RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000594216.1

RAB11B-202, Transcript of RAB11B, member RAS oncogene family, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RAB11B, Length 894 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11B-202ENST00000594216 HOXC13P31276 330 aa15.97■□□□□ 0.15
RAB11B-202ENST00000594216 PXNP49023 591 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
RAB11B-202ENST00000594216 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
RAB11B-202ENST00000594216 EOGTQ5NDL2 527 aa15.97■□□□□ 0.15
RAB11B-202ENST00000594216 RAP1GAP2Q684P5 730 aa15.97■□□□□ 0.15
RAB11B-202ENST00000594216 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP15.97■□□□□ 0.15
RAB11B-202ENST00000594216 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa15.97■□□□□ 0.15
RAB11B-202ENST00000594216 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
RAB11B-202ENST00000594216 CAMKK1Q8N5S9 505 aa15.97■□□□□ 0.15
RAB11B-202ENST00000594216 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
RAB11B-202ENST00000594216 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
RAB11B-202ENST00000594216 NPY6RQ99463 290 aa15.97■□□□□ 0.15
RAB11B-202ENST00000594216 SEMA4AQ9H3S1 761 aa15.97■□□□□ 0.15
RAB11B-202ENST00000594216 AIPL1Q9NZN9 384 aa15.97■□□□□ 0.15
RAB11B-202ENST00000594216 STIM2Q9P246 746 aa15.97■□□□□ 0.15
RAB11B-202ENST00000594216 TMEM59LQ9UK28 342 aa15.97■□□□□ 0.15
RAB11B-202ENST00000594216 STARD13Q9Y3M8 1113 aa15.97■□□□□ 0.15
RAB11B-202ENST00000594216 DMDP11532 3685 aa15.97■□□□□ 0.15
RAB11B-202ENST00000594216 A0A1W2PQJ5 194 aa15.96■□□□□ 0.15
RAB11B-202ENST00000594216 SGK1O00141 431 aa15.96■□□□□ 0.15
RAB11B-202ENST00000594216 APBB3O95704 486 aa15.96■□□□□ 0.15
RAB11B-202ENST00000594216 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
RAB11B-202ENST00000594216 TACR2P21452 398 aa15.96■□□□□ 0.15
RAB11B-202ENST00000594216 FLT3P36888 993 aa15.96■□□□□ 0.15
RAB11B-202ENST00000594216 MRE11P49959 708 aa15.96■□□□□ 0.15
RAB11B-202ENST00000594216 DGKEP52429 567 aa15.96■□□□□ 0.15
RAB11B-202ENST00000594216 DEUP1Q05D60 604 aa15.96■□□□□ 0.15
RAB11B-202ENST00000594216 KLHL30Q0D2K2 578 aa15.96■□□□□ 0.15
RAB11B-202ENST00000594216 MTA1Q13330 715 aa15.96■□□□□ 0.15
RAB11B-202ENST00000594216 GEN1Q17RS7 908 aa15.96■□□□□ 0.15
RAB11B-202ENST00000594216 SLC25A52Q3SY17 297 aa15.96■□□□□ 0.15
RAB11B-202ENST00000594216 MS4A13Q5J8X5 152 aa15.96■□□□□ 0.15
RAB11B-202ENST00000594216 MPP7Q5T2T1 576 aa15.96■□□□□ 0.15
RAB11B-202ENST00000594216 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
RAB11B-202ENST00000594216 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa15.96■□□□□ 0.15
RAB11B-202ENST00000594216 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
RAB11B-202ENST00000594216 CHPFQ8IZ52 775 aa15.96■□□□□ 0.15
RAB11B-202ENST00000594216 LGI2Q8N0V4 545 aa15.96■□□□□ 0.15
RAB11B-202ENST00000594216 EMC1Q8N766 993 aa15.96■□□□□ 0.15
RAB11B-202ENST00000594216 TSTD1Q8NFU3 115 aa15.96■□□□□ 0.15
RAB11B-202ENST00000594216 CPLX3Q8WVH0 158 aa15.96■□□□□ 0.15
RAB11B-202ENST00000594216 NT5C3BQ969T7 300 aa15.96■□□□□ 0.15
RAB11B-202ENST00000594216 IQCDQ96DY2 449 aa15.96■□□□□ 0.15
RAB11B-202ENST00000594216 CFAP57Q96MR6 1250 aa15.96■□□□□ 0.15
RAB11B-202ENST00000594216 TBCBQ99426 244 aa15.96■□□□□ 0.15
RAB11B-202ENST00000594216 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
RAB11B-202ENST00000594216 HAUS4Q9H6D7 363 aa15.96■□□□□ 0.15
RAB11B-202ENST00000594216 PIGVQ9NUD9 493 aa15.96■□□□□ 0.15
RAB11B-202ENST00000594216 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa15.96■□□□□ 0.15
