RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544244.5

PTPRO-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type O, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene PTPRO, Length 3,978 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRO-210ENST00000544244 GJA1P17302 382 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 DNAJB1P25685 340 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 ETFBP38117 255 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 TFDP3Q5H9I0 405 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 ANKRD54Q6NXT1 300 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 C8orf74Q6P047 294 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 C1orf228Q6PIY5 440 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 SCD5Q86SK9 330 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 E2F7Q96AV8 911 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 MYRFLQ96LU7 910 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 NMUR1Q9HB89 426 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 ZFP14Q9HCL3 533 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 OR12D3Q9UGF7 316 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 CD207Q9UJ71 328 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 SCN1AP35498 2009 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 GOLGA6CA6NDK9 693 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 GOLGA6BA6NDN3 693 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 E7EVH7 732 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 TNFRSF10BO14763 440 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 ACSL4O60488 711 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 PAGE1O75459 146 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 GOLGA6DP0CG33 693 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 KDELR1P24390 212 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 HTR7P34969 479 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 NNMTP40261 264 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 TAS2R40P59535 323 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 SNX1Q13596 522 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 CDH18Q13634 790 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 RAP1GAP2Q684P5 730 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 MSANTD2Q6P1R3 559 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 VN1R2Q8NFZ6 395 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 NTAN1Q96AB6 310 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 ASIC3Q9UHC3 531 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 NENFQ9UMX5 172 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 ARHGAP42A6NI28 874 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 COCHO43405 550 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 TSPAN3O60637 253 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 RPL34P49207 117 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 CXCR3P49682 368 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 ITKQ08881 620 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 CALCOCO2Q13137 446 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 NNTQ13423 1086 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP5.86□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 PDK1Q15118 436 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 ANO4Q32M45 955 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 LZTR1Q8N653 840 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 SH3RF2Q8TEC5 729 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 HAPLN3Q96S86 360 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 TLR10Q9BXR5 811 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 AP1M1Q9BXS5 423 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 CRISPLD1Q9H336 500 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 SP110Q9HB58 689 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 TDP1Q9NUW8 608 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 SALL4Q9UJQ4 1053 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 SOBPA7XYQ1 873 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 KCNU1A8MYU2 1149 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 SGK1O00141 431 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 DFFAO00273 331 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 ERLIN1O75477 346 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 RHOCP08134 193 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 RING1Q06587 406 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 PRPSAP1Q14558 356 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 E2F5Q15329 346 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 ARSIQ5FYB1 569 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 KLHDC10Q6PID8 442 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 CARNMT1Q8N4J0 409 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 LRRC57Q8N9N7 239 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 HES6Q96HZ4 224 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 RAB17Q9H0T7 212 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 MUC3BQ9H195 1237 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 GKN1Q9NS71 199 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 MAP10Q9P2G4 905 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 VANGL2Q9ULK5 521 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 TTLL3Q9Y4R7 772 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 TANC1Q9C0D5 1861 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 MICAL3Q7RTP6 2002 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 CES2O00748 559 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 MTSS1O43312 755 aa5.85□□□□□ -1.47
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