ENST00000626061	CIART	Q8N365	385 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
SNAP23-222	ENST00000626061	UCMA	Q8WVF2	138 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SNAP23-222	ENST00000626061	TMEM143	Q96AN5	459 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SNAP23-222	ENST00000626061	OTUB2	Q96DC9	234 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SNAP23-222	ENST00000626061	BARD1	Q99728	777 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
SNAP23-222	ENST00000626061	LIME1	Q9H400	295 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SNAP23-222	ENST00000626061	TMEM134	Q9H6X4	195 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SNAP23-222	ENST00000626061	LRTM1	Q9HBL6	345 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SNAP23-222	ENST00000626061	TBC1D22B	Q9NU19	505 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SNAP23-222	ENST00000626061	SMPD4	Q9NXE4	827 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SNAP23-222	ENST00000626061	CFAP97	Q9P2B7	532 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SNAP23-222	ENST00000626061	SERTAD1	Q9UHV2	236 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SNAP23-222	ENST00000626061	SALL4	Q9UJQ4	1053 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SNAP23-222	ENST00000626061	TPX2	Q9ULW0	747 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
SNAP23-222	ENST00000626061	USP20	Q9Y2K6	914 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SNAP23-222	ENST00000626061	GDA	Q9Y2T3	454 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SNAP23-222	ENST00000626061	PCDHGA3	Q9Y5H0	932 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SNAP23-222	ENST00000626061	CPQ	Q9Y646	472 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SNAP23-222	ENST00000626061	MRPS18B	Q9Y676	258 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
SNAP23-222	ENST00000626061	FER1L5	A0AVI2	2057 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SNAP23-222	ENST00000626061	PTPRJ	Q12913	1337 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SNAP23-222	ENST00000626061	E2F3	O00716	465 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SNAP23-222	ENST00000626061	ZWINT	O95229	277 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SNAP23-222	ENST00000626061	CLDN14	O95500	239 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SNAP23-222	ENST00000626061	FURIN	P09958	794 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SNAP23-222	ENST00000626061	EDN3	P14138	238 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SNAP23-222	ENST00000626061	PRKCH	P24723	683 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SNAP23-222	ENST00000626061	RECQL	P46063	649 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
SNAP23-222	ENST00000626061	DGKG	P49619	791 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SNAP23-222	ENST00000626061	CCR5	P51681	352 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SNAP23-222	ENST00000626061	PTEN	P60484	403 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SNAP23-222	ENST00000626061	ABHD18	Q0P651	414 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SNAP23-222	ENST00000626061	KCNMA1	Q12791	1236 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SNAP23-222	ENST00000626061	STAT4	Q14765	748 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SNAP23-222	ENST00000626061	E2F5	Q15329	346 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SNAP23-222	ENST00000626061	ARHGAP44	Q17R89	818 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SNAP23-222	ENST00000626061	PLEKHN1	Q494U1	663 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
SNAP23-222	ENST00000626061	SLC39A12	Q504Y0	691 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SNAP23-222	ENST00000626061	CCDC178	Q5BJE1	867 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SNAP23-222	ENST00000626061	XKR3	Q5GH77	459 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SNAP23-222	ENST00000626061	DHX32	Q7L7V1	743 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
SNAP23-222	ENST00000626061	TMEM135	Q86UB9	458 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SNAP23-222	ENST00000626061	DDX42	Q86XP3	938 aa	Known RBP eCLIP	6.67	□□□□□ -1.34
SNAP23-222	ENST00000626061	SDR16C5	Q8N3Y7	309 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SNAP23-222	ENST00000626061	ACBD4	Q8NC06	268 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SNAP23-222	ENST00000626061	OR2T34	Q8NGX1	318 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SNAP23-222	ENST00000626061	PIBF1	Q8WXW3	757 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SNAP23-222	ENST00000626061	PMEPA1	Q969W9	287 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SNAP23-222	ENST00000626061	KLHDC7B	Q96G42	594 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SNAP23-222	ENST00000626061	NT5C1B	Q96P26	610 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SNAP23-222	ENST00000626061	CPEB1	Q9BZB8	566 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
SNAP23-222	ENST00000626061	RIOX1	Q9H6W3	641 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SNAP23-222	ENST00000626061	PSTPIP2	Q9H939	334 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SNAP23-222	ENST00000626061	PDE7B	Q9NP56	450 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SNAP23-222	ENST00000626061	SLC38A7	Q9NVC3	462 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SNAP23-222	ENST00000626061	G3BP2	Q9UN86	482 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
SNAP23-222	ENST00000626061	MAPK8IP1	Q9UQF2	711 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SNAP23-222	ENST00000626061	NTNG1	Q9Y2I2	539 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SNAP23-222	ENST00000626061	LRP4	O75096	1905 aa		6.66	□□□□□ -1.34
SNAP23-222	ENST00000626061	TRRAP	Q9Y4A5	3859 aa		6.66	□□□□□ -1.34
SNAP23-222	ENST00000626061	SLC12A8	A0AV02	714 aa		6.66	□□□□□ -1.34
SNAP23-222	ENST00000626061	NEDD8-MDP1	E9PL57	170 aa		6.66	□□□□□ -1.34
SNAP23-222	ENST00000626061	TULP1	O00294	542 aa	Predicted RBP	6.66	□□□□□ -1.34
SNAP23-222	ENST00000626061	ASAP2	O43150	1006 aa		6.66	□□□□□ -1.34
SNAP23-222	ENST00000626061	CACNG3	O60359	315 aa		6.66	□□□□□ -1.34
SNAP23-222	ENST00000626061	MAP3K6	O95382	1288 aa		6.66	□□□□□ -1.34
SNAP23-222	ENST00000626061	HAPLN1	P10915	354 aa	Predicted RBP	6.66	□□□□□ -1.34
SNAP23-222	ENST00000626061	CCL4	P13236	92 aa		6.66	□□□□□ -1.34
SNAP23-222	ENST00000626061	ATP5J	P18859	108 aa		6.66	□□□□□ -1.34
SNAP23-222	ENST00000626061	AGA	P20933	346 aa		6.66	□□□□□ -1.34
SNAP23-222	ENST00000626061	HSPA4	P34932	840 aa		6.66	□□□□□ -1.34
SNAP23-222	ENST00000626061	HNRNPK	P61978	463 aa	Known RBP eCLIP	6.66	□□□□□ -1.34
SNAP23-222	ENST00000626061	CCL7	P80098	99 aa		6.66	□□□□□ -1.34
SNAP23-222	ENST00000626061	MBTD1	Q05BQ5	628 aa		6.66	□□□□□ -1.34
SNAP23-222	ENST00000626061	ZFP36L1	Q07352	338 aa	Known RBP	6.66	□□□□□ -1.34
SNAP23-222	ENST00000626061	DEFB133	Q30KQ1	61 aa		6.66	□□□□□ -1.34

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