RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531440.5

RNF170-208, Transcript of ring finger protein 170, human

TSL 4

Gene RNF170, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNF170-208	ENST00000531440	LRRC27	Q9C0I9	530 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RNF170-208	ENST00000531440	GZF1	Q9H116	711 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
RNF170-208	ENST00000531440	ERVMER34-1	Q9H9K5	563 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RNF170-208	ENST00000531440	PRSS16	Q9NQE7	514 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RNF170-208	ENST00000531440	FAM49B	Q9NUQ9	324 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RNF170-208	ENST00000531440	CGN	Q9P2M7	1197 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
RNF170-208	ENST00000531440	SUN2	Q9UH99	717 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RNF170-208	ENST00000531440	ADAMTS1	Q9UHI8	967 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RNF170-208	ENST00000531440	RASAL2	Q9UJF2	1139 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RNF170-208	ENST00000531440	FBXO2	Q9UK22	296 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
RNF170-208	ENST00000531440	STRIP2	Q9ULQ0	834 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RNF170-208	ENST00000531440	CLEC4E	Q9ULY5	219 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RNF170-208	ENST00000531440	UBR5	O95071	2799 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
RNF170-208	ENST00000531440	LRRC72	A6NJI9	287 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RNF170-208	ENST00000531440	TGFB1I1	O43294	461 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RNF170-208	ENST00000531440	ACP1	P24666	158 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RNF170-208	ENST00000531440	ADORA2B	P29275	332 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RNF170-208	ENST00000531440	HLA-F	P30511	346 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RNF170-208	ENST00000531440	RXRG	P48443	463 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RNF170-208	ENST00000531440	NDST1	P52848	882 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RNF170-208	ENST00000531440	EFEMP1	Q12805	493 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RNF170-208	ENST00000531440	MPPE1	Q53F39	396 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RNF170-208	ENST00000531440	SLC45A4	Q5BKX6	768 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RNF170-208	ENST00000531440	PRAMEF14	Q5SWL7	426 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RNF170-208	ENST00000531440	EPM2AIP1	Q7L775	607 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
RNF170-208	ENST00000531440	SCD5	Q86SK9	330 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RNF170-208	ENST00000531440	AHI1	Q8N157	1196 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RNF170-208	ENST00000531440	DDX51	Q8N8A6	666 aa	Known RBP eCLIP	13.58	□□□□□ -0.24
RNF170-208	ENST00000531440	C12orf29	Q8N999	325 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RNF170-208	ENST00000531440	JAKMIP2	Q96AA8	810 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RNF170-208	ENST00000531440	PLD4	Q96BZ4	506 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RNF170-208	ENST00000531440	MED8	Q96G25	268 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RNF170-208	ENST00000531440	HIC2	Q96JB3	615 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RNF170-208	ENST00000531440	ARID3A	Q99856	593 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RNF170-208	ENST00000531440	SDCBP2	Q9H190	292 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RNF170-208	ENST00000531440	RSPH9	Q9H1X1	276 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
RNF170-208	ENST00000531440	PABPC3	Q9H361	631 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
RNF170-208	ENST00000531440	AASDHPPT	Q9NRN7	309 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RNF170-208	ENST00000531440	TDRD6	O60522	2096 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RNF170-208	ENST00000531440	DOCK9	Q9BZ29	2069 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RNF170-208	ENST00000531440	DXO	O77932	396 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RNF170-208	ENST00000531440	WNT1	P04628	370 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RNF170-208	ENST00000531440	ATP5B	P06576	529 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RNF170-208	ENST00000531440	DLD	P09622	509 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RNF170-208	ENST00000531440	HOXD9	P28356	352 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RNF170-208	ENST00000531440	GALC	P54803	685 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RNF170-208	ENST00000531440	INSM1	Q01101	510 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RNF170-208	ENST00000531440	SGSM1	Q2NKQ1	1148 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RNF170-208	ENST00000531440	ARHGAP40	Q5TG30	622 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RNF170-208	ENST00000531440	CHST9	