RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546160.5

PDE4D-226, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 7,690 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-226ENST00000546160 INTS13Q9NVM9 706 aa6.56□□□□□ -1.36
PDE4D-226ENST00000546160 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-226ENST00000546160 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-226ENST00000546160 CBX4O00257 560 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-226ENST00000546160 SGTAO43765 313 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-226ENST00000546160 DDNO94850 711 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-226ENST00000546160 POMCP01189 267 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-226ENST00000546160 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-226ENST00000546160 CDK7P50613 346 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-226ENST00000546160 C1DQ13901 141 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-226ENST00000546160 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-226ENST00000546160 ICE2Q659A1 982 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-226ENST00000546160 BRSK2Q8IWQ3 736 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-226ENST00000546160 ARMC2Q8NEN0 867 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-226ENST00000546160 VPS33AQ96AX1 596 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-226ENST00000546160 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-226ENST00000546160 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-226ENST00000546160 ZSCAN32Q9NX65 697 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-226ENST00000546160 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-226ENST00000546160 TRIM49D1C9J1S8 452 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-226ENST00000546160 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-226ENST00000546160 CYP3A7P24462 503 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-226ENST00000546160 RPL3P39023 403 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-226ENST00000546160 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-226ENST00000546160 VSNL1P62760 191 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-226ENST00000546160 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-226ENST00000546160 GUCY1A3Q02108 690 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-226ENST00000546160 PDPK2PQ6A1A2 396 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-226ENST00000546160 IYDQ6PHW0 289 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-226ENST00000546160 CYP20A1Q6UW02 462 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-226ENST00000546160 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-226ENST00000546160 PALB2Q86YC2 1186 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-226ENST00000546160 MED8Q96G25 268 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-226ENST00000546160 TINF2Q9BSI4 451 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-226ENST00000546160 ATXN3LQ9H3M9 355 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-226ENST00000546160 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-226ENST00000546160 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-226ENST00000546160 HPSEQ9Y251 543 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-226ENST00000546160 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-226ENST00000546160 ATRNO75882 1429 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-226ENST00000546160 CXCR2P25025 360 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-226ENST00000546160 PCYT1AP49585 367 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-226ENST00000546160 TUBP50607 506 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-226ENST00000546160 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-226ENST00000546160 MGAT5Q09328 741 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-226ENST00000546160 ARMC12Q5T9G4 340 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-226ENST00000546160 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-226ENST00000546160 CDCA5Q96FF9 252 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-226ENST00000546160 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-226ENST00000546160 ELOVL6Q9H5J4 265 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-226ENST00000546160 POPDC2Q9HBU9 364 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-226ENST00000546160 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-226ENST00000546160 ZNF232Q9UNY5 417 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-226ENST00000546160 URADA6NGE7 173 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-226ENST00000546160 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-226ENST00000546160 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-226ENST00000546160 CTSEP14091 401 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-226ENST00000546160 CHKAP35790 457 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-226ENST00000546160 CD151P48509 253 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-226ENST00000546160 CLK1P49759 484 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-226ENST00000546160 VGLL4Q14135 290 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-226ENST00000546160 SLC30A10Q6XR72 485 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-226ENST00000546160 LRRC39Q96DD0 335 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-226ENST00000546160 APBA2Q99767 749 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-226ENST00000546160 ASAH2Q9NR71 780 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-226ENST00000546160 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-226ENST00000546160 SYBUQ9NX95 663 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-226ENST00000546160 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-226ENST00000546160 GNPTGQ9UJJ9 305 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-226ENST00000546160 PSME2Q9UL46 239 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-226ENST00000546160 LACTBL1A8MY62 500 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-226ENST00000546160 ZBTB14O43829 449 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-226ENST00000546160 CNPP09543 421 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-226ENST00000546160 RAP1GAPP47736 663 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-226ENST00000546160 PKN1Q16512 942 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-226ENST00000546160 GALNTL6Q49A17 601 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-226ENST00000546160 CBWD3Q5JTY5 395 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-226ENST00000546160 CBWD5Q5RIA9 395 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-226ENST00000546160 C4orf33Q8N1A6 199 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-226ENST00000546160 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-226ENST00000546160 HEXDCQ8WVB3 486 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-226ENST00000546160 C19orf60Q96EN9 201 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-226ENST00000546160 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-226ENST00000546160 RNF208Q9H0X6 261 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-226ENST00000546160 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-226ENST00000546160 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-226ENST00000546160 CCT8L1PA6NM43 557 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-226ENST00000546160 FDPSP14324 419 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-226ENST00000546160 SLC6A3Q01959 620 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-226ENST00000546160 NT5DC1Q5TFE4 455 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-226ENST00000546160 SV2AQ7L0J3 742 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-226ENST00000546160 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-226ENST00000546160 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-226ENST00000546160 SUSD6Q92537 303 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-226ENST00000546160 THAP11Q96EK4 314 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-226ENST00000546160 TBL1YQ9BQ87 522 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-226ENST00000546160 FICDQ9BVA6 458 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-226ENST00000546160 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-226ENST00000546160 CATSPERZQ9NTU4 200 aa6.55□□□□□ -1.36
PDE4D-226ENST00000546160 ZNF229Q9UJW7 825 aa6.55□□□□□ -1.36
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