RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608287.1

SGMS1-208, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 4

Gene SGMS1, Length 542 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-208ENST00000608287 KRT5P13647 590 aa20.1■□□□□ 0.81
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SGMS1-208ENST00000608287 CD6P30203 668 aa20.1■□□□□ 0.81
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SGMS1-208ENST00000608287 NPC1O15118 1278 aa20.06■□□□□ 0.8
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SGMS1-208ENST00000608287 ZBED1O96006 694 aa20.06■□□□□ 0.8
SGMS1-208ENST00000608287 PRB1P04280 392 aa20.06■□□□□ 0.8
SGMS1-208ENST00000608287 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
SGMS1-208ENST00000608287 CDK4P11802 303 aa20.06■□□□□ 0.8
SGMS1-208ENST00000608287 HNF1BP35680 557 aa20.06■□□□□ 0.8
SGMS1-208ENST00000608287 USP8P40818 1118 aa20.06■□□□□ 0.8
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