RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520276.5

TRPS1-211, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRPS1, Length 4,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-211ENST00000520276 AGPAT1Q99943 283 aa10.41□□□□□ -0.74
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TRPS1-211ENST00000520276 IMPG2Q9BZV3 1241 aa10.41□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP10.41□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 TPK1Q9H3S4 243 aa10.41□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa10.41□□□□□ -0.74
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TRPS1-211ENST00000520276 TIMM22Q9Y584 194 aa10.41□□□□□ -0.74
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TRPS1-211ENST00000520276 CRTAMO95727 393 aa10.41□□□□□ -0.74
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TRPS1-211ENST00000520276 TRIM49CP0CI26 452 aa10.41□□□□□ -0.74
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TRPS1-211ENST00000520276 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa10.41□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 AAGABQ6PD74 315 aa10.41□□□□□ -0.74
TRPS1-211ENST00000520276 ANO5Q75V66 913 aa10.41□□□□□ -0.74
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TRPS1-211ENST00000520276 ANKMY2Q8IV38 441 aa10.41□□□□□ -0.74
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TRPS1-211ENST00000520276 KLHDC9Q8NEP7 349 aa10.4□□□□□ -0.75
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP10.4□□□□□ -0.75
TRPS1-211ENST00000520276 CRYGNQ8WXF5 182 aa10.4□□□□□ -0.75
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TRPS1-211ENST00000520276 CCDC127Q96BQ5 260 aa10.4□□□□□ -0.75
TRPS1-211ENST00000520276 BTBD9Q96Q07 612 aa10.4□□□□□ -0.75
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