RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602338.1

TTLL3-233, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

Gene TTLL3, Length 693 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-233	ENST00000602338	EDEM1	Q92611	657 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	UBXN6	Q9BZV1	441 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	LHX5	Q9H2C1	402 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	GOLPH3L	Q9H4A5	285 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	CCDC86	Q9H6F5	360 aa	Known RBP	12.47	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	ABCB8	Q9NUT2	735 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	SFMBT1	Q9UHJ3	866 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	TSPAN16	Q9UKR8	245 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	RAX	Q9Y2V3	346 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	SNX11	Q9Y5W9	270 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	YJEFN3	A6XGL0	299 aa		12.46	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338		E7ENQ6	273 aa		12.46	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	XPO1	O14980	1071 aa	Known RBP	12.46	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	FLRT2	O43155	660 aa		12.46	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	GTF2H1	P32780	548 aa		12.46	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	AFF3	P51826	1226 aa	Known RBP	12.46	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	CBWD6	Q4V339	395 aa		12.46	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	FNDC3B	Q53EP0	1204 aa	Known RBP	12.46	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	MPPE1	Q53F39	396 aa		12.46	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	CBWD3	Q5JTY5	395 aa		12.46	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	KCNT1	Q5JUK3	1230 aa		12.46	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	CBWD5	Q5RIA9	395 aa		12.46	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	IL27RA	Q6UWB1	636 aa		12.46	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	CHST9	Q7L1S5	443 aa		12.46	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	PDZD3	Q86UT5	571 aa		12.46	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	HSCB	Q8IWL3	235 aa		12.46	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	DDX51	Q8N8A6	666 aa	Known RBP eCLIP	12.46	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	ORAI3	Q9BRQ5	295 aa		12.46	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	PCED1A	Q9H1Q7	454 aa		12.46	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	MTG2	Q9H4K7	406 aa		12.46	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	TM9SF3	Q9HD45	589 aa		12.46	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	RAB20	Q9NX57	234 aa		12.46	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	KIAA1522	Q9P206	1035 aa	Predicted RBP	12.46	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	GGA2	Q9UJY4	613 aa		12.46	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	STOML2	Q9UJZ1	356 aa		12.46	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	WDR3	Q9UNX4	943 aa	Known RBP eCLIP	12.46	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	HBS1L	Q9Y450	684 aa	Known RBP	12.46	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	GOLGA8CP	A6NN73	597 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TTLL3-233	ENST00000602338	KCNK3	O14649	394 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TTLL3-233	ENST00000602338	GABBR2	O75899	941 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TTLL3-233	ENST00000602338	SEMA4F	O95754	770 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TTLL3-233	ENST00000602338	HSP90AA1	P07900	732 aa	Known RBP	12.45	□□□□□ -0.42
TTLL3-233	ENST00000602338	RPL13	P26373	211 aa	Known RBP	12.45	□□□□□ -0.42
TTLL3-233	ENST00000602338	CD70	P32970	193 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TTLL3-233	ENST00000602338	HARS2	P49590	506 aa	Known RBP	12.45	□□□□□ -0.42
TTLL3-233	ENST00000602338	BCAT1	P54687	386 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TTLL3-233	ENST00000602338	RPS14	P62263	151 aa	Known RBP	12.45	□□□□□ -0.42
TTLL3-233	ENST00000602338	ARID5A	Q03989	594 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TTLL3-233	ENST00000602338	SOWAHC	Q53LP3	525 aa	Predicted RBP	12.45	□□□□□ -0.42
TTLL3-233	ENST00000602338	BSPRY	Q5W0U4	402 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TTLL3-233	ENST00000602338	KRBA2	Q6ZNG9	492 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TTLL3-233	ENST00000602338	TMPRSS7	Q7RTY8	843 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TTLL3-233	ENST00000602338	KIAA0907	Q7Z7F0	614 aa	Predicted RBP	12.45	□□□□□ -0.42