RAB11B-202ENST00000594216 F5H5T6 163 aa15.95■□□□□ 0.14
RAB11B-202ENST00000594216 CBFA2T2O43439 604 aa15.95■□□□□ 0.14
RAB11B-202ENST00000594216 LILRB5O75023 590 aa15.95■□□□□ 0.14
RAB11B-202ENST00000594216 ADAM23O75077 832 aa15.95■□□□□ 0.14
RAB11B-202ENST00000594216 F9P00740 461 aa15.95■□□□□ 0.14
RAB11B-202ENST00000594216 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
RAB11B-202ENST00000594216 RPS24P62847 133 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
RAB11B-202ENST00000594216 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
RAB11B-202ENST00000594216 PTP4A2Q12974 167 aa15.95■□□□□ 0.14
RAB11B-202ENST00000594216 CRY1Q16526 586 aa15.95■□□□□ 0.14
RAB11B-202ENST00000594216 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
RAB11B-202ENST00000594216 SDE2Q6IQ49 451 aa15.95■□□□□ 0.14
RAB11B-202ENST00000594216 ACAD10Q6JQN1 1059 aa15.95■□□□□ 0.14
RAB11B-202ENST00000594216 MON1BQ7L1V2 547 aa15.95■□□□□ 0.14
RAB11B-202ENST00000594216 ARCQ7LC44 396 aa15.95■□□□□ 0.14
RAB11B-202ENST00000594216 WDR5BQ86VZ2 330 aa15.95■□□□□ 0.14
RAB11B-202ENST00000594216 MFN1Q8IWA4 741 aa15.95■□□□□ 0.14
RAB11B-202ENST00000594216 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
RAB11B-202ENST00000594216 CFAP52Q8N1V2 620 aa15.95■□□□□ 0.14
RAB11B-202ENST00000594216 CARNMT1Q8N4J0 409 aa15.95■□□□□ 0.14
RAB11B-202ENST00000594216 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
RAB11B-202ENST00000594216 UCMAQ8WVF2 138 aa15.95■□□□□ 0.14
RAB11B-202ENST00000594216 MYEOVQ96EZ4 313 aa15.95■□□□□ 0.14
RAB11B-202ENST00000594216 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
RAB11B-202ENST00000594216 SELENOOQ9BVL4 669 aa15.95■□□□□ 0.14
RAB11B-202ENST00000594216 ADAM33Q9BZ11 813 aa15.95■□□□□ 0.14
RAB11B-202ENST00000594216 CIPCQ9C0C6 399 aa15.95■□□□□ 0.14
RAB11B-202ENST00000594216 WDCPQ9H6R7 721 aa15.95■□□□□ 0.14
RAB11B-202ENST00000594216 ABCB8Q9NUT2 735 aa15.95■□□□□ 0.14
RAB11B-202ENST00000594216 TMEM51Q9NW97 253 aa15.95■□□□□ 0.14
RAB11B-202ENST00000594216 HCN2Q9UL51 889 aa15.95■□□□□ 0.14
RAB11B-202ENST00000594216 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa15.95■□□□□ 0.14
RAB11B-202ENST00000594216 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa15.94■□□□□ 0.14
RAB11B-202ENST00000594216 TMCO5BA8MYB1 307 aa15.94■□□□□ 0.14
RAB11B-202ENST00000594216 ALDH1A2O94788 518 aa15.94■□□□□ 0.14
RAB11B-202ENST00000594216 GJB6O95452 261 aa15.94■□□□□ 0.14
RAB11B-202ENST00000594216 LMNAP02545 664 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
RAB11B-202ENST00000594216 KRT3P12035 628 aa15.94■□□□□ 0.14
RAB11B-202ENST00000594216 SKILP12757 684 aa15.94■□□□□ 0.14
RAB11B-202ENST00000594216 PDGFRAP16234 1089 aa15.94■□□□□ 0.14
RAB11B-202ENST00000594216 HLA-FP30511 346 aa15.94■□□□□ 0.14
RAB11B-202ENST00000594216 NTSR1P30989 418 aa15.94■□□□□ 0.14
RAB11B-202ENST00000594216 RDXP35241 583 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
RAB11B-202ENST00000594216 PRKCIP41743 596 aa15.94■□□□□ 0.14
RAB11B-202ENST00000594216 WASP42768 502 aa15.94■□□□□ 0.14
RAB11B-202ENST00000594216 CXCR3P49682 368 aa15.94■□□□□ 0.14
RAB11B-202ENST00000594216 GSCP56915 257 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
RAB11B-202ENST00000594216 ATP11AP98196 1134 aa15.94■□□□□ 0.14
RAB11B-202ENST00000594216 CDH18Q13634 790 aa15.94■□□□□ 0.14
RAB11B-202ENST00000594216 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
RAB11B-202ENST00000594216 BRMS1LQ5PSV4 323 aa15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms