RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566286.5

TCF4-232, Transcript of transcription factor 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TCF4, Length 2,119 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF4-232ENST00000566286 CSH1P0DML2 217 aa11.3□□□□□ -0.6
TCF4-232ENST00000566286 CSH2P0DML3 217 aa11.3□□□□□ -0.6
TCF4-232ENST00000566286 CD53P19397 219 aa11.3□□□□□ -0.6
TCF4-232ENST00000566286 TGM2P21980 687 aa11.3□□□□□ -0.6
TCF4-232ENST00000566286 GABRB2P47870 512 aa11.3□□□□□ -0.6
TCF4-232ENST00000566286 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
TCF4-232ENST00000566286 ERFP50548 548 aa11.3□□□□□ -0.6
TCF4-232ENST00000566286 SLC25A3Q00325 362 aa11.3□□□□□ -0.6
TCF4-232ENST00000566286 BTKQ06187 659 aa11.3□□□□□ -0.6
TCF4-232ENST00000566286 TUBB3Q13509 450 aa11.3□□□□□ -0.6
TCF4-232ENST00000566286 TAF5Q15542 800 aa11.3□□□□□ -0.6
TCF4-232ENST00000566286 RABGAP1LQ5R372 815 aa11.3□□□□□ -0.6
TCF4-232ENST00000566286 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa11.3□□□□□ -0.6
TCF4-232ENST00000566286 UNC5AQ6ZN44 842 aa11.3□□□□□ -0.6
TCF4-232ENST00000566286 ILDR2Q71H61 639 aa11.3□□□□□ -0.6
TCF4-232ENST00000566286 ACMSDQ8TDX5 336 aa11.3□□□□□ -0.6
TCF4-232ENST00000566286 NAT14Q8WUY8 206 aa11.3□□□□□ -0.6
TCF4-232ENST00000566286 PYDC1Q8WXC3 89 aa11.3□□□□□ -0.6
TCF4-232ENST00000566286 CMTM5Q96DZ9 223 aa11.3□□□□□ -0.6
TCF4-232ENST00000566286 MCRS1Q96EZ8 462 aa11.3□□□□□ -0.6
TCF4-232ENST00000566286 NLRP4Q96MN2 994 aa11.3□□□□□ -0.6
TCF4-232ENST00000566286 CPXM1Q96SM3 734 aa11.3□□□□□ -0.6
TCF4-232ENST00000566286 C20orf27Q9GZN8 174 aa11.3□□□□□ -0.6
TCF4-232ENST00000566286 SMYD2Q9NRG4 433 aa11.3□□□□□ -0.6
TCF4-232ENST00000566286 ETNK2Q9NVF9 386 aa11.3□□□□□ -0.6
TCF4-232ENST00000566286 CYTH4Q9UIA0 394 aa11.3□□□□□ -0.6
TCF4-232ENST00000566286 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
TCF4-232ENST00000566286 MEI4A8MW99 385 aa11.29□□□□□ -0.6
TCF4-232ENST00000566286 AP1G1O43747 822 aa11.29□□□□□ -0.6
TCF4-232ENST00000566286 FAM189A1O60320 539 aa11.29□□□□□ -0.6
TCF4-232ENST00000566286 TOM1L1O75674 476 aa11.29□□□□□ -0.6
TCF4-232ENST00000566286 RGS20O76081 388 aa11.29□□□□□ -0.6
TCF4-232ENST00000566286 BPNT1O95861 308 aa11.29□□□□□ -0.6
TCF4-232ENST00000566286 ZBED1O96006 694 aa11.29□□□□□ -0.6
TCF4-232ENST00000566286 PENKP01210 267 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
TCF4-232ENST00000566286 EDN1P05305 212 aa11.29□□□□□ -0.6
TCF4-232ENST00000566286 APRTP07741 180 aa11.29□□□□□ -0.6
TCF4-232ENST00000566286 VCLP18206 1134 aa11.29□□□□□ -0.6
TCF4-232ENST00000566286 L1CAMP32004 1257 aa11.29□□□□□ -0.6
TCF4-232ENST00000566286 TNFSF9P41273 254 aa11.29□□□□□ -0.6
TCF4-232ENST00000566286 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
TCF4-232ENST00000566286 ITGA9Q13797 1035 aa11.29□□□□□ -0.6
TCF4-232ENST00000566286 MMEL1Q495T6 779 aa11.29□□□□□ -0.6
TCF4-232ENST00000566286 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
TCF4-232ENST00000566286 SFT2D3Q587I9 215 aa11.29□□□□□ -0.6
TCF4-232ENST00000566286 MROH9Q5TGP6 573 aa11.29□□□□□ -0.6
TCF4-232ENST00000566286 SCARA3Q6AZY7 606 aa11.29□□□□□ -0.6
TCF4-232ENST00000566286 PGM2L1Q6PCE3 622 aa11.29□□□□□ -0.6
TCF4-232ENST00000566286 PPP4R1Q8TF05 950 aa11.29□□□□□ -0.6
TCF4-232ENST00000566286 GDPD5Q8WTR4 605 aa11.29□□□□□ -0.6
