RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546080.5

SRP54-202, Transcript of signal recognition particle 54, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SRP54, Length 2,187 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP54-202ENST00000546080 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 IYDQ6PHW0 289 aa14.61□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 PACS1Q6VY07 963 aa14.61□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 RXFP2Q8WXD0 754 aa14.61□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 IRGQQ8WZA9 623 aa14.61□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 XYLT2Q9H1B5 865 aa14.61□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa14.61□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 COPG2Q9UBF2 871 aa14.61□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 RGS20O76081 388 aa14.6□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 TNNC2P02585 160 aa14.6□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 PDGFRAP16234 1089 aa14.6□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 MX2P20592 715 aa14.6□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 ADORA2AP29274 412 aa14.6□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 ARRB2P32121 409 aa14.6□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 HARS2P49590 506 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 ADARP55265 1226 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 CAPSQ13938 189 aa14.6□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 ZFP1Q6P2D0 407 aa14.6□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 SCYL2Q6P3W7 929 aa14.6□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 CASC4Q6P4E1 433 aa14.6□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 C16orf89Q6UX73 402 aa14.6□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 ZPBP2Q6X784 338 aa14.6□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 TMEM126BQ8IUX1 230 aa14.6□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 UNC5BQ8IZJ1 945 aa14.6□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 PQLC3Q8N755 202 aa14.6□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 CEP70Q8NHQ1 597 aa14.6□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 COG4Q9H9E3 785 aa14.6□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 MAN1C1Q9NR34 630 aa14.6□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 RNF146Q9NTX7 359 aa14.6□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 CDY2AQ9Y6F7 541 aa14.6□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 CDY1Q9Y6F8 540 aa14.6□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 DOCK5Q9H7D0 1870 aa14.6□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 AIM2O14862 343 aa14.6□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 HSPA13P48723 471 aa14.6□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 CDH8P55286 799 aa14.6□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 NIPAL4Q0D2K0 466 aa14.6□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 FLOT2Q14254 428 aa14.6□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 GK3PQ14409 553 aa14.6□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 ADCY4Q8NFM4 1077 aa14.6□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa14.6□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 MAML3Q96JK9 1138 aa14.6□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 CDHR1Q96JP9 859 aa14.6□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa14.6□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 RNPEPQ9H4A4 650 aa14.6□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 ZNF302Q9NR11 478 aa14.6□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 BCAP29Q9UHQ4 241 aa14.6□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa14.59□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 WDR27A2RRH5 827 aa14.59□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 OGTO15294 1046 aa14.59□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 KRT19P08727 400 aa14.59□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 IL4RP24394 825 aa14.59□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 GRIA1P42261 906 aa14.59□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 SERPINB8P50452 374 aa14.59□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 TMED1Q13445 227 aa14.59□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 APOFQ13790 326 aa14.59□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 INSCQ1MX18 579 aa14.59□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 SLC9A4Q6AI14 798 aa14.59□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 CYS1Q717R9 158 aa14.59□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 PCDH19Q8TAB3 1148 aa14.59□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 GAB3Q8WWW8 586 aa14.59□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 CLMNQ96JQ2 1002 aa14.59□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 CDH19Q9H159 772 aa14.59□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 PCDH18Q9HCL0 1135 aa14.59□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 TMEM216Q9P0N5 145 aa14.59□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 BTBD7Q9P203 1132 aa14.59□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 RIMS3Q9UJD0 308 aa14.59□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa14.59□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 C2CD4BA6NLJ0 364 aa14.58□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 PIK3R2O00459 728 aa14.58□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 HSPA4LO95757 839 aa14.58□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 PRKCGP05129 697 aa14.58□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 THRAP10827 490 aa14.58□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 CCDC130P13994 396 aa14.58□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 SERPINB5P36952 375 aa14.58□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 NR1H2P55055 460 aa14.58□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa14.58□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 ZNF667Q5HYK9 610 aa14.58□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 C6orf52Q5T4I8 152 aa14.58□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 STEAP4Q687X5 459 aa14.58□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 OR6B2Q6IFH4 312 aa14.58□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 TRNP1Q6NT89 227 aa14.58□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 BORAQ6PGQ7 559 aa14.58□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 EPGNQ6UW88 154 aa14.58□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa14.58□□□□□ -0.07
SRP54-202ENST00000546080 YDJCA8MPS7 323 aa14.58□□□□□ -0.08
SRP54-202ENST00000546080 GCATO75600 419 aa14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.2 ms