RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 GAREM1Q9H706 876 aa26■■□□□ 1.75
PTPRF-216ENST00000617451 ABCC13Q9NSE7 274 aa26■■□□□ 1.75
PTPRF-216ENST00000617451 RMND1Q9NWS8 449 aa26■■□□□ 1.75
PTPRF-216ENST00000617451 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa26■■□□□ 1.75
PTPRF-216ENST00000617451 KIAA1257Q9ULG3 409 aa26■■□□□ 1.75
PTPRF-216ENST00000617451 PLA2G4CQ9UP65 541 aa26■■□□□ 1.75
PTPRF-216ENST00000617451 O00370 1275 aa25.99■■□□□ 1.75
PTPRF-216ENST00000617451 SETSIPP0DME0 302 aa25.99■■□□□ 1.75
PTPRF-216ENST00000617451 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
PTPRF-216ENST00000617451 PKDCCQ504Y2 493 aa25.99■■□□□ 1.75
PTPRF-216ENST00000617451 IL27RAQ6UWB1 636 aa25.99■■□□□ 1.75
PTPRF-216ENST00000617451 GLRX5Q86SX6 157 aa25.99■■□□□ 1.75
PTPRF-216ENST00000617451 ADIPOR2Q86V24 386 aa25.99■■□□□ 1.75
PTPRF-216ENST00000617451 FAM124AQ86V42 546 aa25.99■■□□□ 1.75
PTPRF-216ENST00000617451 UBR7Q8N806 425 aa25.99■■□□□ 1.75
PTPRF-216ENST00000617451 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP25.99■■□□□ 1.75
PTPRF-216ENST00000617451 PNPLA1Q8N8W4 532 aa25.99■■□□□ 1.75
PTPRF-216ENST00000617451 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa25.99■■□□□ 1.75
PTPRF-216ENST00000617451 TSG101Q99816 390 aa25.99■■□□□ 1.75
PTPRF-216ENST00000617451 CNGB3Q9NQW8 809 aa25.99■■□□□ 1.75
PTPRF-216ENST00000617451 ABCB8Q9NUT2 735 aa25.99■■□□□ 1.75
PTPRF-216ENST00000617451 NBEAQ8NFP9 2946 aa25.99■■□□□ 1.75
PTPRF-216ENST00000617451 MSI1O43347 362 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
PTPRF-216ENST00000617451 CER1O95813 267 aa25.98■■□□□ 1.75
PTPRF-216ENST00000617451 MATKP42679 507 aa25.98■■□□□ 1.75
PTPRF-216ENST00000617451 DAOAP59103 153 aa25.98■■□□□ 1.75
PTPRF-216ENST00000617451 NUMA1Q14980 2115 aa25.98■■□□□ 1.75
PTPRF-216ENST00000617451 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
PTPRF-216ENST00000617451 ANKRD40Q6AI12 368 aa25.98■■□□□ 1.75
PTPRF-216ENST00000617451 CHST9Q7L1S5 443 aa25.98■■□□□ 1.75
PTPRF-216ENST00000617451 LHX5Q9H2C1 402 aa25.98■■□□□ 1.75
PTPRF-216ENST00000617451 GDPD2Q9HCC8 539 aa25.98■■□□□ 1.75
PTPRF-216ENST00000617451 GGA2Q9UJY4 613 aa25.98■■□□□ 1.75
PTPRF-216ENST00000617451 TAF4O00268 1085 aa25.97■■□□□ 1.75
PTPRF-216ENST00000617451 PMS1P54277 932 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
PTPRF-216ENST00000617451 PTPRNQ16849 979 aa25.97■■□□□ 1.75
PTPRF-216ENST00000617451 HLA-BQ31612 363 aa25.97■■□□□ 1.75
PTPRF-216ENST00000617451 MSANTD2Q6P1R3 559 aa25.97■■□□□ 1.75
PTPRF-216ENST00000617451 LCLAT1Q6UWP7 414 aa25.97■■□□□ 1.75
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF366Q8N895 744 aa25.97■■□□□ 1.75
PTPRF-216ENST00000617451 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
PTPRF-216ENST00000617451 SLC35C1Q96A29 364 aa25.97■■□□□ 1.75
PTPRF-216ENST00000617451 GSDMAQ96QA5 445 aa25.97■■□□□ 1.75
PTPRF-216ENST00000617451 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
PTPRF-216ENST00000617451 TM7SF3Q9NS93 570 aa25.97■■□□□ 1.75
PTPRF-216ENST00000617451 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
PTPRF-216ENST00000617451 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
PTPRF-216ENST00000617451 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
PTPRF-216ENST00000617451 GABBR2O75899 941 aa25.96■■□□□ 1.75
PTPRF-216ENST00000617451 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