TTLL3-233	ENST00000602338	TTC39C	Q8N584	583 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TTLL3-233	ENST00000602338	UBR7	Q8N806	425 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TTLL3-233	ENST00000602338	UBA3	Q8TBC4	463 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TTLL3-233	ENST00000602338	RHBDD1	Q8TEB9	315 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TTLL3-233	ENST00000602338	WFIKKN2	Q8TEU8	576 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TTLL3-233	ENST00000602338	BIRC7	Q96CA5	298 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TTLL3-233	ENST00000602338	FAXDC2	Q96IV6	333 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TTLL3-233	ENST00000602338	SPATA32	Q96LK8	384 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TTLL3-233	ENST00000602338	DNAI2	Q9GZS0	605 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TTLL3-233	ENST00000602338	PRSS16	Q9NQE7	514 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TTLL3-233	ENST00000602338	ZDHHC9	Q9Y397	364 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TTLL3-233	ENST00000602338	PCDHGB2	Q9Y5G2	931 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TTLL3-233	ENST00000602338	COL5A1	P20908	1838 aa	Predicted RBP	12.45	□□□□□ -0.42
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM149A	A5PLN7	773 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TTLL3-233	ENST00000602338		O00370	1275 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TTLL3-233	ENST00000602338	TIMM44	O43615	452 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TTLL3-233	ENST00000602338	IGHV4-34	P06331	123 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TTLL3-233	ENST00000602338	PABPC1	P11940	636 aa	Known RBP	12.44	□□□□□ -0.42
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC6A4	P31645	630 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TTLL3-233	ENST00000602338	GRIA4	P48058	902 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TTLL3-233	ENST00000602338	DAOA	P59103	153 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TTLL3-233	ENST00000602338	IL9R	Q01113	521 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TTLL3-233	ENST00000602338	BST2	Q10589	180 aa	Known RBP	12.44	□□□□□ -0.42
TTLL3-233	ENST00000602338	CUL2	Q13617	745 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TTLL3-233	ENST00000602338	EDRF1	Q3B7T1	1238 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TTLL3-233	ENST00000602338	PKDCC	Q504Y2	493 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM133B	Q5BKY9	247 aa	Known RBP	12.44	□□□□□ -0.42
TTLL3-233	ENST00000602338	ADGRF1	Q5T601	910 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TTLL3-233	ENST00000602338	MBLAC2	Q68D91	279 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TTLL3-233	ENST00000602338	RFWD3	Q6PCD5	774 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TTLL3-233	ENST00000602338	AHI1	Q8N157	1196 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TTLL3-233	ENST00000602338	CCDC47	Q96A33	483 aa	Known RBP	12.44	□□□□□ -0.42
TTLL3-233	ENST00000602338	MYEOV	Q96EZ4	313 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TTLL3-233	ENST00000602338	MYO19	Q96H55	970 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TTLL3-233	ENST00000602338	PRICKLE1	Q96MT3	831 aa	Predicted RBP	12.44	□□□□□ -0.42
TTLL3-233	ENST00000602338	LRRC4	Q9HBW1	653 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TTLL3-233	ENST00000602338	OLA1	Q9NTK5	396 aa	Known RBP	12.44	□□□□□ -0.42
TTLL3-233	ENST00000602338	SERGEF	Q9UGK8	458 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TTLL3-233	ENST00000602338	ANKRD6	Q9Y2G4	727 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TTLL3-233	ENST00000602338	URB1	O60287	2271 aa	Known RBP	12.44	□□□□□ -0.42
TTLL3-233	ENST00000602338	GOLGA6L7	A0A1B0GV03	622 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TTLL3-233	ENST00000602338		H0Y8X5	98 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TTLL3-233	ENST00000602338	PIK3R2	O00459	728 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TTLL3-233	ENST00000602338	FSBP	O95073	299 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TTLL3-233	ENST00000602338	LATS1	O95835	1130 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TTLL3-233	ENST00000602338	IGLV3-27	P01718	113 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TTLL3-233	ENST00000602338	DLD	P09622	509 aa	Known RBP	12.43	□□□□□ -0.42

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