RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558936.5

RABGGTA-207, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTA, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-207ENST00000558936 NNTQ13423 1086 aa13.13□□□□□ -0.31
RABGGTA-207ENST00000558936 ENPP2Q13822 863 aa13.13□□□□□ -0.31
RABGGTA-207ENST00000558936 DMC1Q14565 340 aa13.13□□□□□ -0.31
RABGGTA-207ENST00000558936 PTPRNQ16849 979 aa13.13□□□□□ -0.31
RABGGTA-207ENST00000558936 FBXO43Q4G163 708 aa13.13□□□□□ -0.31
RABGGTA-207ENST00000558936 MS4A13Q5J8X5 152 aa13.13□□□□□ -0.31
RABGGTA-207ENST00000558936 LRSAM1Q6UWE0 723 aa13.13□□□□□ -0.31
RABGGTA-207ENST00000558936 RASSF3Q86WH2 238 aa13.13□□□□□ -0.31
RABGGTA-207ENST00000558936 ERICH1Q86X53 443 aa13.13□□□□□ -0.31
RABGGTA-207ENST00000558936 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
RABGGTA-207ENST00000558936 ZNF677Q86XU0 584 aa13.13□□□□□ -0.31
RABGGTA-207ENST00000558936 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
RABGGTA-207ENST00000558936 DCLK2Q8N568 766 aa13.13□□□□□ -0.31
RABGGTA-207ENST00000558936 EXOC4Q96A65 974 aa13.13□□□□□ -0.31
RABGGTA-207ENST00000558936 C11orf70Q9BRQ4 267 aa13.13□□□□□ -0.31
RABGGTA-207ENST00000558936 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
RABGGTA-207ENST00000558936 DCLK3Q9C098 648 aa13.13□□□□□ -0.31
RABGGTA-207ENST00000558936 SLC6A17Q9H1V8 727 aa13.13□□□□□ -0.31
RABGGTA-207ENST00000558936 SEMA4AQ9H3S1 761 aa13.13□□□□□ -0.31
RABGGTA-207ENST00000558936 AIPL1Q9NZN9 384 aa13.13□□□□□ -0.31
RABGGTA-207ENST00000558936 IFNKQ9P0W0 207 aa13.13□□□□□ -0.31
RABGGTA-207ENST00000558936 WDR35Q9P2L0 1181 aa13.13□□□□□ -0.31
RABGGTA-207ENST00000558936 DEC1Q9P2X7 70 aa13.13□□□□□ -0.31
RABGGTA-207ENST00000558936 ZNF212Q9UDV6 495 aa13.13□□□□□ -0.31
RABGGTA-207ENST00000558936 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
RABGGTA-207ENST00000558936 STRIP2Q9ULQ0 834 aa13.13□□□□□ -0.31
RABGGTA-207ENST00000558936 MMP17Q9ULZ9 603 aa13.13□□□□□ -0.31
RABGGTA-207ENST00000558936 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
RABGGTA-207ENST00000558936 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
RABGGTA-207ENST00000558936 FAM186AA6NE01 2351 aa13.12□□□□□ -0.31
RABGGTA-207ENST00000558936 GOLGA8SH3BPF8 625 aa13.12□□□□□ -0.31
RABGGTA-207ENST00000558936 DCLK1O15075 740 aa13.12□□□□□ -0.31
RABGGTA-207ENST00000558936 ATG13O75143 517 aa13.12□□□□□ -0.31
RABGGTA-207ENST00000558936 ENDOD1O94919 500 aa13.12□□□□□ -0.31
RABGGTA-207ENST00000558936 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
RABGGTA-207ENST00000558936 LSM8O95777 96 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
RABGGTA-207ENST00000558936 LATS1O95835 1130 aa13.12□□□□□ -0.31
RABGGTA-207ENST00000558936 GYPCP04921 128 aa13.12□□□□□ -0.31
RABGGTA-207ENST00000558936 NOS2P35228 1153 aa13.12□□□□□ -0.31
RABGGTA-207ENST00000558936 PRKCIP41743 596 aa13.12□□□□□ -0.31
RABGGTA-207ENST00000558936 MATKP42679 507 aa13.12□□□□□ -0.31
RABGGTA-207ENST00000558936 DGKGP49619 791 aa13.12□□□□□ -0.31
RABGGTA-207ENST00000558936 CXCR3P49682 368 aa13.12□□□□□ -0.31
RABGGTA-207ENST00000558936 GSCP56915 257 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
RABGGTA-207ENST00000558936 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
RABGGTA-207ENST00000558936 CRY1Q16526 586 aa13.12□□□□□ -0.31
RABGGTA-207ENST00000558936 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
RABGGTA-207ENST00000558936 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
RABGGTA-207ENST00000558936 CCDC14Q49A88 953 aa13.12□□□□□ -0.31
RABGGTA-207ENST00000558936 EFHC1Q5JVL4 640 aa13.12□□□□□ -0.31