PTPRF-216ENST00000617451 LCP1P13796 627 aa25.96■■□□□ 1.75
PTPRF-216ENST00000617451 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
PTPRF-216ENST00000617451 ACSL1P33121 698 aa25.96■■□□□ 1.75
PTPRF-216ENST00000617451 SGSHP51688 502 aa25.96■■□□□ 1.75
PTPRF-216ENST00000617451 LRMPQ12912 555 aa25.96■■□□□ 1.75
PTPRF-216ENST00000617451 DBX2Q6ZNG2 339 aa25.96■■□□□ 1.75
PTPRF-216ENST00000617451 SLCO6A1Q86UG4 719 aa25.96■■□□□ 1.75
PTPRF-216ENST00000617451 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
PTPRF-216ENST00000617451 AHI1Q8N157 1196 aa25.96■■□□□ 1.75
PTPRF-216ENST00000617451 SLC35F5Q8WV83 523 aa25.96■■□□□ 1.75
PTPRF-216ENST00000617451 TFAP2BQ92481 460 aa25.96■■□□□ 1.75
PTPRF-216ENST00000617451 FBRSQ9HAH7 460 aa25.96■■□□□ 1.75
PTPRF-216ENST00000617451 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa25.96■■□□□ 1.75
PTPRF-216ENST00000617451 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa25.96■■□□□ 1.75
PTPRF-216ENST00000617451 ITPR1Q14643 2758 aa25.95■■□□□ 1.75
PTPRF-216ENST00000617451 IGLV3-27P01718 113 aa25.95■■□□□ 1.74
PTPRF-216ENST00000617451 DLDP09622 509 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
PTPRF-216ENST00000617451 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
PTPRF-216ENST00000617451 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
PTPRF-216ENST00000617451 LRRC63Q05C16 580 aa25.95■■□□□ 1.74
PTPRF-216ENST00000617451 RING1Q06587 406 aa25.95■■□□□ 1.74
PTPRF-216ENST00000617451 MPP7Q5T2T1 576 aa25.95■■□□□ 1.74
PTPRF-216ENST00000617451 MBLAC2Q68D91 279 aa25.95■■□□□ 1.74
PTPRF-216ENST00000617451 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
PTPRF-216ENST00000617451 PROSER1Q86XN7 944 aa25.95■■□□□ 1.74
PTPRF-216ENST00000617451 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
PTPRF-216ENST00000617451 PRSS16Q9NQE7 514 aa25.95■■□□□ 1.74
PTPRF-216ENST00000617451 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
PTPRF-216ENST00000617451 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa25.95■■□□□ 1.74
PTPRF-216ENST00000617451 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
PTPRF-216ENST00000617451 A0A1B0GVT2 93 aa25.94■■□□□ 1.74
PTPRF-216ENST00000617451 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
PTPRF-216ENST00000617451 PAEPP09466 180 aa25.94■■□□□ 1.74
PTPRF-216ENST00000617451 RPS14P62263 151 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
PTPRF-216ENST00000617451 ZBTB16Q05516 673 aa25.94■■□□□ 1.74
PTPRF-216ENST00000617451 SCAPQ12770 1279 aa25.94■■□□□ 1.74
PTPRF-216ENST00000617451 PIK3R6Q5UE93 754 aa25.94■■□□□ 1.74
PTPRF-216ENST00000617451 PMF1Q6P1K2 205 aa25.94■■□□□ 1.74
PTPRF-216ENST00000617451 SPATA20Q8TB22 786 aa25.94■■□□□ 1.74
PTPRF-216ENST00000617451 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
PTPRF-216ENST00000617451 WFDC5Q8TCV5 224 aa25.94■■□□□ 1.74
PTPRF-216ENST00000617451 IRGQQ8WZA9 623 aa25.94■■□□□ 1.74
PTPRF-216ENST00000617451 SNX19Q92543 992 aa25.94■■□□□ 1.74
PTPRF-216ENST00000617451 OSGEPQ9NPF4 335 aa25.94■■□□□ 1.74
PTPRF-216ENST00000617451 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
PTPRF-216ENST00000617451 TRIM49BA6NDI0 452 aa25.93■■□□□ 1.74
PTPRF-216ENST00000617451 RGS7P49802 495 aa25.93■■□□□ 1.74
PTPRF-216ENST00000617451 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
PTPRF-216ENST00000617451 RFWD3Q6PCD5 774 aa25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.4 ms