RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557685.5

EFCAB11-213, Transcript of EF-hand calcium binding domain 11, human

TSL 3

Gene EFCAB11, Length 698 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFCAB11-213	ENST00000557685	PIGS	Q96S52	555 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	NPAS1	Q99742	590 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	EIF2AK1	Q9BQI3	630 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	SCAND2P	Q9GZW5	306 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	ALG13	Q9NP73	1137 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	WASH6P	Q9NQA3	447 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	GGA3	Q9NZ52	723 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	SLC17A6	Q9P2U8	582 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	VPS4A	Q9UN37	437 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	CRYL1	Q9Y2S2	319 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	RRP7A	Q9Y3A4	280 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	HS3ST3A1	Q9Y663	406 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	CYP3A7-CYP3A51P	A0A087WV96	503 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	SAC3D1	A6NKF1	404 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	C3orf70	A6NLC5	250 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	EXOC3	O60645	756 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	JTB	O76095	146 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	CNP	P09543	421 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	WT1	P19544	449 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	CYP3A7	P24462	503 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	CXCR5	P32302	372 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	DDIT3	P35638	169 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	PCP4	P48539	62 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	CYP4F2	P78329	520 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	CHRND	Q07001	517 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	ANKRD1	Q15327	319 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	MAP3K21	Q5TCX8	1036 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	NAPRT	Q6XQN6	538 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	KYAT3	Q6YP21	454 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	BBS12	Q6ZW61	710 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	PTGR2	Q8N8N7	351 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	NAXE	Q8NCW5	288 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	SRFBP1	Q8NEF9	429 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	CEP70	Q8NHQ1	597 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	KTI12	Q96EK9	354 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	DAZAP1	Q96EP5	407 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	PPM1M	Q96MI6	270 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	TWNK	Q96RR1	684 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	MMS19	Q96T76	1030 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	ELOVL1	Q9BW60	279 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	MRI	Q9BWK5	157 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	ADGRE3	Q9BY15	652 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	RNF26	Q9BY78	433 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685		A0A087X1B8	175 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	BTBD19	C9JJ37	291 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685		H7C1Q1	480 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	EYA2	O00167	538 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	CLIC1	O00299	241 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	FYB1	O15117	783 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	HEXIM1	O94992	359 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	HNRNPC	P07910	306 aa	Known RBP eCLIP	4.88	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	ATF7	P17544	494 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	XBP1	P17861	261 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	SFPQ	P23246	707 aa	Known RBP eCLIP	4.88	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	RCAN1	P53805	252 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	VAMP2	P63027	116 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	RNASEL	Q05823	741 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	PDCL	Q13371	301 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	CNGA3	Q16281	694 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	TSTD2	Q5T7W7	516 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	TMEM88	Q6PEY1	159 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	TRIM72	Q6ZMU5	477 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	TMTC1	Q8IUR5	882 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	LAS2	Q8IYD9	372 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685		Q8N1X5	172 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	MAFA	Q8NHW3	353 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	ADAMTS18	Q8TE60	1221 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	AKAP1	Q92667	903 aa	Known RBP eCLIP	4.88	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	CCDC17	Q96LX7	622 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	HS6ST2	Q96MM7	605 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	UROC1	Q96N76	676 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	FYTTD1	Q96QD9	318 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	MACROD1	Q9BQ69	325 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	PLEKHA2	Q9HB19	425 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	TMEM160	Q9NX00	188 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	ASIC5	Q9NY37	505 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	DNAJC16	Q9Y2G8	782 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	TCRBV5S1A1T	A0A578	114 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	AGAP5	A6NIR3	686 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	TISP43	B9A030	160 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	PRRT4	C9JH25	899 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	STX16-NPEPL1	H3BU86	382 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	STX16	O14662	325 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	MGST3	O14880	152 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	TSPAN3	O60637	253 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	RAMP2	O60895	175 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	ALDOA	P04075	364 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	SLC3A2	P08195	630 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	CHN1	P15882	459 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	IGFBP2	P18065	325 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	SLC8A1	P32418	973 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	HOXD12	P35452	270 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	AGTR2	P50052	363 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	CCR5	P51681	352 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	TAS2R50	P59544	299 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	WDR5	P61964	334 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	MAPK7	Q13164	816 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	TRPC3	Q13507	836 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	MFSD13A	Q14CX5	517 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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