RABGGTA-207ENST00000558936 C10orf76Q5T2E6 689 aa13.12□□□□□ -0.31
RABGGTA-207ENST00000558936 RAP1GAP2Q684P5 730 aa13.12□□□□□ -0.31
RABGGTA-207ENST00000558936 GRAMD4Q6IC98 578 aa13.12□□□□□ -0.31
RABGGTA-207ENST00000558936 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
RABGGTA-207ENST00000558936 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa13.12□□□□□ -0.31
RABGGTA-207ENST00000558936 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP13.12□□□□□ -0.31
RABGGTA-207ENST00000558936 MDGA1Q8NFP4 955 aa13.12□□□□□ -0.31
RABGGTA-207ENST00000558936 ATRIPQ8WXE1 791 aa13.12□□□□□ -0.31
RABGGTA-207ENST00000558936 ALG14Q96F25 216 aa13.12□□□□□ -0.31
RABGGTA-207ENST00000558936 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
RABGGTA-207ENST00000558936 CFAP57Q96MR6 1250 aa13.12□□□□□ -0.31
RABGGTA-207ENST00000558936 SPAG5Q96R06 1193 aa13.12□□□□□ -0.31
RABGGTA-207ENST00000558936 TRIM7Q9C029 511 aa13.12□□□□□ -0.31
RABGGTA-207ENST00000558936 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
RABGGTA-207ENST00000558936 HAUS4Q9H6D7 363 aa13.12□□□□□ -0.31
RABGGTA-207ENST00000558936 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
RABGGTA-207ENST00000558936 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa13.12□□□□□ -0.31
RABGGTA-207ENST00000558936 NENFQ9UMX5 172 aa13.12□□□□□ -0.31
RABGGTA-207ENST00000558936 NEU3Q9UQ49 428 aa13.12□□□□□ -0.31
RABGGTA-207ENST00000558936 ZNF510Q9Y2H8 683 aa13.12□□□□□ -0.31
RABGGTA-207ENST00000558936 RAD54BQ9Y620 910 aa13.12□□□□□ -0.31
RABGGTA-207ENST00000558936 HS3ST4Q9Y661 456 aa13.12□□□□□ -0.31
RABGGTA-207ENST00000558936 NUMA1Q14980 2115 aa13.12□□□□□ -0.31
RABGGTA-207ENST00000558936 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa13.11□□□□□ -0.31
RABGGTA-207ENST00000558936 TBC1D3BA6NDS4 549 aa13.11□□□□□ -0.31
RABGGTA-207ENST00000558936 C2CD4BA6NLJ0 364 aa13.11□□□□□ -0.31
RABGGTA-207ENST00000558936 M0QYT0 321 aa13.11□□□□□ -0.31
RABGGTA-207ENST00000558936 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
RABGGTA-207ENST00000558936 LMNAP02545 664 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
RABGGTA-207ENST00000558936 APODP05090 189 aa13.11□□□□□ -0.31
RABGGTA-207ENST00000558936 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
RABGGTA-207ENST00000558936 CHKAP35790 457 aa13.11□□□□□ -0.31
RABGGTA-207ENST00000558936 SCNN1AP37088 669 aa13.11□□□□□ -0.31
RABGGTA-207ENST00000558936 IL12RB1P42701 662 aa13.11□□□□□ -0.31
RABGGTA-207ENST00000558936 HARS2P49590 506 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
RABGGTA-207ENST00000558936 NRLP54845 237 aa13.11□□□□□ -0.31
RABGGTA-207ENST00000558936 UBASH3AP57075 661 aa13.11□□□□□ -0.31
RABGGTA-207ENST00000558936 ZNF445P59923 1031 aa13.11□□□□□ -0.31
RABGGTA-207ENST00000558936 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
RABGGTA-207ENST00000558936 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
RABGGTA-207ENST00000558936 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa13.11□□□□□ -0.31
RABGGTA-207ENST00000558936 LMAN2Q12907 356 aa13.11□□□□□ -0.31
RABGGTA-207ENST00000558936 PPP2R5DQ14738 602 aa13.11□□□□□ -0.31
RABGGTA-207ENST00000558936 FUT11Q495W5 492 aa13.11□□□□□ -0.31
RABGGTA-207ENST00000558936 C5orf22Q49AR2 442 aa13.11□□□□□ -0.31
RABGGTA-207ENST00000558936 FIGNQ5HY92 759 aa13.11□□□□□ -0.31
RABGGTA-207ENST00000558936 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
RABGGTA-207ENST00000558936 FBXL22Q6P050 247 aa13.11□□□□□ -0.31
RABGGTA-207ENST00000558936 WDR59Q6PJI9 974 aa13.11□□□□□ -0.31
RABGGTA-207ENST00000558936 WDR5BQ86VZ2 330 aa13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42 ms