Q7L1S5	443 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RNF170-208	ENST00000531440	DHX40	Q8IX18	779 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RNF170-208	ENST00000531440	C12orf56	Q8IXR9	622 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RNF170-208	ENST00000531440	ARHGAP18	Q8N392	663 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RNF170-208	ENST00000531440	ZNF366	Q8N895	744 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RNF170-208	ENST00000531440	OR2T34	Q8NGX1	318 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RNF170-208	ENST00000531440	CYB5D2	Q8WUJ1	264 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RNF170-208	ENST00000531440	TTC9	Q92623	222 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RNF170-208	ENST00000531440	TAF4B	Q92750	862 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RNF170-208	ENST00000531440	CYFIP2	Q96F07	1278 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RNF170-208	ENST00000531440	DPH1	Q9BZG8	443 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RNF170-208	ENST00000531440	SEMA4C	Q9C0C4	833 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RNF170-208	ENST00000531440	DNAI2	Q9GZS0	605 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RNF170-208	ENST00000531440	TNMD	Q9H2S6	317 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RNF170-208	ENST00000531440	FBXL12	Q9NXK8	326 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RNF170-208	ENST00000531440	USP3	Q9Y6I4	520 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RNF170-208	ENST00000531440	DOPEY2	Q9Y3R5	2298 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RNF170-208	ENST00000531440		A0A1W2PR77	199 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RNF170-208	ENST00000531440	FAM47DP	A6NHR8	397 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RNF170-208	ENST00000531440	CLIC2	O15247	247 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RNF170-208	ENST00000531440	SLC28A2	O43868	658 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RNF170-208	ENST00000531440	RNASEH1	O60930	286 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RNF170-208	ENST00000531440	RPN1	P04843	607 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RNF170-208	ENST00000531440	HMBS	P08397	361 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RNF170-208	ENST00000531440	CSRP3	P50461	194 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RNF170-208	ENST00000531440	CCR5	P51681	352 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RNF170-208	ENST00000531440	NXPH1	P58417	271 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RNF170-208	ENST00000531440	ERVPABLB-1	P60509	514 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RNF170-208	ENST00000531440	CLDN10	P78369	228 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RNF170-208	ENST00000531440	VAC14	Q08AM6	782 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RNF170-208	ENST00000531440	LY6D	Q14210	128 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RNF170-208	ENST00000531440	NCEH1	Q6PIU2	408 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RNF170-208	ENST00000531440	KIAA0907	Q7Z7F0	614 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RNF170-208	ENST00000531440	ADIPOR2	Q86V24	386 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RNF170-208	ENST00000531440	ZNF557	Q8N988	423 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RNF170-208	ENST00000531440	GANC	Q8TET4	914 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RNF170-208	ENST00000531440	KCNE4	Q8WWG9	221 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RNF170-208	ENST00000531440	HPS3	Q969F9	1004 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RNF170-208	ENST00000531440	CPNE5	Q9HCH3	593 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RNF170-208	ENST00000531440	MARCH2	Q9P0N8	246 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RNF170-208	ENST00000531440	HMGXB4	Q9UGU5	601 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RNF170-208	ENST00000531440	GGA2	Q9UJY4	613 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RNF170-208	ENST00000531440	FZD4	Q9ULV1	537 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RNF170-208	ENST00000531440	AHCTF1	Q8WYP5	2266 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RNF170-208	ENST00000531440	C10orf142	B7Z368	130 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RNF170-208	ENST00000531440	TLR4	O00206	839 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RNF170-208	ENST00000531440	MAGEC1	O60732	1142 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RNF170-208	ENST00000531440	LATS1	O95835	1130 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RNF170-208	ENST00000531440	MT-CO3	P00414	261 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RNF170-208	ENST00000531440	C4BPA	P04003	597 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RNF170-208	ENST00000531440	PABPC1	P11940	636 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24

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