RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550655.5

CS-219, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 589 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-219ENST00000550655 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP18.42■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP18.42■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa18.42■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP18.41■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 SNX16P57768 344 aa18.41■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 ENPP2Q13822 863 aa18.41■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP18.41■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 PLK5Q496M5 336 aa18.41■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP18.41■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 MPP7Q5T2T1 576 aa18.41■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP18.41■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 KIAA1211LQ6NV74 962 aa18.41■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP18.41■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 ZNF677Q86XU0 584 aa18.41■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa18.41■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP18.41■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 HMGB4Q8WW32 186 aa18.41■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP18.41■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP18.41■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 PDCL3Q9H2J4 239 aa18.41■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 SYNCQ9H7C4 482 aa18.41■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 FAM204AQ9H8W3 233 aa18.41■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 SPTBN4Q9H254 2564 aa18.4■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 ABCA7Q8IZY2 2146 aa18.4■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 FAM170AA1A519 330 aa18.4■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 TBL1XO60907 577 aa18.4■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 EPN2O95208 641 aa18.4■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 APOEP02649 317 aa18.4■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 CHRNB2P17787 502 aa18.4■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 GABRG2P18507 467 aa18.4■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 IL12RB1P42701 662 aa18.4■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 CDK17Q00537 523 aa18.4■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 FMO1Q01740 532 aa18.4■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 CDR2Q01850 454 aa18.4■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 MS4A13Q5J8X5 152 aa18.4■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 XYLT1Q86Y38 959 aa18.4■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP18.4■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 NEK11Q8NG66 645 aa18.4■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 SPAG5Q96R06 1193 aa18.4■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 ADAM33Q9BZ11 813 aa18.4■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 ABCB8Q9NUT2 735 aa18.4■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 DDIT4Q9NX09 232 aa18.4■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 ELOVL2Q9NXB9 296 aa18.4■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa18.4■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP18.4■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 INVSQ9Y283 1065 aa18.4■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 RAD54BQ9Y620 910 aa18.4■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 STON1Q9Y6Q2 735 aa18.4■□□□□ 0.54
CS-219ENST00000550655 SYCE3A1L190 88 aa18.39■□□□□ 0.53
CS-219ENST00000550655 KCNU1A8MYU2 1149 aa18.39■□□□□ 0.53
CS-219ENST00000550655 WASH3PC4AMC7 463 aa18.39■□□□□ 0.53
CS-219ENST00000550655 LRP3O75074 770 aa18.39■□□□□ 0.53
CS-219ENST00000550655 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP18.39■□□□□ 0.53
CS-219ENST00000550655 BCKDHBP21953 392 aa18.39■□□□□ 0.53
CS-219ENST00000550655 NOS2P35228 1153 aa18.39■□□□□ 0.53
CS-219ENST00000550655 SCNN1AP37088 669 aa18.39■□□□□ 0.53
CS-219ENST00000550655 P2RY2P41231 377 aa18.39■□□□□ 0.53
CS-219ENST00000550655 STAT1P42224 750 aa18.39■□□□□ 0.53
CS-219ENST00000550655 ZNF165P49910 485 aa18.39■□□□□ 0.53
CS-219ENST00000550655 RPS24P62847 133 aaKnown RBP18.39■□□□□ 0.53
CS-219ENST00000550655 SPEM2Q0P670 501 aa18.39■□□□□ 0.53
CS-219ENST00000550655 IQCB1Q15051 598 aa18.39■□□□□ 0.53
CS-219ENST00000550655 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP18.39■□□□□ 0.53
CS-219ENST00000550655 C2CD6Q53TS8 623 aa18.39■□□□□ 0.53
CS-219ENST00000550655 NAA35Q5VZE5 725 aa18.39■□□□□ 0.53
CS-219ENST00000550655 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa18.39■□□□□ 0.53
CS-219ENST00000550655 SORCS1Q8WY21 1168 aa18.39■□□□□ 0.53
CS-219ENST00000550655 C18orf8Q96DM3 657 aa18.39■□□□□ 0.53
CS-219ENST00000550655 LOXL4Q96JB6 756 aa18.39■□□□□ 0.53
CS-219ENST00000550655 LMLNQ96KR4 655 aa18.39■□□□□ 0.53
CS-219ENST00000550655 BTN2A3PQ96KV6 586 aa18.39■□□□□ 0.53
CS-219ENST00000550655 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP18.39■□□□□ 0.53
CS-219ENST00000550655 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP18.39■□□□□ 0.53
CS-219ENST00000550655 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP18.39■□□□□ 0.53
CS-219ENST00000550655 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP18.39■□□□□ 0.53
CS-219ENST00000550655 GGA2Q9UJY4 613 aa18.39■□□□□ 0.53
CS-219ENST00000550655 DCHS1Q96JQ0 3298 aa18.39■□□□□ 0.53
CS-219ENST00000550655 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa18.38■□□□□ 0.53
CS-219ENST00000550655 SMTNL1A8MU46 457 aa18.38■□□□□ 0.53
CS-219ENST00000550655 NPC1O15118 1278 aa18.38■□□□□ 0.53
CS-219ENST00000550655 TEX33O43247 280 aa18.38■□□□□ 0.53
CS-219ENST00000550655 NDUFV2P19404 249 aa18.38■□□□□ 0.53
CS-219ENST00000550655 CD70P32970 193 aa18.38■□□□□ 0.53
CS-219ENST00000550655 MATKP42679 507 aa18.38■□□□□ 0.53
CS-219ENST00000550655 ZNF234Q14588 700 aa18.38■□□□□ 0.53
CS-219ENST00000550655 MAP7D1Q3KQU3 841 aa18.38■□□□□ 0.53
CS-219ENST00000550655 RAP1GAP2Q684P5 730 aa18.38■□□□□ 0.53
CS-219ENST00000550655 SDE2Q6IQ49 451 aa18.38■□□□□ 0.53
CS-219ENST00000550655 ADIPOR2Q86V24 386 aa18.38■□□□□ 0.53
CS-219ENST00000550655 CHSY1Q86X52 802 aa18.38■□□□□ 0.53
CS-219ENST00000550655 ERICH1Q86X53 443 aa18.38■□□□□ 0.53
CS-219ENST00000550655 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP18.38■□□□□ 0.53
CS-219ENST00000550655 UCMAQ8WVF2 138 aa18.38■□□□□ 0.53
CS-219ENST00000550655 RLN3Q8WXF3 142 aa18.38■□□□□ 0.53
CS-219ENST00000550655 CPA5Q8WXQ8 436 aa18.38■□□□□ 0.53
CS-219ENST00000550655 ERLEC1Q96DZ1 483 aa18.38■□□□□ 0.53
CS-219ENST00000550655 NPY6RQ99463 290 aa18.38■□□□□ 0.53
CS-219ENST00000550655 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP18.38■□□□□ 0.53
CS-219ENST00000550655 CIPCQ9C0C6 399 aa18.38■□□□□ 0.53
CS-219ENST00000550655 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 448 ms