RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592408.5

EFTUD2-222, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 561 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-222ENST00000592408 APRTP07741 180 aa9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 MLNP12872 115 aa9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 WARSP23381 471 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 RBL1P28749 1068 aa9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 ADORA2BP29275 332 aa9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 PSMC4P43686 418 aa9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 SULT1E1P49888 294 aa9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 HDAC4P56524 1084 aa9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 SLC18A2Q05940 514 aa9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 SLC1A5Q15758 541 aa9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 ATG16L1Q676U5 607 aa9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 CGB2Q6NT52 195 aa9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 TRNP1Q6NT89 227 aa9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 RPAINQ86UA6 219 aa9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 LRRC6Q86X45 466 aa9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 CTAGE3PQ8IX95 158 aa9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 ADGRF2Q8IZF7 708 aa9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 NME8Q8N427 588 aa9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 C12orf29Q8N999 325 aa9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 PCDH19Q8TAB3 1148 aa9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 GSDMBQ8TAX9 411 aa9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 TCP10LQ8TDR4 215 aa9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 MZB1Q8WU39 189 aa9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 BRI3BPQ8WY22 251 aa9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 CDKL2Q92772 493 aa9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 ERP27Q96DN0 273 aa9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 RMDN2Q96LZ7 410 aa9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 OSMRQ99650 979 aa9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 NAT9Q9BTE0 207 aa9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 C10orf88Q9H8K7 445 aa9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 KIF9Q9HAQ2 790 aa9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 USP29Q9HBJ7 922 aa9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 POPDC2Q9HBU9 364 aa9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 NOD2Q9HC29 1040 aa9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 SAR1AQ9NR31 198 aa9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 ARHGEF3Q9NR81 526 aa9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 SLC38A7Q9NVC3 462 aa9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 SETD4Q9NVD3 440 aa9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 GINS2Q9Y248 185 aa9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 RAD54BQ9Y620 910 aa9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 A0A0A0MRY4 1105 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 A0A1W2PPM1 405 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 GLTPD2A6NH11 291 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 FOXO6A8MYZ6 492 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 M0QZ92 97 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 PIK3R2O00459 728 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 PIRO00625 290 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 C2CD2LO14523 706 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 KLF11O14901 512 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 OPHN1O60890 802 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 TGDSO95455 350 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 APOEP02649 317 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 LCP1P13796 627 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 PRKCHP24723 683 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 ADRA1DP25100 572 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 CCNFP41002 786 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 MATKP42679 507 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 NEK3P51956 506 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 SEMA5AQ13591 1074 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 PDK1Q15118 436 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 SOWAHAQ2M3V2 549 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 PARP6Q2NL67 630 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 SLC25A52Q3SY17 297 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 XKR4Q5GH76 650 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 ALKAL1Q6UXT8 129 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 ASRGL1Q7L266 308 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 TLK2Q86UE8 772 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 FITM2Q8N6M3 262 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 C7orf31Q8N865 590 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 C10orf82Q8WW14 230 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 SPATA13Q96N96 652 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 CSPG4P5Q96PW8 444 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 TMEM237Q96Q45 408 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.6 ms