RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552548.5

PFDN5-217, Transcript of prefoldin subunit 5, humanhuman

TSL 2

Gene PFDN5, Length 497 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN5-217ENST00000552548 CD72P21854 359 aa7.33□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 WEE1P30291 646 aa7.33□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 SCNN1AP37088 669 aa7.33□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 GNG11P61952 73 aa7.33□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 ITIH3Q06033 890 aa7.33□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 SEMA3BQ13214 749 aa7.33□□□□□ -1.24
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PFDN5-217ENST00000552548 MEI1Q5TIA1 1274 aa7.33□□□□□ -1.24
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PFDN5-217ENST00000552548 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa7.33□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 RHOT2Q8IXI1 618 aa7.33□□□□□ -1.24
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PFDN5-217ENST00000552548 PPP2R3CQ969Q6 453 aa7.33□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 MTG2Q9H4K7 406 aa7.33□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 WDCPQ9H6R7 721 aa7.33□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 KCNK12Q9HB15 430 aa7.33□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 PCDH18Q9HCL0 1135 aa7.33□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP7.33□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 TDP1Q9NUW8 608 aa7.33□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 UVRAGQ9P2Y5 699 aa7.33□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
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PFDN5-217ENST00000552548 IP6K2Q9UHH9 426 aa7.33□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa7.33□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 AP4E1Q9UPM8 1137 aa7.33□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 C5orf42Q9H799 3197 aa7.33□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 DENND4CQ5VZ89 1909 aa7.33□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 LRRD1A4D1F6 860 aa7.32□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 ANHXE9PGG2 379 aa7.32□□□□□ -1.24
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PFDN5-217ENST00000552548 CYP17A1P05093 508 aa7.32□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
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PFDN5-217ENST00000552548 C10orf76Q5T2E6 689 aa7.32□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 EMC10Q5UCC4 262 aa7.32□□□□□ -1.24
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PFDN5-217ENST00000552548 ZNF662Q6ZS27 426 aa7.32□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 CHSY1Q86X52 802 aa7.32□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 NIPA2Q8N8Q9 360 aa7.32□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 PDZD8Q8NEN9 1154 aa7.32□□□□□ -1.24
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PFDN5-217ENST00000552548 PCDH19Q8TAB3 1148 aa7.32□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 SORCS1Q8WY21 1168 aa7.32□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 TSC1Q92574 1164 aa7.32□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 GOLGA1Q92805 767 aa7.32□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 TRIM11Q96F44 468 aa7.32□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 HES6Q96HZ4 224 aa7.32□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 NSMCE3Q96MG7 304 aa7.32□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 RIPOR3Q96MK2 946 aa7.32□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 GCNAQ96QF7 691 aa7.32□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 HINFPQ9BQA5 517 aa7.32□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 FAM83CQ9BQN1 747 aa7.32□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 C2orf42Q9NWW7 574 aa7.32□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 DNAI1Q9UI46 699 aa7.32□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 TLR6Q9Y2C9 796 aa7.32□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 SCINQ9Y6U3 715 aa7.32□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 A0A0D9SEW6 157 aa7.31□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 LOC730098B7Z3J9 87 aa7.31□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 E9PAM4 449 aa7.31□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 F5H423 210 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 ZNF197O14709 1029 aa7.31□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 SART1O43290 800 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 KRT86O43790 486 aa7.31□□□□□ -1.24
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