RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 DPYSQ14117 519 aa32.09■■■□□ 2.73
CAPNS1-206ENST00000588815 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP32.09■■■□□ 2.73
CAPNS1-206ENST00000588815 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP32.09■■■□□ 2.73
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC35B2Q8TB61 432 aa32.09■■■□□ 2.73
CAPNS1-206ENST00000588815 MAGEB5Q9BZ81 275 aa32.09■■■□□ 2.73
CAPNS1-206ENST00000588815 ARHGEF4Q9NR80 690 aa32.09■■■□□ 2.73
CAPNS1-206ENST00000588815 DYNC1I1O14576 645 aa32.08■■■□□ 2.73
CAPNS1-206ENST00000588815 DAPK3O43293 454 aa32.08■■■□□ 2.73
CAPNS1-206ENST00000588815 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP32.08■■■□□ 2.73
CAPNS1-206ENST00000588815 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP32.08■■■□□ 2.73
CAPNS1-206ENST00000588815 NOMO1Q15155 1222 aa32.08■■■□□ 2.73
CAPNS1-206ENST00000588815 TTC27Q6P3X3 843 aa32.08■■■□□ 2.73
CAPNS1-206ENST00000588815 GAREM2Q75VX8 874 aa32.08■■■□□ 2.73
CAPNS1-206ENST00000588815 ATG4AQ8WYN0 398 aa32.08■■■□□ 2.73
CAPNS1-206ENST00000588815 AZIN2Q96A70 460 aa32.08■■■□□ 2.73
CAPNS1-206ENST00000588815 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP32.08■■■□□ 2.73
CAPNS1-206ENST00000588815 PRO3102Q9H379 93 aa32.08■■■□□ 2.73
CAPNS1-206ENST00000588815 CHD7Q9P2D1 2997 aa32.08■■■□□ 2.73
CAPNS1-206ENST00000588815 NUP205Q92621 2012 aa32.07■■■□□ 2.72
CAPNS1-206ENST00000588815 PAPLNO95428 1278 aa32.07■■■□□ 2.72
CAPNS1-206ENST00000588815 HOXC13P31276 330 aa32.07■■■□□ 2.72
CAPNS1-206ENST00000588815 VCPP55072 806 aaKnown RBP32.07■■■□□ 2.72
CAPNS1-206ENST00000588815 WDR93Q6P2C0 686 aa32.07■■■□□ 2.72
CAPNS1-206ENST00000588815 CORO1BQ9BR76 489 aa32.07■■■□□ 2.72
CAPNS1-206ENST00000588815 RAB17Q9H0T7 212 aa32.07■■■□□ 2.72
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM72CH0Y354 149 aa32.06■■■□□ 2.72
CAPNS1-206ENST00000588815 MCF2LO15068 1137 aa32.06■■■□□ 2.72
CAPNS1-206ENST00000588815 LRIG2O94898 1065 aa32.06■■■□□ 2.72
CAPNS1-206ENST00000588815 ECEL1O95672 775 aa32.06■■■□□ 2.72
CAPNS1-206ENST00000588815 GAS8O95995 478 aa32.06■■■□□ 2.72
CAPNS1-206ENST00000588815 ITGAVP06756 1048 aa32.06■■■□□ 2.72
CAPNS1-206ENST00000588815 AMPD1P23109 780 aa32.06■■■□□ 2.72
CAPNS1-206ENST00000588815 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP32.06■■■□□ 2.72
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM72AQ5TYM5 149 aa32.06■■■□□ 2.72
CAPNS1-206ENST00000588815 MANEALQ5VSG8 457 aa32.06■■■□□ 2.72
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM72DQ6L9T8 149 aa32.06■■■□□ 2.72
CAPNS1-206ENST00000588815 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP32.06■■■□□ 2.72
CAPNS1-206ENST00000588815 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa32.06■■■□□ 2.72
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM72BQ86X60 149 aa32.06■■■□□ 2.72
CAPNS1-206ENST00000588815 PRKD2Q9BZL6 878 aa32.06■■■□□ 2.72
CAPNS1-206ENST00000588815 ZMYM5Q9UJ78 669 aa32.06■■■□□ 2.72
CAPNS1-206ENST00000588815 RAD54BQ9Y620 910 aa32.06■■■□□ 2.72
CAPNS1-206ENST00000588815 C2orf78A6NCI8 922 aa32.05■■■□□ 2.72
CAPNS1-206ENST00000588815 PER2O15055 1255 aa32.05■■■□□ 2.72
CAPNS1-206ENST00000588815 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP32.05■■■□□ 2.72
CAPNS1-206ENST00000588815 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP32.05■■■□□ 2.72
CAPNS1-206ENST00000588815 PTGIRP43119 386 aa32.05■■■□□ 2.72
CAPNS1-206ENST00000588815 HARS2P49590 506 aaKnown RBP32.05■■■□□ 2.72
CAPNS1-206ENST00000588815 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP32.05■■■□□ 2.72
