RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553570.5

ATXN3-222, Transcript of ataxin 3, human

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 757 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-222	ENST00000553570	ANK1	P16157	1881 aa		5.17	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	HSFX4	A0A1B0GTS1	333 aa	Predicted RBP	5.17	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	HSFX3	A0A1B0GWH4	333 aa	Predicted RBP	5.17	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	TMEM150B	A6NC51	233 aa		5.17	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	CCDC154	A6NI56	674 aa		5.17	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	DKC1	O60832	514 aa	Known RBP eCLIP	5.17	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	PSMD10	O75832	226 aa		5.17	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	FSBP	O95073	299 aa		5.17	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	VTN	P04004	478 aa		5.17	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	GAA	P10253	952 aa		5.17	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	CR2	P20023	1033 aa		5.17	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	CTSS	P25774	331 aa		5.17	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	TMOD1	P28289	359 aa		5.17	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	CCT6A	P40227	531 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	QARS	P47897	775 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	MRE11	P49959	708 aa		5.17	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	RABGGTB	P53611	331 aa		5.17	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	RAC3	P60763	192 aa		5.17	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	PSMC5	P62195	406 aa		5.17	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	PUM1	Q14671	1186 aa	Known RBP eCLIP	5.17	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	MAN2A1	Q16706	1144 aa		5.17	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	UGCG	Q16739	394 aa		5.17	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	C3orf36	Q3SXR2	165 aa		5.17	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	PPP4R3A	Q6IN85	833 aa		5.17	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	MOXD1	Q6UVY6	613 aa		5.17	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	SERINC5	Q86VE9	423 aa		5.17	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	FUK	Q8N0W3	1084 aa		5.17	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	LRRC71	Q8N4P6	559 aa		5.17	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	PIK3C3	Q8NEB9	887 aa		5.17	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	RASSF8	Q8NHQ8	419 aa		5.17	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	ERMN	Q8TAM6	284 aa		5.17	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	CAGE1	Q8TC20	777 aa		5.17	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	AFAP1L1	Q8TED9	768 aa		5.17	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	ATP8B4	Q8TF62	1192 aa		5.17	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	RIN2	Q8WYP3	895 aa	Predicted RBP	5.17	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	HAS1	Q92839	578 aa		5.17	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	LENG9	Q96B70	501 aa		5.17	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	BORCS6	Q96GS4	357 aa		5.17	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	FAM167A	Q96KS9	214 aa		5.17	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	CEP170P1	Q96L14	293 aa		5.17	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	PLIN2	Q99541	437 aa		5.17	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	DPYSL5	Q9BPU6	564 aa		5.17	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	EIF2AK1	Q9BQI3	630 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	ADI1	Q9BV57	179 aa		5.17	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	TMEM60	Q9H2L4	133 aa		5.17	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	VWA7	Q9Y334	891 aa		5.17	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	NR2E1	Q9Y466	385 aa		5.17	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	KIAA1671	Q9BY89	1806 aa		5.17	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	TTC3	P53804	2025 aa		5.17	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	EMSY	Q7Z589	1322 aa		5.17	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	VWA3A	A6NCI4	1184 aa		5.16	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	TBX3	O15119	743 aa		5.16	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	MAGEB2	O15479	319 aa		5.16	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	CHRNA1	P02708	482 aa		5.16	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	OR52Z1	P0C646	297 aa		5.16	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	GHR	P10912	638 aa		5.16	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	SYT1	P21579	422 aa		5.16	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	U2AF2	P26368	475 aa	Known RBP eCLIP	5.16	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	RFC2	P35250	354 aa		5.16	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	SELENOP	P49908	381 aa		5.16	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	SLC26A2	P50443	739 aa		5.16	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	CLCN3	P51790	818 aa		5.16	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	POLG	P54098	1239 aa	Predicted RBP	5.16	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	NPEPPS	P55786	919 aa		5.16	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	NLRP11	P59045	1033 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	MRPS6	P82932	125 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	PRKCE	Q02156	737 aa		5.16	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	MGAT2	Q10469	447 aa		5.16	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	ADAM15	Q13444	863 aa		5.16	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	BECN1	Q14457	450 aa		5.16	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	GBX1	Q14549	363 aa		5.16	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	DHX8	Q14562	1220 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	GRM3	Q14832	879 aa		5.16	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	NOMO1	Q15155	1222 aa		5.16	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	MAP9	Q49MG5	647 aa		5.16	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	ARHGAP29	Q52LW3	1261 aa		5.16	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	XKR3	Q5GH77	459 aa		5.16	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	MARCH8	Q5T0T0	291 aa		5.16	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	PLA2G4F	Q68DD2	849 aa		5.16	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	FAM173B	Q6P4H8	233 aa		5.16	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	PSRC1	Q6PGN9	363 aa	Predicted RBP	5.16	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	KLHDC10	Q6PID8	442 aa		5.16	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	TMCO2	Q7Z6W1	182 aa	Predicted RBP	5.16	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	CLEC14A	Q86T13	490 aa		5.16	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	SESTD1	Q86VW0	696 aa		5.16	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	RHPN2	Q8IUC4	686 aa		5.16	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	GRAMD1C	Q8IYS0	662 aa		5.16	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	GPR135	Q8IZ08	494 aa		5.16	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	NME8	Q8N427	588 aa		5.16	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	GPR156	Q8NFN8	814 aa		5.16	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	DBF4B	Q8NFT6	615 aa		5.16	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	ETNPPL	Q8TBG4	499 aa		5.16	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	PIGO	Q8TEQ8	1089 aa		5.16	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	SEPT8	Q92599	483 aa		5.16	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	HOXB13	Q92826	284 aa	Predicted RBP	5.16	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	TMEM143	Q96AN5	459 aa		5.16	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	TIFA	Q96CG3	184 aa		5.16	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	MVB12A	Q96EY5	273 aa		5.16	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	CDK5RAP3	Q96JB5	506 aa		5.16	□□□□□ -1.58
ATXN3-222	ENST00000553570	MAP7D2	Q96T17	732 aa		5.16	□□□□□ -1.58

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