RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547449.1

CS-209, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 434 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-209ENST00000547449 GMIPQ9P107 970 aa10.09□□□□□ -0.79
CS-209ENST00000547449 STK39Q9UEW8 545 aa10.09□□□□□ -0.79
CS-209ENST00000547449 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
CS-209ENST00000547449 TLR6Q9Y2C9 796 aa10.09□□□□□ -0.79
CS-209ENST00000547449 TSC2P49815 1807 aa10.09□□□□□ -0.79
CS-209ENST00000547449 WDR27A2RRH5 827 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-209ENST00000547449 GOLGA6CA6NDK9 693 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-209ENST00000547449 SLC38A8A6NNN8 435 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-209ENST00000547449 E7ESA3 106 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-209ENST00000547449 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
CS-209ENST00000547449 ADAM12O43184 909 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-209ENST00000547449 PAGE1O75459 146 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-209ENST00000547449 LRIG2O94898 1065 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-209ENST00000547449 SHBGP04278 402 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-209ENST00000547449 GOLGA6DP0CG33 693 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-209ENST00000547449 ACRP10323 421 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-209ENST00000547449 TSHRP16473 764 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-209ENST00000547449 HOXC13P31276 330 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-209ENST00000547449 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
CS-209ENST00000547449 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
CS-209ENST00000547449 ARL4CP56559 192 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-209ENST00000547449 TAF10Q12962 218 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-209ENST00000547449 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP10.08□□□□□ -0.81e-7■■□□□ 12.1
CS-209ENST00000547449 RAB33AQ14088 237 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-209ENST00000547449 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
CS-209ENST00000547449 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
CS-209ENST00000547449 RASIP1Q5U651 963 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-209ENST00000547449 SNX30Q5VWJ9 437 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-209ENST00000547449 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-209ENST00000547449 C16orf59Q7L2K0 433 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-209ENST00000547449 TTC9BQ8N6N2 239 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-209ENST00000547449 MCUQ8NE86 351 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-209ENST00000547449 FAM76AQ8TAV0 307 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-209ENST00000547449 HTR3CQ8WXA8 447 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-209ENST00000547449 OVCA2Q8WZ82 227 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-209ENST00000547449 EXOC4Q96A65 974 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-209ENST00000547449 ZBTB9Q96C00 473 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-209ENST00000547449 PGM2Q96G03 612 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-209ENST00000547449 PWWP2AQ96N64 755 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-209ENST00000547449 TTC25Q96NG3 672 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-209ENST00000547449 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
CS-209ENST00000547449 FERMT1Q9BQL6 677 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-209ENST00000547449 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
CS-209ENST00000547449 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-209ENST00000547449 PSD3Q9NYI0 1048 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-209ENST00000547449 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-209ENST00000547449 ADAM21Q9UKJ8 722 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-209ENST00000547449 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-209ENST00000547449 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
CS-209ENST00000547449 A0A0A0MRY4 1105 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-209ENST00000547449 WASH4PA8MWX3 477 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-209ENST00000547449 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
CS-209ENST00000547449 MTSS1O43312 755 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-209ENST00000547449 MFSD11O43934 449 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-209ENST00000547449 LILRB3O75022 631 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-209ENST00000547449 STK10O94804 968 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
CS-209ENST00000547449 FGBP02675 491 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-209ENST00000547449 MX2P20592 715 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-209ENST00000547449 EPHB2P29323 1055 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-209ENST00000547449 SERPINB6P35237 376 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-209ENST00000547449 PPM1AP35813 382 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-209ENST00000547449 FDFT1P37268 417 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-209ENST00000547449 TBX4P57082 545 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-209ENST00000547449 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
CS-209ENST00000547449 ZNF33AQ06730 810 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-209ENST00000547449 KCNJ11Q14654 390 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-209ENST00000547449 STAT4Q14765 748 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-209ENST00000547449 TERF2Q15554 542 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-209ENST00000547449 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
CS-209ENST00000547449 KRT71Q3SY84 523 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-209ENST00000547449 ARTNQ5T4W7 220 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-209ENST00000547449 MANEALQ5VSG8 457 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-209ENST00000547449 ANKRD22Q5VYY1 191 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-209ENST00000547449 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
CS-209ENST00000547449 FAM117BQ6P1L5 589 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-209ENST00000547449 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-209ENST00000547449 PDIK1LQ8N165 341 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-209ENST00000547449 LZTR1Q8N653 840 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-209ENST00000547449 PDZD8Q8NEN9 1154 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-209ENST00000547449 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
CS-209ENST00000547449 MYRFLQ96LU7 910 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-209ENST00000547449 SPATA13Q96N96 652 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-209ENST00000547449 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
CS-209ENST00000547449 CCDC77Q9BR77 488 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-209ENST00000547449 KLC2Q9H0B6 622 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-209ENST00000547449 PRDM12Q9H4Q4 367 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-209ENST00000547449 ETNK1Q9HBU6 452 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-209ENST00000547449 RXFP1Q9HBX9 757 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-209ENST00000547449 SAYSD1Q9NPB0 183 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-209ENST00000547449 RAB6BQ9NRW1 208 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-209ENST00000547449 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP10.07□□□□□ -0.8
CS-209ENST00000547449 FNIP2Q9P278 1114 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-209ENST00000547449 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-209ENST00000547449 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
CS-209ENST00000547449 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-209ENST00000547449 TANC1Q9C0D5 1861 aa10.06□□□□□ -0.8
CS-209ENST00000547449 TET1Q8NFU7 2136 aa10.06□□□□□ -0.8
CS-209ENST00000547449 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
CS-209ENST00000547449 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa10.06□□□□□ -0.8
CS-209ENST00000547449 A6NNZ2 444 aa10.06□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 155 ms