RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558534.5

RABGGTA-205, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTA, Length 753 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-205ENST00000558534 MMP17Q9ULZ9 603 aa16.38■□□□□ 0.21
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RABGGTA-205ENST00000558534 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
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RABGGTA-205ENST00000558534 CHSY1Q86X52 802 aa16.37■□□□□ 0.21
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RABGGTA-205ENST00000558534 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
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RABGGTA-205ENST00000558534 SATB1Q01826 763 aa16.36■□□□□ 0.21
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RABGGTA-205ENST00000558534 C2orf27AQ580R0 203 aa16.36■□□□□ 0.21
RABGGTA-205ENST00000558534 MS4A13Q5J8X5 152 aa16.36■□□□□ 0.21
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RABGGTA-205ENST00000558534 MFN1Q8IWA4 741 aa16.36■□□□□ 0.21
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RABGGTA-205ENST00000558534 COX16Q9P0S2 106 aa16.36■□□□□ 0.21
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RABGGTA-205ENST00000558534 MCOLN2Q8IZK6 566 aa16.34■□□□□ 0.21
RABGGTA-205ENST00000558534 LGI2Q8N0V4 545 aa16.34■□□□□ 0.21
RABGGTA-205ENST00000558534 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP16.34■□□□□ 0.21
RABGGTA-205ENST00000558534 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
RABGGTA-205ENST00000558534 FIBINQ8TAL6 211 aa16.34■□□□□ 0.21
RABGGTA-205ENST00000558534 C1orf74Q96LT6 269 aa16.34■□□□□ 0.21
RABGGTA-205ENST00000558534 HAPLN3Q96S86 360 aa16.34■□□□□ 0.21
RABGGTA-205ENST00000558534 PCDHB18PQ96TA0 734 aa16.34■□□□□ 0.21
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