RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513069.1

SH3BP2-225, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 866 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-225ENST00000513069 SKILP12757 684 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP2-225ENST00000513069 NSFP46459 744 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
SH3BP2-225ENST00000513069 CXCR3P49682 368 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP2-225ENST00000513069 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
SH3BP2-225ENST00000513069 GSCP56915 257 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
SH3BP2-225ENST00000513069 RPS24P62847 133 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
SH3BP2-225ENST00000513069 NME3Q13232 169 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP2-225ENST00000513069 DMC1Q14565 340 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP2-225ENST00000513069 PPP2R5DQ14738 602 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP2-225ENST00000513069 ASIC2Q16515 512 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP2-225ENST00000513069 SLC25A52Q3SY17 297 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP2-225ENST00000513069 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
SH3BP2-225ENST00000513069 RAB6CQ53S08 254 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP2-225ENST00000513069 MS4A13Q5J8X5 152 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP2-225ENST00000513069 MPP7Q5T2T1 576 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP2-225ENST00000513069 ARTNQ5T4W7 220 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP2-225ENST00000513069 HGSNATQ68CP4 663 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP2-225ENST00000513069 TMEM215Q68D42 235 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP2-225ENST00000513069 ACAD10Q6JQN1 1059 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP2-225ENST00000513069 TMEM92Q6UXU6 159 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP2-225ENST00000513069 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
SH3BP2-225ENST00000513069 EMC1Q8N766 993 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP2-225ENST00000513069 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
SH3BP2-225ENST00000513069 MSANTD4Q8NCY6 345 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP2-225ENST00000513069 JOSD2Q8TAC2 188 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP2-225ENST00000513069 WFDC5Q8TCV5 224 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP2-225ENST00000513069 LMLNQ96KR4 655 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP2-225ENST00000513069 BTN2A3PQ96KV6 586 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP2-225ENST00000513069 ACOX2Q99424 681 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP2-225ENST00000513069 TBCBQ99426 244 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP2-225ENST00000513069 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
SH3BP2-225ENST00000513069 SLC2A11Q9BYW1 496 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP2-225ENST00000513069 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
SH3BP2-225ENST00000513069 RAB6CQ9H0N0 254 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP2-225ENST00000513069 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
SH3BP2-225ENST00000513069 RRN3Q9NYV6 651 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP2-225ENST00000513069 ADAM22Q9P0K1 906 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP2-225ENST00000513069 COX16Q9P0S2 106 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP2-225ENST00000513069 MMP17Q9ULZ9 603 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP2-225ENST00000513069 CAPN11Q9UMQ6 739 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP2-225ENST00000513069 USP34Q70CQ2 3546 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP2-225ENST00000513069 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP15.75■□□□□ 0.11
SH3BP2-225ENST00000513069 TBL1XO60907 577 aa15.75■□□□□ 0.11
SH3BP2-225ENST00000513069 ENDOD1O94919 500 aa15.75■□□□□ 0.11
SH3BP2-225ENST00000513069 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
SH3BP2-225ENST00000513069 ADCY5O95622 1261 aa15.75■□□□□ 0.11
SH3BP2-225ENST00000513069 APOEP02649 317 aa15.75■□□□□ 0.11
SH3BP2-225ENST00000513069 TNFAIP3P21580 790 aa15.75■□□□□ 0.11
SH3BP2-225ENST00000513069 HLA-FP30511 346 aa15.75■□□□□ 0.11
SH3BP2-225ENST00000513069 CCR1P32246 355 aa15.75■□□□□ 0.11
SH3BP2-225ENST00000513069 GBP1P32455 592 aa15.75■□□□□ 0.11
SH3BP2-225ENST00000513069 PXNP49023 591 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
SH3BP2-225ENST00000513069 FNTBP49356 437 aa15.75■□□□□ 0.11
SH3BP2-225ENST00000513069 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
SH3BP2-225ENST00000513069 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa15.75■□□□□ 0.11
SH3BP2-225ENST00000513069 RAP1GAP2Q684P5 730 aa15.75■□□□□ 0.11
SH3BP2-225ENST00000513069 DNAAF5Q86Y56 855 aa15.75■□□□□ 0.11
SH3BP2-225ENST00000513069 MCOLN2Q8IZK6 566 aa15.75■□□□□ 0.11
SH3BP2-225ENST00000513069 CFAP52Q8N1V2 620 aa15.75■□□□□ 0.11
SH3BP2-225ENST00000513069 CCDC26Q8TAB7 109 aa15.75■□□□□ 0.11
SH3BP2-225ENST00000513069 KCNV2Q8TDN2 545 aa15.75■□□□□ 0.11
SH3BP2-225ENST00000513069 CPLX3Q8WVH0 158 aa15.75■□□□□ 0.11
SH3BP2-225ENST00000513069 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
SH3BP2-225ENST00000513069 CFAP57Q96MR6 1250 aa15.75■□□□□ 0.11
SH3BP2-225ENST00000513069 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
SH3BP2-225ENST00000513069 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa15.75■□□□□ 0.11
SH3BP2-225ENST00000513069 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa15.75■□□□□ 0.11
SH3BP2-225ENST00000513069 ITIH6Q6UXX5 1313 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP2-225ENST00000513069 C2CD4BA6NLJ0 364 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP2-225ENST00000513069 HRO43593 1189 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP2-225ENST00000513069 SLC2A3P11169 496 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP2-225ENST00000513069 TACR2P21452 398 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP2-225ENST00000513069 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP15.74■□□□□ 0.11
SH3BP2-225ENST00000513069 SULT1E1P49888 294 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP2-225ENST00000513069 NRLP54845 237 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP2-225ENST00000513069 ZBED6P86452 979 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP2-225ENST00000513069 KLHL30Q0D2K2 578 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP2-225ENST00000513069 CRY1Q16526 586 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP2-225ENST00000513069 CCDC14Q49A88 953 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP2-225ENST00000513069 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP15.74■□□□□ 0.11
SH3BP2-225ENST00000513069 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP2-225ENST00000513069 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP2-225ENST00000513069 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
SH3BP2-225ENST00000513069 C14orf80Q86SX3 495 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP2-225ENST00000513069 LGI2Q8N0V4 545 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP2-225ENST00000513069 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP15.74■□□□□ 0.11
SH3BP2-225ENST00000513069 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP15.74■□□□□ 0.11
SH3BP2-225ENST00000513069 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP2-225ENST00000513069 RXFP2Q8WXD0 754 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP2-225ENST00000513069 ACDQ96AP0 544 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP2-225ENST00000513069 HHIPQ96QV1 700 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP2-225ENST00000513069 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
SH3BP2-225ENST00000513069 CD248Q9HCU0 757 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP2-225ENST00000513069 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP2-225ENST00000513069 SLC8A2Q9UPR5 921 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP2-225ENST00000513069 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP15.73■□□□□ 0.11
SH3BP2-225ENST00000513069 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa15.73■□□□□ 0.11
SH3BP2-225ENST00000513069 SIGLEC16A6NMB1 481 aa15.73■□□□□ 0.11
SH3BP2-225ENST00000513069 PAGE1O75459 146 aa15.73■□□□□ 0.11
SH3BP2-225ENST00000513069 CALB1P05937 261 aa15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.3 ms