TCF4-232ENST00000566286 RNF157Q96PX1 679 aa11.29□□□□□ -0.6
TCF4-232ENST00000566286 CNPY3Q9BT09 278 aa11.29□□□□□ -0.6
TCF4-232ENST00000566286 TCHPQ9BT92 498 aa11.29□□□□□ -0.6
TCF4-232ENST00000566286 APOL6Q9BWW8 343 aa11.29□□□□□ -0.6
TCF4-232ENST00000566286 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
TCF4-232ENST00000566286 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
TCF4-232ENST00000566286 SMYD3Q9H7B4 428 aa11.29□□□□□ -0.6
TCF4-232ENST00000566286 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa11.29□□□□□ -0.6
TCF4-232ENST00000566286 ZNF302Q9NR11 478 aa11.29□□□□□ -0.6
TCF4-232ENST00000566286 ATXN10Q9UBB4 475 aa11.29□□□□□ -0.6
TCF4-232ENST00000566286 TJP2Q9UDY2 1190 aa11.29□□□□□ -0.6
TCF4-232ENST00000566286 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa11.29□□□□□ -0.6
TCF4-232ENST00000566286 A0A1B0GVG6 124 aa11.29□□□□□ -0.6
TCF4-232ENST00000566286 FZD9O00144 591 aa11.29□□□□□ -0.6
TCF4-232ENST00000566286 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
TCF4-232ENST00000566286 OGTO15294 1046 aa11.29□□□□□ -0.6
TCF4-232ENST00000566286 GLRA3O75311 464 aa11.29□□□□□ -0.6
TCF4-232ENST00000566286 TNNC2P02585 160 aa11.29□□□□□ -0.6
TCF4-232ENST00000566286 ERBB2P04626 1255 aa11.29□□□□□ -0.6
TCF4-232ENST00000566286 GRK2P25098 689 aa11.29□□□□□ -0.6
TCF4-232ENST00000566286 MAGEA3P43357 314 aa11.29□□□□□ -0.6
TCF4-232ENST00000566286 CHN2P52757 468 aa11.29□□□□□ -0.6
TCF4-232ENST00000566286 EFNA5P52803 228 aa11.29□□□□□ -0.6
TCF4-232ENST00000566286 MMRN1Q13201 1228 aa11.29□□□□□ -0.6
TCF4-232ENST00000566286 TNFAIP1Q13829 316 aa11.29□□□□□ -0.6
TCF4-232ENST00000566286 CCNIQ14094 377 aa11.29□□□□□ -0.6
TCF4-232ENST00000566286 KRT81Q14533 505 aa11.29□□□□□ -0.6
TCF4-232ENST00000566286 PDK2Q15119 407 aa11.29□□□□□ -0.6
TCF4-232ENST00000566286 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa11.29□□□□□ -0.6
TCF4-232ENST00000566286 MBLAC2Q68D91 279 aa11.29□□□□□ -0.6
TCF4-232ENST00000566286 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa11.29□□□□□ -0.6
TCF4-232ENST00000566286 CYS1Q717R9 158 aa11.29□□□□□ -0.6
TCF4-232ENST00000566286 SAMD7Q7Z3H4 446 aa11.29□□□□□ -0.6
TCF4-232ENST00000566286 ATCAYQ86WG3 371 aa11.29□□□□□ -0.6
TCF4-232ENST00000566286 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa11.29□□□□□ -0.6
TCF4-232ENST00000566286 ATP2A3Q93084 1043 aa11.29□□□□□ -0.6
TCF4-232ENST00000566286 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
TCF4-232ENST00000566286 ADPGKQ9BRR6 497 aa11.29□□□□□ -0.6
TCF4-232ENST00000566286 PLAC1Q9HBJ0 212 aa11.29□□□□□ -0.6
TCF4-232ENST00000566286 DNAJC28Q9NX36 388 aa11.29□□□□□ -0.6
TCF4-232ENST00000566286 CDH22Q9UJ99 828 aa11.29□□□□□ -0.6
TCF4-232ENST00000566286 TMCO1Q9UM00 188 aa11.29□□□□□ -0.6
TCF4-232ENST00000566286 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa11.29□□□□□ -0.6
TCF4-232ENST00000566286 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa11.28□□□□□ -0.6
TCF4-232ENST00000566286 VWA5AO00534 786 aa11.28□□□□□ -0.6
TCF4-232ENST00000566286 APOL1O14791 398 aa11.28□□□□□ -0.6
TCF4-232ENST00000566286 PRPSAP2O60256 369 aa11.28□□□□□ -0.6
TCF4-232ENST00000566286 UGT1A9O60656 530 aa11.28□□□□□ -0.6
TCF4-232ENST00000566286 SIN3BO75182 1162 aa11.28□□□□□ -0.6
TCF4-232ENST00000566286 GPD1P21695 349 aa11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.7 ms