CAPNS1-206ENST00000588815 OASLQ15646 514 aaKnown RBP32.05■■■□□ 2.72
CAPNS1-206ENST00000588815 HS6ST3Q8IZP7 471 aa32.05■■■□□ 2.72
CAPNS1-206ENST00000588815 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP32.05■■■□□ 2.72
CAPNS1-206ENST00000588815 SIK2Q9H0K1 926 aa32.05■■■□□ 2.72
CAPNS1-206ENST00000588815 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP32.05■■■□□ 2.72
CAPNS1-206ENST00000588815 DNPEPQ9ULA0 475 aa32.05■■■□□ 2.72
CAPNS1-206ENST00000588815 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP32.05■■■□□ 2.72
CAPNS1-206ENST00000588815 HS3ST4Q9Y661 456 aa32.05■■■□□ 2.72
CAPNS1-206ENST00000588815 DCLK1O15075 740 aa32.04■■■□□ 2.72
CAPNS1-206ENST00000588815 TTI1O43156 1089 aa32.04■■■□□ 2.72
CAPNS1-206ENST00000588815 RFPL2O75678 378 aa32.04■■■□□ 2.72
CAPNS1-206ENST00000588815 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP32.04■■■□□ 2.72
CAPNS1-206ENST00000588815 XRCC4Q13426 336 aa32.04■■■□□ 2.72
CAPNS1-206ENST00000588815 SNX1Q13596 522 aa32.04■■■□□ 2.72
CAPNS1-206ENST00000588815 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa32.04■■■□□ 2.72
CAPNS1-206ENST00000588815 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP32.04■■■□□ 2.72
CAPNS1-206ENST00000588815 JAMLQ86YT9 394 aa32.04■■■□□ 2.72
CAPNS1-206ENST00000588815 TBC1D31Q96DN5 1066 aa32.04■■■□□ 2.72
CAPNS1-206ENST00000588815 RNF38Q9H0F5 515 aa32.04■■■□□ 2.72
CAPNS1-206ENST00000588815 ATXN3LQ9H3M9 355 aa32.04■■■□□ 2.72
CAPNS1-206ENST00000588815 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa32.04■■■□□ 2.72
CAPNS1-206ENST00000588815 DONSONQ9NYP3 566 aa32.04■■■□□ 2.72
CAPNS1-206ENST00000588815 RAB21Q9UL25 225 aa32.04■■■□□ 2.72
CAPNS1-206ENST00000588815 EPOPA6NHQ4 379 aa32.03■■■□□ 2.72
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP32.03■■■□□ 2.72
CAPNS1-206ENST00000588815 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP32.03■■■□□ 2.72
CAPNS1-206ENST00000588815 ERCC2P18074 760 aa32.03■■■□□ 2.72
CAPNS1-206ENST00000588815 EPHB2P29323 1055 aa32.03■■■□□ 2.72
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CAPNS1-206ENST00000588815 KCNJ1P48048 391 aa32.03■■■□□ 2.72
CAPNS1-206ENST00000588815 HAUS1Q96CS2 278 aa32.03■■■□□ 2.72
CAPNS1-206ENST00000588815 PARD6BQ9BYG5 372 aa32.03■■■□□ 2.72
CAPNS1-206ENST00000588815 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP32.03■■■□□ 2.72
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CAPNS1-206ENST00000588815 SPDYE4A6NLX3 237 aa32.03■■■□□ 2.72
CAPNS1-206ENST00000588815 LATS1O95835 1130 aa32.03■■■□□ 2.72
CAPNS1-206ENST00000588815 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP32.03■■■□□ 2.72
CAPNS1-206ENST00000588815 MYL4P12829 197 aa32.03■■■□□ 2.72
CAPNS1-206ENST00000588815 HDCP19113 662 aa32.03■■■□□ 2.72
CAPNS1-206ENST00000588815 NRIP1P48552 1158 aa32.03■■■□□ 2.72
CAPNS1-206ENST00000588815 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP32.03■■■□□ 2.72
CAPNS1-206ENST00000588815 MS4A13Q5J8X5 152 aa32.03■■■□□ 2.72
CAPNS1-206ENST00000588815 PIK3R6Q5UE93 754 aa32.03■■■□□ 2.72
CAPNS1-206ENST00000588815 TMCO3Q6UWJ1 677 aa32.03■■■□□ 2.72
CAPNS1-206ENST00000588815 LRRC31Q6UY01 552 aa32.03■■■□□ 2.72
CAPNS1-206ENST00000588815 IFT20Q8IY31 132 aa32.03■■■□□ 2.72
CAPNS1-206ENST00000588815 CCDC114Q96M63 670 aa32.03■■■□□ 2.72
CAPNS1-206ENST00000588815 TRPC7Q9HCX4 862 aa32.03■■■□□ 2.72
CAPNS1-206ENST00000588815 DZANK1Q9NVP4 752 aa32.03■■■□□ 2.72
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF148Q9UQR1 794 aa32.03■■■□□ 2.72
CAPNS1-206ENST00000588815 A0A1W2PPC1 479 aa32.02■■■□□ 2.72
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